RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472398.5

TTC3-214, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 3, human

TSL 1 (best)

Gene TTC3, Length 2,305 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTC3-214	ENST00000472398	MC3R	P41968	323 aa		3.17	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	SLC1A4	P43007	532 aa		3.17	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	ARL4D	P49703	201 aa		3.17	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	TOB1	P50616	345 aa	Predicted RBP	3.17	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	EMP2	P54851	167 aa		3.17	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	DAOA	P59103	153 aa		3.17	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	PRPS1	P60891	318 aa		3.17	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	SRP54	P61011	504 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	GALK2	Q01415	458 aa		3.17	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	PPP3CA	Q08209	521 aa		3.17	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	MZT1	Q08AG7	82 aa		3.17	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	GRAP	Q13588	217 aa		3.17	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	CAMK1	Q14012	370 aa		3.17	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	FASTKD3	Q14CZ7	662 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	KCNMB1	Q16558	191 aa		3.17	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	ASTE1	Q2TB18	679 aa	Predicted RBP	3.17	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	UGT3A2	Q3SY77	523 aa		3.17	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	TEX35	Q5T0J7	233 aa		3.17	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	ANGEL2	Q5VTE6	544 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	LRFN4	Q6PJG9	635 aa		3.17	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	KIAA1324	Q6UXG2	1013 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	C4orf22	Q6V702	233 aa		3.17	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	FRMD7	Q6ZUT3	714 aa		3.17	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	KLB	Q86Z14	1044 aa		3.17	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	TBC1D10C	Q8IV04	446 aa		3.17	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	CCDC28A	Q8IWP9	274 aa		3.17	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	CLYBL	Q8N0X4	340 aa		3.17	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	LNX2	Q8N448	690 aa		3.17	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	FIBCD1	Q8N539	461 aa		3.17	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	CYB561A3	Q8NBI2	242 aa		3.17	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	OR5T1	Q8NG75	326 aa		3.17	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	OR56A3	Q8NH54	315 aa		3.17	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	COPS5	Q92905	334 aa		3.17	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	ST6GALNAC6	Q969X2	333 aa		3.17	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	LINGO1	Q96FE5	620 aa		3.17	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	ANKRD36BP1	Q96IX9	119 aa		3.17	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	ZNF48	Q96MX3	618 aa	Predicted RBP	3.17	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	DIRC2	Q96SL1	478 aa		3.17	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	RBM15	Q96T37	977 aa	Known RBP eCLIP	3.17	□□□□□ -1.9	2e-6	■■■■□ 22.5
TTC3-214	ENST00000472398	DSCC1	Q9BVC3	393 aa		3.17	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	NLN	Q9BYT8	704 aa		3.17	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	RACGAP1	Q9H0H5	632 aa		3.17	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	TP63	Q9H3D4	680 aa	Predicted RBP	3.17	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	GAL3ST2	Q9H3Q3	398 aa		3.17	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	GOLPH3L	Q9H4A5	285 aa		3.17	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	RGCC	Q9H4X1	137 aa		3.17	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	ANKRA2	Q9H9E1	313 aa		3.17	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	CCNB1IP1	Q9NPC3	277 aa		3.17	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	DMAP1	Q9NPF5	467 aa	Predicted RBP	3.17	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	CHST7	Q9NS84	486 aa		3.17	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	PLCXD1	Q9NUJ7	323 aa		3.17	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	ARMC1	Q9NVT9	282 aa		3.17	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	FBXL17	Q9UF56	701 aa		3.17	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	NARF	Q9UHQ1	456 aa		3.17	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	RAPGEFL1	Q9UHV5	662 aa		3.17	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	HAO1	Q9UJM8	370 aa		3.17	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	PPIE	Q9UNP9	301 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	MFHAS1	Q9Y4C4	1052 aa		3.17	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	PCDHA1	Q9Y5I3	950 aa		3.17	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	RAD54B	Q9Y620	910 aa		3.17	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	OOEP	A6NGQ2	149 aa		3.16	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	SYCE1L	A8MT33	242 aa		3.16	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	WASH4P	A8MWX3	477 aa		3.16	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	LINC00587	B1AMM8	73 aa		3.16	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	TMEM238	C9JI98	176 aa		3.16	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398		H3BQ06	376 aa	Predicted RBP	3.16	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	MEIS1	O00470	390 aa		3.16	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	CLOCK	O15516	846 aa		3.16	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	TULP3	O75386	442 aa		3.16	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	DHFR	P00374	187 aa		3.16	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	UGT2B4	P06133	528 aa		3.16	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	CAPN1	P07384	714 aa		3.16	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	PLEK	P08567	350 aa	Predicted RBP	3.16	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	C1S	P09871	688 aa		3.16	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	SBK2	P0C263	348 aa		3.16	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	SRC	P12931	536 aa		3.16	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	AKR1A1	P14550	325 aa		3.16	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	ZNF26	P17031	533 aa	Predicted RBP	3.16	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	SYT1	P21579	422 aa		3.16	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	PSMB6	P28072	239 aa		3.16	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	PRDX6	P30041	224 aa		3.16	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	HOXA7	P31268	230 aa	Predicted RBP	3.16	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	VIPR1	P32241	457 aa		3.16	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	CXCR5	P32302	372 aa		3.16	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	CDH5	P33151	784 aa	Predicted RBP	3.16	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	CD80	P33681	288 aa		3.16	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	DLST	P36957	453 aa		3.16	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	FDFT1	P37268	417 aa		3.16	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	CD79B	P40259	229 aa		3.16	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	CCT3	P49368	545 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	CARS	P49589	748 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	NDST2	P52849	883 aa		3.16	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	ITGA1	P56199	1179 aa		3.16	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	SLC6A3	Q01959	620 aa		3.16	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	DSC1	Q08554	894 aa		3.16	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	MALL	Q13021	153 aa		3.16	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	ETFDH	Q16134	617 aa		3.16	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	UGT8	Q16880	541 aa		3.16	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	LBH	Q53QV2	105 aa	Predicted RBP	3.16	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	C2CD6	Q53TS8	623 aa		3.16	□□□□□ -1.9

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