RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000425695.5

HTATSF1-202, Transcript of HIV-1 Tat specific factor 1, humanhuman

TSL 3

Gene HTATSF1, Length 885 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1-202ENST00000425695 PDIK1LQ8N165 341 aa24.3■■□□□ 1.48
HTATSF1-202ENST00000425695 RNF31Q96EP0 1072 aa24.3■■□□□ 1.48
HTATSF1-202ENST00000425695 TFB2MQ9H5Q4 396 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
HTATSF1-202ENST00000425695 PLAGL1Q9UM63 463 aa24.3■■□□□ 1.48
HTATSF1-202ENST00000425695 LHX6Q9UPM6 363 aa24.3■■□□□ 1.48
HTATSF1-202ENST00000425695 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa24.3■■□□□ 1.48
HTATSF1-202ENST00000425695 GSAPA4D1B5 854 aa24.29■■□□□ 1.48
HTATSF1-202ENST00000425695 BTN3A3O00478 584 aa24.29■■□□□ 1.48
HTATSF1-202ENST00000425695 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP24.29■■□□□ 1.48
HTATSF1-202ENST00000425695 CHRM3P20309 590 aa24.29■■□□□ 1.48
HTATSF1-202ENST00000425695 RPL21P46778 160 aaKnown RBP24.29■■□□□ 1.48
HTATSF1-202ENST00000425695 CRYMQ14894 314 aa24.29■■□□□ 1.48
HTATSF1-202ENST00000425695 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa24.29■■□□□ 1.48
HTATSF1-202ENST00000425695 BROXQ5VW32 411 aa24.29■■□□□ 1.48
HTATSF1-202ENST00000425695 AMIGO1Q86WK6 493 aa24.29■■□□□ 1.48
HTATSF1-202ENST00000425695 TBC1D21Q8IYX1 336 aa24.29■■□□□ 1.48
HTATSF1-202ENST00000425695 GSDMBQ8TAX9 411 aa24.29■■□□□ 1.48
HTATSF1-202ENST00000425695 KLHL6Q8WZ60 621 aa24.29■■□□□ 1.48
HTATSF1-202ENST00000425695 CFAP36Q96G28 342 aa24.29■■□□□ 1.48
HTATSF1-202ENST00000425695 PPM1MQ96MI6 270 aa24.29■■□□□ 1.48
HTATSF1-202ENST00000425695 DDA1Q9BW61 102 aa24.29■■□□□ 1.48
HTATSF1-202ENST00000425695 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa24.29■■□□□ 1.48
HTATSF1-202ENST00000425695 FBXO8Q9NRD0 319 aa24.29■■□□□ 1.48
HTATSF1-202ENST00000425695 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP24.29■■□□□ 1.48
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HTATSF1-202ENST00000425695 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP24.29■■□□□ 1.48
HTATSF1-202ENST00000425695 ACSL6Q9UKU0 697 aa24.29■■□□□ 1.48
HTATSF1-202ENST00000425695 SDK2Q58EX2 2172 aa24.28■■□□□ 1.48
HTATSF1-202ENST00000425695 BTN3A1O00481 513 aa24.28■■□□□ 1.48
HTATSF1-202ENST00000425695 POLR1CO15160 346 aaPredicted RBP24.28■■□□□ 1.48
HTATSF1-202ENST00000425695 SLCO2B1O94956 709 aa24.28■■□□□ 1.48
HTATSF1-202ENST00000425695 ESR1P03372 595 aa24.28■■□□□ 1.48
HTATSF1-202ENST00000425695 ERVK-10P10266 1014 aa24.28■■□□□ 1.48
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HTATSF1-202ENST00000425695 ELK3P41970 407 aa24.28■■□□□ 1.48
HTATSF1-202ENST00000425695 KPNA2P52292 529 aaKnown RBP24.28■■□□□ 1.48
HTATSF1-202ENST00000425695 RAB15P59190 212 aa24.28■■□□□ 1.48
HTATSF1-202ENST00000425695 CEACAM20Q6UY09 585 aa24.28■■□□□ 1.48
HTATSF1-202ENST00000425695 KCNMB4Q86W47 210 aa24.28■■□□□ 1.48
HTATSF1-202ENST00000425695 OR5K2Q8NHB8 316 aa24.28■■□□□ 1.48
HTATSF1-202ENST00000425695 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP24.28■■□□□ 1.48
HTATSF1-202ENST00000425695 UBXN4Q92575 508 aa24.28■■□□□ 1.48
HTATSF1-202ENST00000425695 ELMO2Q96JJ3 720 aa24.28■■□□□ 1.48
HTATSF1-202ENST00000425695 OR6C1Q96RD1 312 aa24.28■■□□□ 1.48
HTATSF1-202ENST00000425695 B3GNT4Q9C0J1 378 aa24.28■■□□□ 1.48
HTATSF1-202ENST00000425695 DPH5Q9H2P9 285 aa24.28■■□□□ 1.48
HTATSF1-202ENST00000425695 INTS10Q9NVR2 710 aaKnown RBP24.28■■□□□ 1.48
HTATSF1-202ENST00000425695 GALPQ9UBC7 116 aa24.28■■□□□ 1.48
HTATSF1-202ENST00000425695 CIDEBQ9UHD4 219 aa24.28■■□□□ 1.48
HTATSF1-202ENST00000425695 POLG2Q9UHN1 485 aa24.28■■□□□ 1.48
HTATSF1-202ENST00000425695 RALYQ9UKM9 306 aaKnown RBP24.28■■□□□ 1.48
HTATSF1-202ENST00000425695 ICKQ9UPZ9 632 aa24.28■■□□□ 1.48
HTATSF1-202ENST00000425695 CHMP2BQ9UQN3 213 aa24.28■■□□□ 1.48
HTATSF1-202ENST00000425695 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa24.28■■□□□ 1.48
HTATSF1-202ENST00000425695 LAMA5O15230 3695 aa24.28■■□□□ 1.48
HTATSF1-202ENST00000425695 TLCD2A6NGC4 264 aa24.27■■□□□ 1.48
HTATSF1-202ENST00000425695 KPNA5O15131 536 aa24.27■■□□□ 1.48
HTATSF1-202ENST00000425695 RAD51CO43502 376 aa24.27■■□□□ 1.48
HTATSF1-202ENST00000425695 NELFEP18615 380 aaKnown RBP24.27■■□□□ 1.48
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HTATSF1-202ENST00000425695 KCNAB1Q14722 419 aa24.27■■□□□ 1.48
HTATSF1-202ENST00000425695 MAATS1Q7Z4T9 603 aa24.27■■□□□ 1.48
HTATSF1-202ENST00000425695 CALML6Q8TD86 181 aa24.27■■□□□ 1.48
HTATSF1-202ENST00000425695 ZNF592Q92610 1267 aa24.27■■□□□ 1.48
HTATSF1-202ENST00000425695 CD180Q99467 661 aa24.27■■□□□ 1.48
HTATSF1-202ENST00000425695 FBXO5Q9UKT4 447 aa24.27■■□□□ 1.48
HTATSF1-202ENST00000425695 ITPR1Q14643 2758 aa24.26■■□□□ 1.47
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HTATSF1-202ENST00000425695 FAM187AA6NFU0 413 aa24.26■■□□□ 1.47
HTATSF1-202ENST00000425695 E5RI56 91 aa24.26■■□□□ 1.47
HTATSF1-202ENST00000425695 H3BMM5 538 aa24.26■■□□□ 1.47
HTATSF1-202ENST00000425695 SMAPO00193 183 aa24.26■■□□□ 1.47
HTATSF1-202ENST00000425695 URI1O94763 535 aaPredicted RBP24.26■■□□□ 1.47
HTATSF1-202ENST00000425695 TTC4O95801 387 aa24.26■■□□□ 1.47
HTATSF1-202ENST00000425695 TPBGLP0DKB5 382 aa24.26■■□□□ 1.47
HTATSF1-202ENST00000425695 LIPCP11150 499 aa24.26■■□□□ 1.47
HTATSF1-202ENST00000425695 CD82P27701 267 aa24.26■■□□□ 1.47
HTATSF1-202ENST00000425695 ADARP55265 1226 aaKnown RBP24.26■■□□□ 1.47
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HTATSF1-202ENST00000425695 HIF1AQ16665 826 aa24.26■■□□□ 1.47
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HTATSF1-202ENST00000425695 PLEKHS1Q5SXH7 462 aa24.26■■□□□ 1.47
HTATSF1-202ENST00000425695 UNC5AQ6ZN44 842 aa24.26■■□□□ 1.47
HTATSF1-202ENST00000425695 ANKMY2Q8IV38 441 aa24.26■■□□□ 1.47
HTATSF1-202ENST00000425695 SPNS2Q8IVW8 549 aa24.26■■□□□ 1.47
HTATSF1-202ENST00000425695 ADGRF3Q8IZF5 1079 aa24.26■■□□□ 1.47
HTATSF1-202ENST00000425695 SIDT2Q8NBJ9 832 aaKnown RBP24.26■■□□□ 1.47
HTATSF1-202ENST00000425695 ERP44Q9BS26 406 aa24.26■■□□□ 1.47
HTATSF1-202ENST00000425695 NAT9Q9BTE0 207 aa24.26■■□□□ 1.47
HTATSF1-202ENST00000425695 CPNE5Q9HCH3 593 aa24.26■■□□□ 1.47
HTATSF1-202ENST00000425695 SEMA5BQ9P283 1151 aa24.26■■□□□ 1.47
HTATSF1-202ENST00000425695 RUVBL2Q9Y230 463 aaKnown RBP24.26■■□□□ 1.47
HTATSF1-202ENST00000425695 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa24.26■■□□□ 1.47
HTATSF1-202ENST00000425695 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa24.25■■□□□ 1.47
HTATSF1-202ENST00000425695 TP73O15350 636 aa24.25■■□□□ 1.47
HTATSF1-202ENST00000425695 HAUS5O94927 633 aa24.25■■□□□ 1.47
HTATSF1-202ENST00000425695 CDH3P22223 829 aa24.25■■□□□ 1.47
HTATSF1-202ENST00000425695 CXADRP78310 365 aa24.25■■□□□ 1.47
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