RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439415.1

CBX1P4-201, Transcript of chromobox 1 pseudogene 4, humanhuman

BASIC

Gene CBX1P4, Length 457 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P4-201ENST00000439415 SLC38A9Q8NBW4 561 aa4.54□□□□□ -1.68
CBX1P4-201ENST00000439415 CSNK2A3Q8NEV1 391 aa4.54□□□□□ -1.68
CBX1P4-201ENST00000439415 OR2AJ1Q8NGZ0 328 aa4.54□□□□□ -1.68
CBX1P4-201ENST00000439415 CHURC1Q8WUH1 139 aa4.54□□□□□ -1.68
CBX1P4-201ENST00000439415 SLC5A11Q8WWX8 675 aa4.54□□□□□ -1.68
CBX1P4-201ENST00000439415 THRSPQ92748 146 aa4.54□□□□□ -1.68
CBX1P4-201ENST00000439415 ZNF503Q96F45 646 aa4.54□□□□□ -1.68
CBX1P4-201ENST00000439415 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa4.54□□□□□ -1.68
CBX1P4-201ENST00000439415 DTD2Q96FN9 168 aa4.54□□□□□ -1.68
CBX1P4-201ENST00000439415 CNDP1Q96KN2 507 aa4.54□□□□□ -1.68
CBX1P4-201ENST00000439415 SLC22A12Q96S37 553 aa4.54□□□□□ -1.68
CBX1P4-201ENST00000439415 SLC38A3Q99624 504 aa4.54□□□□□ -1.68
CBX1P4-201ENST00000439415 SLX1AQ9BQ83 275 aa4.54□□□□□ -1.68
CBX1P4-201ENST00000439415 C16orf70Q9BSU1 422 aa4.54□□□□□ -1.68
CBX1P4-201ENST00000439415 FNDC11Q9BVV2 318 aa4.54□□□□□ -1.68
CBX1P4-201ENST00000439415 KCNN2Q9H2S1 579 aa4.54□□□□□ -1.68
CBX1P4-201ENST00000439415 COX16Q9P0S2 106 aa4.54□□□□□ -1.68
CBX1P4-201ENST00000439415 GAGE2DQ9UEU5 116 aa4.54□□□□□ -1.68
CBX1P4-201ENST00000439415 UBQLN2Q9UHD9 624 aa4.54□□□□□ -1.68
CBX1P4-201ENST00000439415 DNPEPQ9ULA0 475 aa4.54□□□□□ -1.68
CBX1P4-201ENST00000439415 KCNK6Q9Y257 313 aa4.54□□□□□ -1.68
CBX1P4-201ENST00000439415 B3GALT5Q9Y2C3 310 aa4.54□□□□□ -1.68
CBX1P4-201ENST00000439415 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa4.54□□□□□ -1.68
CBX1P4-201ENST00000439415 CUX1P39880 1505 aa4.54□□□□□ -1.68
CBX1P4-201ENST00000439415 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.68
CBX1P4-201ENST00000439415 FAM149AA5PLN7 773 aa4.53□□□□□ -1.68
CBX1P4-201ENST00000439415 F8W810 466 aa4.53□□□□□ -1.68
CBX1P4-201ENST00000439415 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa4.53□□□□□ -1.68
CBX1P4-201ENST00000439415 AP3B1O00203 1094 aa4.53□□□□□ -1.68
CBX1P4-201ENST00000439415 FLRT2O43155 660 aa4.53□□□□□ -1.68
CBX1P4-201ENST00000439415 TSC22D2O75157 780 aa4.53□□□□□ -1.68
CBX1P4-201ENST00000439415 CXCL14O95715 111 aa4.53□□□□□ -1.68
CBX1P4-201ENST00000439415 PLGP00747 810 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.68
CBX1P4-201ENST00000439415 CSN3P07498 182 aa4.53□□□□□ -1.68
CBX1P4-201ENST00000439415 MYL6BP14649 208 aa4.53□□□□□ -1.68
CBX1P4-201ENST00000439415 PTGS2P35354 604 aa4.53□□□□□ -1.68
CBX1P4-201ENST00000439415 EIF2S3P41091 472 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
CBX1P4-201ENST00000439415 IER3P46695 156 aa4.53□□□□□ -1.68
CBX1P4-201ENST00000439415 PITPNBP48739 271 aa4.53□□□□□ -1.68
CBX1P4-201ENST00000439415 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
CBX1P4-201ENST00000439415 SULT1E1P49888 294 aa4.53□□□□□ -1.68
CBX1P4-201ENST00000439415 SMSP52788 366 aa4.53□□□□□ -1.68
CBX1P4-201ENST00000439415 TMPRSS3P57727 454 aa4.53□□□□□ -1.68
CBX1P4-201ENST00000439415 HSF1Q00613 529 aa4.53□□□□□ -1.68
CBX1P4-201ENST00000439415 PMP22Q01453 160 aa4.53□□□□□ -1.68
CBX1P4-201ENST00000439415 ARHGAP1Q07960 439 aa4.53□□□□□ -1.68
CBX1P4-201ENST00000439415 FOXM1Q08050 763 aa4.53□□□□□ -1.68
CBX1P4-201ENST00000439415 MRPL28Q13084 256 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
CBX1P4-201ENST00000439415 UBE2V1Q13404 147 aa4.53□□□□□ -1.68
CBX1P4-201ENST00000439415 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.68
CBX1P4-201ENST00000439415 EIF2S3LQ2VIR3 472 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
CBX1P4-201ENST00000439415 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.68
CBX1P4-201ENST00000439415 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
CBX1P4-201ENST00000439415 CCDC183Q5T5S1 534 aa4.53□□□□□ -1.68
CBX1P4-201ENST00000439415 FRG2Q64ET8 278 aa4.53□□□□□ -1.68
CBX1P4-201ENST00000439415 IRGCQ6NXR0 463 aa4.53□□□□□ -1.68
CBX1P4-201ENST00000439415 KCNV1Q6PIU1 500 aa4.53□□□□□ -1.68
CBX1P4-201ENST00000439415 WDR88Q6ZMY6 472 aa4.53□□□□□ -1.68
CBX1P4-201ENST00000439415 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa4.53□□□□□ -1.68
CBX1P4-201ENST00000439415 LPCAT2Q7L5N7 544 aa4.53□□□□□ -1.68
CBX1P4-201ENST00000439415 TAF8Q7Z7C8 310 aa4.53□□□□□ -1.68
CBX1P4-201ENST00000439415 ADAMTSL2Q86TH1 951 aa4.53□□□□□ -1.68
CBX1P4-201ENST00000439415 AQP12AQ8IXF9 295 aa4.53□□□□□ -1.68
CBX1P4-201ENST00000439415 KLHDC8AQ8IYD2 350 aa4.53□□□□□ -1.68
CBX1P4-201ENST00000439415 BHLHE22Q8NFJ8 381 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.68
CBX1P4-201ENST00000439415 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.68
CBX1P4-201ENST00000439415 HAS1Q92839 578 aa4.53□□□□□ -1.68
CBX1P4-201ENST00000439415 REPS1Q96D71 796 aa4.53□□□□□ -1.68
CBX1P4-201ENST00000439415 GRAMD2BQ96HH9 432 aa4.53□□□□□ -1.68
CBX1P4-201ENST00000439415 FAM81BQ96LP2 452 aa4.53□□□□□ -1.68
CBX1P4-201ENST00000439415 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa4.53□□□□□ -1.68
CBX1P4-201ENST00000439415 MYADMQ96S97 322 aa4.53□□□□□ -1.68
CBX1P4-201ENST00000439415 FAM213AQ9BRX8 229 aa4.53□□□□□ -1.68
CBX1P4-201ENST00000439415 ATG101Q9BSB4 218 aa4.53□□□□□ -1.68
CBX1P4-201ENST00000439415 ZNF577Q9BSK1 485 aa4.53□□□□□ -1.68
CBX1P4-201ENST00000439415 MSTO1Q9BUK6 570 aa4.53□□□□□ -1.68
CBX1P4-201ENST00000439415 B3GNT4Q9C0J1 378 aa4.53□□□□□ -1.68
CBX1P4-201ENST00000439415 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
CBX1P4-201ENST00000439415 RAB17Q9H0T7 212 aa4.53□□□□□ -1.68
CBX1P4-201ENST00000439415 DPAGT1Q9H3H5 408 aa4.53□□□□□ -1.68
CBX1P4-201ENST00000439415 WDR26Q9H7D7 661 aa4.53□□□□□ -1.68
CBX1P4-201ENST00000439415 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
CBX1P4-201ENST00000439415 SEBOXQ9HB31 216 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.68
CBX1P4-201ENST00000439415 MMP25Q9NPA2 562 aa4.53□□□□□ -1.68
CBX1P4-201ENST00000439415 SPAG4Q9NPE6 437 aa4.53□□□□□ -1.68
CBX1P4-201ENST00000439415 CENPMQ9NSP4 180 aa4.53□□□□□ -1.68
CBX1P4-201ENST00000439415 ATAD3AQ9NVI7 634 aa4.53□□□□□ -1.68
CBX1P4-201ENST00000439415 KLHL13Q9P2N7 655 aa4.53□□□□□ -1.68
CBX1P4-201ENST00000439415 NUDCQ9Y266 331 aa4.53□□□□□ -1.68
CBX1P4-201ENST00000439415 U3KQV3 271 aa4.53□□□□□ -1.68
CBX1P4-201ENST00000439415 KDRP35968 1356 aa4.53□□□□□ -1.69
CBX1P4-201ENST00000439415 UBE4BO95155 1302 aa4.52□□□□□ -1.69
CBX1P4-201ENST00000439415 CUL7Q14999 1698 aa4.52□□□□□ -1.69
CBX1P4-201ENST00000439415 A0A1B0GWJ7 208 aa4.52□□□□□ -1.69
CBX1P4-201ENST00000439415 ILVBLA1L0T0 632 aa4.52□□□□□ -1.69
CBX1P4-201ENST00000439415 NEMP2A6NFY4 417 aa4.52□□□□□ -1.69
CBX1P4-201ENST00000439415 F8WDY8 70 aa4.52□□□□□ -1.69
CBX1P4-201ENST00000439415 TLR4O00206 839 aa4.52□□□□□ -1.69
CBX1P4-201ENST00000439415 TEX28O15482 410 aa4.52□□□□□ -1.69
CBX1P4-201ENST00000439415 CLDN3O15551 220 aa4.52□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.3 ms