RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465425.1

SYNE4-204, Transcript of spectrin repeat containing nuclear envelope family member 4, humanhuman

TSL 2

Gene SYNE4, Length 2,339 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4-204ENST00000465425 TRIM46Q7Z4K8 759 aa17.95■□□□□ 0.46
SYNE4-204ENST00000465425 GALNT13Q8IUC8 556 aa17.95■□□□□ 0.46
SYNE4-204ENST00000465425 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP17.95■□□□□ 0.46
SYNE4-204ENST00000465425 ACDQ96AP0 544 aa17.95■□□□□ 0.46
SYNE4-204ENST00000465425 C19orf43Q9BQ61 176 aa17.95■□□□□ 0.46
SYNE4-204ENST00000465425 FAF1Q9UNN5 650 aaPredicted RBP17.95■□□□□ 0.46
SYNE4-204ENST00000465425 INVSQ9Y283 1065 aa17.95■□□□□ 0.46
SYNE4-204ENST00000465425 CPQQ9Y646 472 aa17.95■□□□□ 0.46
SYNE4-204ENST00000465425 EFEMP2O95967 443 aa17.94■□□□□ 0.46
SYNE4-204ENST00000465425 ENPP6Q6UWR7 440 aa17.94■□□□□ 0.46
SYNE4-204ENST00000465425 RNF165Q6ZSG1 346 aa17.94■□□□□ 0.46
SYNE4-204ENST00000465425 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP17.94■□□□□ 0.46
SYNE4-204ENST00000465425 ITIH5Q86UX2 942 aa17.94■□□□□ 0.46
SYNE4-204ENST00000465425 HOMEZQ8IX15 550 aa17.94■□□□□ 0.46
SYNE4-204ENST00000465425 NXPE1Q8N323 547 aa17.94■□□□□ 0.46
SYNE4-204ENST00000465425 UBTD2Q8WUN7 234 aa17.94■□□□□ 0.46
SYNE4-204ENST00000465425 SLC47A1Q96FL8 570 aa17.94■□□□□ 0.46
SYNE4-204ENST00000465425 OR52E6Q96RD3 313 aa17.94■□□□□ 0.46
SYNE4-204ENST00000465425 TBCDQ9BTW9 1192 aa17.94■□□□□ 0.46
SYNE4-204ENST00000465425 RDH14Q9HBH5 336 aa17.94■□□□□ 0.46
SYNE4-204ENST00000465425 CIDEBQ9UHD4 219 aa17.94■□□□□ 0.46
SYNE4-204ENST00000465425 MANBAO00462 879 aa17.94■□□□□ 0.46
SYNE4-204ENST00000465425 NOL3O60936 208 aaKnown RBP17.94■□□□□ 0.46
SYNE4-204ENST00000465425 ANXA5P08758 320 aa17.94■□□□□ 0.46
SYNE4-204ENST00000465425 BMP1P13497 986 aa17.94■□□□□ 0.46
SYNE4-204ENST00000465425 TCF3P15923 654 aa17.94■□□□□ 0.46
SYNE4-204ENST00000465425 ELK4P28324 431 aa17.94■□□□□ 0.46
SYNE4-204ENST00000465425 MBOAT1Q6ZNC8 495 aa17.94■□□□□ 0.46
SYNE4-204ENST00000465425 TPGS1Q6ZTW0 290 aa17.94■□□□□ 0.46
SYNE4-204ENST00000465425 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP17.94■□□□□ 0.46
SYNE4-204ENST00000465425 KRTCAP2Q8N6L1 136 aa17.94■□□□□ 0.46
SYNE4-204ENST00000465425 FAM86B1Q8N7N1 296 aa17.94■□□□□ 0.46
SYNE4-204ENST00000465425 PXYLP1Q8TE99 480 aa17.94■□□□□ 0.46
SYNE4-204ENST00000465425 MTFMTQ96DP5 389 aaKnown RBP17.94■□□□□ 0.46
SYNE4-204ENST00000465425 TNKS2Q9H2K2 1166 aa17.94■□□□□ 0.46
SYNE4-204ENST00000465425 CLMPQ9H6B4 373 aa17.94■□□□□ 0.46
SYNE4-204ENST00000465425 ACTR8Q9H981 624 aa17.94■□□□□ 0.46
SYNE4-204ENST00000465425 C1orf109Q9NX04 203 aa17.94■□□□□ 0.46
SYNE4-204ENST00000465425 DNAJB9Q9UBS3 223 aa17.94■□□□□ 0.46
SYNE4-204ENST00000465425 MAGED1Q9Y5V3 778 aaPredicted RBP17.94■□□□□ 0.46
SYNE4-204ENST00000465425 IGSF6O95976 241 aa17.93■□□□□ 0.46
SYNE4-204ENST00000465425 KRT6AP02538 564 aa17.93■□□□□ 0.46
SYNE4-204ENST00000465425 KRT6BP04259 564 aa17.93■□□□□ 0.46
SYNE4-204ENST00000465425 DCKP27707 260 aa17.93■□□□□ 0.46
SYNE4-204ENST00000465425 SERPINA4P29622 427 aa17.93■□□□□ 0.46
SYNE4-204ENST00000465425 NSG1P42857 185 aa17.93■□□□□ 0.46
SYNE4-204ENST00000465425 KRT6CP48668 564 aa17.93■□□□□ 0.46
SYNE4-204ENST00000465425 EPHB3P54753 998 aa17.93■□□□□ 0.46
SYNE4-204ENST00000465425 TPD52P55327 224 aaPredicted RBP17.93■□□□□ 0.46
SYNE4-204ENST00000465425 CTBSQ01459 385 aa17.93■□□□□ 0.46
SYNE4-204ENST00000465425 TXNDC8Q6A555 127 aa17.93■□□□□ 0.46
SYNE4-204ENST00000465425 NECAB2Q7Z6G3 386 aa17.93■□□□□ 0.46
SYNE4-204ENST00000465425 TMEM150AQ86TG1 271 aa17.93■□□□□ 0.46
SYNE4-204ENST00000465425 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP17.93■□□□□ 0.46
SYNE4-204ENST00000465425 CLHC1Q8NHS4 586 aa17.93■□□□□ 0.46
SYNE4-204ENST00000465425 NCLNQ969V3 563 aa17.93■□□□□ 0.46
SYNE4-204ENST00000465425 ASIC4Q96FT7 647 aa17.93■□□□□ 0.46
SYNE4-204ENST00000465425 OSBPL6Q9BZF3 934 aa17.93■□□□□ 0.46
SYNE4-204ENST00000465425 PARVBQ9HBI1 364 aa17.93■□□□□ 0.46
SYNE4-204ENST00000465425 PREBQ9HCU5 417 aa17.93■□□□□ 0.46
SYNE4-204ENST00000465425 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa17.93■□□□□ 0.46
SYNE4-204ENST00000465425 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP17.93■□□□□ 0.46
SYNE4-204ENST00000465425 AP3M1Q9Y2T2 418 aa17.93■□□□□ 0.46
SYNE4-204ENST00000465425 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa17.93■□□□□ 0.46
SYNE4-204ENST00000465425 H3BMQ9 156 aa17.93■□□□□ 0.46
SYNE4-204ENST00000465425 CXCR6O00574 342 aa17.93■□□□□ 0.46
SYNE4-204ENST00000465425 CLDN9O95484 217 aa17.93■□□□□ 0.46
SYNE4-204ENST00000465425 HPRP00739 348 aa17.93■□□□□ 0.46
SYNE4-204ENST00000465425 SOD2P04179 222 aa17.93■□□□□ 0.46
SYNE4-204ENST00000465425 EMP3P54852 163 aa17.93■□□□□ 0.46
SYNE4-204ENST00000465425 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP17.93■□□□□ 0.46
SYNE4-204ENST00000465425 DHRS4L2Q6PKH6 230 aa17.93■□□□□ 0.46
SYNE4-204ENST00000465425 GCNT7Q6ZNI0 430 aa17.93■□□□□ 0.46
SYNE4-204ENST00000465425 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa17.93■□□□□ 0.46
SYNE4-204ENST00000465425 C8orf59Q8N0T1 100 aaPredicted RBP17.93■□□□□ 0.46
SYNE4-204ENST00000465425 SLC22A17Q8WUG5 538 aa17.93■□□□□ 0.46
SYNE4-204ENST00000465425 THAP11Q96EK4 314 aa17.93■□□□□ 0.46
SYNE4-204ENST00000465425 AURKBQ96GD4 344 aaPredicted RBP17.93■□□□□ 0.46
SYNE4-204ENST00000465425 COG8Q96MW5 612 aa17.93■□□□□ 0.46
SYNE4-204ENST00000465425 ADNPQ9H2P0 1102 aa17.93■□□□□ 0.46
SYNE4-204ENST00000465425 IKZF5Q9H5V7 419 aa17.93■□□□□ 0.46
SYNE4-204ENST00000465425 ARL15Q9NXU5 204 aa17.93■□□□□ 0.46
SYNE4-204ENST00000465425 KCTD5Q9NXV2 234 aa17.93■□□□□ 0.46
SYNE4-204ENST00000465425 GALNT8Q9NY28 637 aa17.93■□□□□ 0.46
SYNE4-204ENST00000465425 GGT5P36269 586 aa17.92■□□□□ 0.46
SYNE4-204ENST00000465425 STT3AP46977 705 aa17.92■□□□□ 0.46
SYNE4-204ENST00000465425 RPIAP49247 311 aa17.92■□□□□ 0.46
SYNE4-204ENST00000465425 CCL23P55773 120 aa17.92■□□□□ 0.46
SYNE4-204ENST00000465425 ZXDBP98169 803 aa17.92■□□□□ 0.46
SYNE4-204ENST00000465425 EPS8Q12929 822 aa17.92■□□□□ 0.46
SYNE4-204ENST00000465425 CDKN3Q16667 212 aa17.92■□□□□ 0.46
SYNE4-204ENST00000465425 TTC23Q5W5X9 447 aa17.92■□□□□ 0.46
SYNE4-204ENST00000465425 ZNF773Q6PK81 442 aa17.92■□□□□ 0.46
SYNE4-204ENST00000465425 SUSD1Q6UWL2 747 aa17.92■□□□□ 0.46
SYNE4-204ENST00000465425 Q6ZNB5 142 aa17.92■□□□□ 0.46
SYNE4-204ENST00000465425 TMEM26Q6ZUK4 368 aa17.92■□□□□ 0.46
SYNE4-204ENST00000465425 THAP5Q7Z6K1 395 aa17.92■□□□□ 0.46
SYNE4-204ENST00000465425 TSPAN33Q86UF1 283 aa17.92■□□□□ 0.46
SYNE4-204ENST00000465425 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa17.92■□□□□ 0.46
SYNE4-204ENST00000465425 USP7Q93009 1102 aa17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.1 ms