RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482019.1

LINC02004-201, Transcript of long intergenic non-protein coding RNA 2004, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene LINC02004, Length 294 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC02004-201ENST00000482019 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP10.01□□□□□ -0.81
LINC02004-201ENST00000482019 FCRL4Q96PJ5 515 aa10.01□□□□□ -0.81
LINC02004-201ENST00000482019 EFHD1Q9BUP0 239 aa10.01□□□□□ -0.81
LINC02004-201ENST00000482019 ULBP3Q9BZM4 244 aa10.01□□□□□ -0.81
LINC02004-201ENST00000482019 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
LINC02004-201ENST00000482019 C1GALT1Q9NS00 363 aa10.01□□□□□ -0.81
LINC02004-201ENST00000482019 ASIC3Q9UHC3 531 aa10.01□□□□□ -0.81
LINC02004-201ENST00000482019 PCYOX1Q9UHG3 505 aa10.01□□□□□ -0.81
LINC02004-201ENST00000482019 PYCARDQ9ULZ3 195 aa10.01□□□□□ -0.81
LINC02004-201ENST00000482019 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa10.01□□□□□ -0.81
LINC02004-201ENST00000482019 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa10.01□□□□□ -0.81
LINC02004-201ENST00000482019 SAR1BQ9Y6B6 198 aa10.01□□□□□ -0.81
LINC02004-201ENST00000482019 GSAPA4D1B5 854 aa10□□□□□ -0.81
LINC02004-201ENST00000482019 CTAGE9A4FU28 777 aa10□□□□□ -0.81
LINC02004-201ENST00000482019 IQCF5A8MTL0 148 aa10□□□□□ -0.81
LINC02004-201ENST00000482019 H3BMM5 538 aa10□□□□□ -0.81
LINC02004-201ENST00000482019 GOLGA8MH3BSY2 632 aa10□□□□□ -0.81
LINC02004-201ENST00000482019 BTN3A3O00478 584 aa10□□□□□ -0.81
LINC02004-201ENST00000482019 BTN3A1O00481 513 aa10□□□□□ -0.81
LINC02004-201ENST00000482019 MAP3K7O43318 606 aa10□□□□□ -0.81
LINC02004-201ENST00000482019 GPC4O75487 556 aa10□□□□□ -0.81
LINC02004-201ENST00000482019 SLCO2B1O94956 709 aa10□□□□□ -0.81
LINC02004-201ENST00000482019 MT-ND3P03897 115 aa10□□□□□ -0.81
LINC02004-201ENST00000482019 EBLN1P0CF75 366 aa10□□□□□ -0.81
LINC02004-201ENST00000482019 LIFP15018 202 aa10□□□□□ -0.81
LINC02004-201ENST00000482019 FOLR1P15328 257 aa10□□□□□ -0.81
LINC02004-201ENST00000482019 CDH3P22223 829 aa10□□□□□ -0.81
LINC02004-201ENST00000482019 AOAHP28039 575 aa10□□□□□ -0.81
LINC02004-201ENST00000482019 PRDX3P30048 256 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
LINC02004-201ENST00000482019 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
LINC02004-201ENST00000482019 PRKG2Q13237 762 aa10□□□□□ -0.81
LINC02004-201ENST00000482019 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
LINC02004-201ENST00000482019 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa10□□□□□ -0.81
LINC02004-201ENST00000482019 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
LINC02004-201ENST00000482019 UNC5DQ6UXZ4 953 aa10□□□□□ -0.81
LINC02004-201ENST00000482019 NAPRTQ6XQN6 538 aa10□□□□□ -0.81
LINC02004-201ENST00000482019 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
LINC02004-201ENST00000482019 OTOAQ7RTW8 1153 aa10□□□□□ -0.81
LINC02004-201ENST00000482019 TIPARPQ7Z3E1 657 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
LINC02004-201ENST00000482019 PCGF5Q86SE9 256 aa10□□□□□ -0.81
LINC02004-201ENST00000482019 TMEM135Q86UB9 458 aa10□□□□□ -0.81
LINC02004-201ENST00000482019 CREG2Q8IUH2 290 aa10□□□□□ -0.81
LINC02004-201ENST00000482019 ADGRF3Q8IZF5 1079 aa10□□□□□ -0.81
LINC02004-201ENST00000482019 OR8K5Q8NH50 307 aa10□□□□□ -0.81
LINC02004-201ENST00000482019 GSDMBQ8TAX9 411 aa10□□□□□ -0.81
LINC02004-201ENST00000482019 LKAAEAR1Q8TD35 194 aa10□□□□□ -0.81
LINC02004-201ENST00000482019 LPGAT1Q92604 370 aa10□□□□□ -0.81
LINC02004-201ENST00000482019 TTC9Q92623 222 aa10□□□□□ -0.81
LINC02004-201ENST00000482019 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
LINC02004-201ENST00000482019 PITPNM3Q9BZ71 974 aa10□□□□□ -0.81
LINC02004-201ENST00000482019 GPN2Q9H9Y4 310 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
LINC02004-201ENST00000482019 SYTL2Q9HCH5 934 aa10□□□□□ -0.81
LINC02004-201ENST00000482019 FGF21Q9NSA1 209 aa10□□□□□ -0.81
LINC02004-201ENST00000482019 INTS10Q9NVR2 710 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
LINC02004-201ENST00000482019 SOHLH2Q9NX45 425 aa10□□□□□ -0.81
LINC02004-201ENST00000482019 OR6C2Q9NZP2 312 aa10□□□□□ -0.81
LINC02004-201ENST00000482019 RNF14Q9UBS8 474 aa10□□□□□ -0.81
LINC02004-201ENST00000482019 RARRES3Q9UL19 164 aa10□□□□□ -0.81
LINC02004-201ENST00000482019 ICKQ9UPZ9 632 aa10□□□□□ -0.81
LINC02004-201ENST00000482019 CDYLQ9Y232 598 aa10□□□□□ -0.81
LINC02004-201ENST00000482019 BTRCQ9Y297 605 aa10□□□□□ -0.81
LINC02004-201ENST00000482019 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa10□□□□□ -0.81
LINC02004-201ENST00000482019 NBEAQ8NFP9 2946 aa10□□□□□ -0.81
LINC02004-201ENST00000482019 PIPSLA2A3N6 862 aa9.99□□□□□ -0.81
LINC02004-201ENST00000482019 EIF4E1BA6NMX2 242 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
LINC02004-201ENST00000482019 GOLGA8KD6RF30 607 aa9.99□□□□□ -0.81
LINC02004-201ENST00000482019 GOLGA8TH3BQL2 631 aa9.99□□□□□ -0.81
LINC02004-201ENST00000482019 CCDC188H7C350 402 aa9.99□□□□□ -0.81
LINC02004-201ENST00000482019 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
LINC02004-201ENST00000482019 SPAG6O75602 509 aa9.99□□□□□ -0.81
LINC02004-201ENST00000482019 USP1O94782 785 aa9.99□□□□□ -0.81
LINC02004-201ENST00000482019 KIAA0754O94854 1291 aa9.99□□□□□ -0.81
LINC02004-201ENST00000482019 ESR1P03372 595 aa9.99□□□□□ -0.81
LINC02004-201ENST00000482019 ITGB2P05107 769 aa9.99□□□□□ -0.81
LINC02004-201ENST00000482019 MSL3P1P0C860 447 aa9.99□□□□□ -0.81
LINC02004-201ENST00000482019 ZNF28P17035 718 aa9.99□□□□□ -0.81
LINC02004-201ENST00000482019 WT1P19544 449 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
LINC02004-201ENST00000482019 STAT5AP42229 794 aa9.99□□□□□ -0.81
LINC02004-201ENST00000482019 PAFAH1B1P43034 410 aa9.99□□□□□ -0.81
LINC02004-201ENST00000482019 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
LINC02004-201ENST00000482019 TUBB4BP68371 445 aa9.99□□□□□ -0.81
LINC02004-201ENST00000482019 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
LINC02004-201ENST00000482019 TUBB2AQ13885 445 aa9.99□□□□□ -0.81
LINC02004-201ENST00000482019 KCNAB1Q14722 419 aa9.99□□□□□ -0.81
LINC02004-201ENST00000482019 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
LINC02004-201ENST00000482019 PLEKHS1Q5SXH7 462 aa9.99□□□□□ -0.81
LINC02004-201ENST00000482019 KIAA1614Q5VZ46 1190 aa9.99□□□□□ -0.81
LINC02004-201ENST00000482019 NEPROQ6NW34 567 aa9.99□□□□□ -0.81
LINC02004-201ENST00000482019 C6orf15Q6UXA7 325 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
LINC02004-201ENST00000482019 HOOK3Q86VS8 718 aa9.99□□□□□ -0.81
LINC02004-201ENST00000482019 CILP2Q8IUL8 1156 aa9.99□□□□□ -0.81
LINC02004-201ENST00000482019 VRK3Q8IV63 474 aa9.99□□□□□ -0.81
LINC02004-201ENST00000482019 DCUN1D3Q8IWE4 304 aa9.99□□□□□ -0.81
LINC02004-201ENST00000482019 LMNTD2Q8IXW0 634 aa9.99□□□□□ -0.81
LINC02004-201ENST00000482019 KRT222Q8N1A0 295 aa9.99□□□□□ -0.81
LINC02004-201ENST00000482019 SLC39A7Q92504 469 aa9.99□□□□□ -0.81
LINC02004-201ENST00000482019 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa9.99□□□□□ -0.81
LINC02004-201ENST00000482019 ELMO2Q96JJ3 720 aa9.99□□□□□ -0.81
LINC02004-201ENST00000482019 SLC45A3Q96JT2 553 aa9.99□□□□□ -0.81
LINC02004-201ENST00000482019 CAPZA3Q96KX2 299 aa9.99□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.1 ms