RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428120.5

FAAP20-209, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene FAAP20, Length 2,313 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-209ENST00000428120 ENO2P09104 434 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
FAAP20-209ENST00000428120 MPC1LP0DKB6 136 aa22.68■■□□□ 1.22
FAAP20-209ENST00000428120 ZFP36L2P47974 494 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
FAAP20-209ENST00000428120 YBX1P67809 324 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
FAAP20-209ENST00000428120 HMGCS1Q01581 520 aa22.68■■□□□ 1.22
FAAP20-209ENST00000428120 CAPRIN1Q14444 709 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
FAAP20-209ENST00000428120 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP22.68■■□□□ 1.22
FAAP20-209ENST00000428120 LRRC36Q1X8D7 754 aa22.68■■□□□ 1.22
FAAP20-209ENST00000428120 AP5B1Q2VPB7 878 aa22.68■■□□□ 1.22
FAAP20-209ENST00000428120 PTCHD3Q3KNS1 767 aa22.68■■□□□ 1.22
FAAP20-209ENST00000428120 RFTN2Q52LD8 501 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
FAAP20-209ENST00000428120 TMEM220Q6QAJ8 160 aa22.68■■□□□ 1.22
FAAP20-209ENST00000428120 DHDDSQ86SQ9 333 aa22.68■■□□□ 1.22
FAAP20-209ENST00000428120 FGF14Q92915 247 aa22.68■■□□□ 1.22
FAAP20-209ENST00000428120 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
FAAP20-209ENST00000428120 SPDL1Q96EA4 605 aa22.68■■□□□ 1.22
FAAP20-209ENST00000428120 TRIM8Q9BZR9 551 aa22.68■■□□□ 1.22
FAAP20-209ENST00000428120 SLC32A1Q9H598 525 aa22.68■■□□□ 1.22
FAAP20-209ENST00000428120 ACTR8Q9H981 624 aa22.68■■□□□ 1.22
FAAP20-209ENST00000428120 SLC52A3Q9NQ40 469 aa22.68■■□□□ 1.22
FAAP20-209ENST00000428120 DYRK4Q9NR20 520 aa22.68■■□□□ 1.22
FAAP20-209ENST00000428120 MCM8Q9UJA3 840 aa22.68■■□□□ 1.22
FAAP20-209ENST00000428120 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa22.67■■□□□ 1.22
FAAP20-209ENST00000428120 BBIP1A8MTZ0 92 aa22.67■■□□□ 1.22
FAAP20-209ENST00000428120 GFYI3L273 518 aa22.67■■□□□ 1.22
FAAP20-209ENST00000428120 MAP3K7O43318 606 aa22.67■■□□□ 1.22
FAAP20-209ENST00000428120 SLC22A3O75751 556 aa22.67■■□□□ 1.22
FAAP20-209ENST00000428120 WDR47O94967 919 aa22.67■■□□□ 1.22
FAAP20-209ENST00000428120 ITPKAP23677 461 aa22.67■■□□□ 1.22
FAAP20-209ENST00000428120 ELP6Q0PNE2 266 aa22.67■■□□□ 1.22
FAAP20-209ENST00000428120 AAK1Q2M2I8 961 aa22.67■■□□□ 1.22
FAAP20-209ENST00000428120 RAET1GQ6H3X3 334 aa22.67■■□□□ 1.22
FAAP20-209ENST00000428120 ANKRD54Q6NXT1 300 aa22.67■■□□□ 1.22
FAAP20-209ENST00000428120 TLDC1Q6P9B6 456 aa22.67■■□□□ 1.22
FAAP20-209ENST00000428120 PARM1Q6UWI2 310 aa22.67■■□□□ 1.22
FAAP20-209ENST00000428120 NRSN1Q8IZ57 195 aa22.67■■□□□ 1.22
FAAP20-209ENST00000428120 PPFIBP2Q8ND30 876 aa22.67■■□□□ 1.22
FAAP20-209ENST00000428120 NUS1Q96E22 293 aa22.67■■□□□ 1.22
FAAP20-209ENST00000428120 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
FAAP20-209ENST00000428120 NTMT1Q9BV86 223 aa22.67■■□□□ 1.22
FAAP20-209ENST00000428120 CNOT6Q9ULM6 557 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
FAAP20-209ENST00000428120 POLR3HQ9Y535 204 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
FAAP20-209ENST00000428120 ZFC3H1O60293 1989 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
FAAP20-209ENST00000428120 H0Y858 1186 aa22.66■■□□□ 1.22
FAAP20-209ENST00000428120 PSMD11O00231 422 aa22.66■■□□□ 1.22
FAAP20-209ENST00000428120 ACOT8O14734 319 aa22.66■■□□□ 1.22
FAAP20-209ENST00000428120 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
FAAP20-209ENST00000428120 G6PDP11413 515 aa22.66■■□□□ 1.22
FAAP20-209ENST00000428120 CYP2A7P20853 494 aa22.66■■□□□ 1.22
FAAP20-209ENST00000428120 IL12AP29459 219 aa22.66■■□□□ 1.22
FAAP20-209ENST00000428120 C8orf82Q6P1X6 216 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
FAAP20-209ENST00000428120 PPP2R3CQ969Q6 453 aa22.66■■□□□ 1.22
FAAP20-209ENST00000428120 PRSS16Q9NQE7 514 aa22.66■■□□□ 1.22
FAAP20-209ENST00000428120 ZNF490Q9ULM2 529 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
FAAP20-209ENST00000428120 SLC22A14Q9Y267 594 aa22.66■■□□□ 1.22
FAAP20-209ENST00000428120 ATG13O75143 517 aa22.66■■□□□ 1.22
FAAP20-209ENST00000428120 ULK1O75385 1050 aa22.66■■□□□ 1.22
FAAP20-209ENST00000428120 SLCO2B1O94956 709 aa22.66■■□□□ 1.22
FAAP20-209ENST00000428120 EBLN1P0CF75 366 aa22.66■■□□□ 1.22
FAAP20-209ENST00000428120 GDI1P31150 447 aa22.66■■□□□ 1.22
FAAP20-209ENST00000428120 KCNK10P57789 538 aa22.66■■□□□ 1.22
FAAP20-209ENST00000428120 RCAN2Q14206 197 aa22.66■■□□□ 1.22
FAAP20-209ENST00000428120 TIGD2Q4W5G0 525 aa22.66■■□□□ 1.22
FAAP20-209ENST00000428120 NEK5Q6P3R8 708 aa22.66■■□□□ 1.22
FAAP20-209ENST00000428120 MCOLN3Q8TDD5 553 aa22.66■■□□□ 1.22
FAAP20-209ENST00000428120 UCMAQ8WVF2 138 aa22.66■■□□□ 1.22
FAAP20-209ENST00000428120 TMEM159Q96B96 161 aa22.66■■□□□ 1.22
FAAP20-209ENST00000428120 ROPN1LQ96C74 230 aa22.66■■□□□ 1.22
FAAP20-209ENST00000428120 PPP1R16AQ96I34 528 aa22.66■■□□□ 1.22
FAAP20-209ENST00000428120 ASPDHA6ND91 283 aa22.65■■□□□ 1.22
FAAP20-209ENST00000428120 BCAS2O75934 225 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
FAAP20-209ENST00000428120 PSMC3P17980 439 aa22.65■■□□□ 1.22
FAAP20-209ENST00000428120 GGT5P36269 586 aa22.65■■□□□ 1.22
FAAP20-209ENST00000428120 CASP2P42575 452 aa22.65■■□□□ 1.22
FAAP20-209ENST00000428120 SOX9P48436 509 aa22.65■■□□□ 1.22
FAAP20-209ENST00000428120 PRLHRP49683 370 aa22.65■■□□□ 1.22
FAAP20-209ENST00000428120 RPL38P63173 70 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
FAAP20-209ENST00000428120 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa22.65■■□□□ 1.22
FAAP20-209ENST00000428120 IL23RQ5VWK5 629 aa22.65■■□□□ 1.22
FAAP20-209ENST00000428120 HACD2Q6Y1H2 254 aa22.65■■□□□ 1.22
FAAP20-209ENST00000428120 PROKR1Q8TCW9 393 aa22.65■■□□□ 1.22
FAAP20-209ENST00000428120 OR2AG1Q9H205 316 aa22.65■■□□□ 1.22
FAAP20-209ENST00000428120 TMEM181Q9P2C4 612 aa22.65■■□□□ 1.22
FAAP20-209ENST00000428120 CCL27Q9Y4X3 112 aa22.65■■□□□ 1.22
FAAP20-209ENST00000428120 CLDN9O95484 217 aa22.65■■□□□ 1.22
FAAP20-209ENST00000428120 SLC2A4P14672 509 aa22.65■■□□□ 1.22
FAAP20-209ENST00000428120 PDHA2P29803 388 aa22.65■■□□□ 1.22
FAAP20-209ENST00000428120 GPR1P46091 355 aa22.65■■□□□ 1.22
FAAP20-209ENST00000428120 CDKL1Q00532 357 aa22.65■■□□□ 1.22
FAAP20-209ENST00000428120 SP140Q13342 867 aa22.65■■□□□ 1.22
FAAP20-209ENST00000428120 CCSMST1Q4G0I0 132 aa22.65■■□□□ 1.22
FAAP20-209ENST00000428120 PDCD4Q53EL6 469 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
FAAP20-209ENST00000428120 EEF1AKMT2Q5JPI9 291 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
FAAP20-209ENST00000428120 EP400NLQ6ZTU2 488 aa22.65■■□□□ 1.22
FAAP20-209ENST00000428120 ERN2Q76MJ5 926 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
FAAP20-209ENST00000428120 CCM2Q9BSQ5 444 aa22.65■■□□□ 1.22
FAAP20-209ENST00000428120 TRPS1Q9UHF7 1281 aa22.65■■□□□ 1.22
FAAP20-209ENST00000428120 F5P12259 2224 aa22.64■■□□□ 1.22
FAAP20-209ENST00000428120 ARHGEF33A8MVX0 844 aa22.64■■□□□ 1.22
FAAP20-209ENST00000428120 FXYD1O00168 92 aa22.64■■□□□ 1.22
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