RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000416538.5

UBXN4-203, Transcript of UBX domain protein 4, humanhuman

TSL 5

Gene UBXN4, Length 1,255 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4-203ENST00000416538 TFB2MQ9H5Q4 396 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
UBXN4-203ENST00000416538 LZTFL1Q9NQ48 299 aa14.65□□□□□ -0.06
UBXN4-203ENST00000416538 ZNF71Q9NQZ8 489 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
UBXN4-203ENST00000416538 MARCH4Q9P2E8 410 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
UBXN4-203ENST00000416538 TUBD1Q9UJT1 453 aa14.65□□□□□ -0.06
UBXN4-203ENST00000416538 ZNF148Q9UQR1 794 aa14.65□□□□□ -0.06
UBXN4-203ENST00000416538 TCAF1Q9Y4C2 921 aa14.65□□□□□ -0.06
UBXN4-203ENST00000416538 HEMK1Q9Y5R4 338 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
UBXN4-203ENST00000416538 HEATR9A2RTY3 570 aa14.64□□□□□ -0.07
UBXN4-203ENST00000416538 CDC14CA4D256 554 aa14.64□□□□□ -0.07
UBXN4-203ENST00000416538 ARHGAP6O43182 974 aa14.64□□□□□ -0.07
UBXN4-203ENST00000416538 CREG1O75629 220 aa14.64□□□□□ -0.07
UBXN4-203ENST00000416538 SCRG1O75711 98 aa14.64□□□□□ -0.07
UBXN4-203ENST00000416538 SFTPCP11686 197 aa14.64□□□□□ -0.07
UBXN4-203ENST00000416538 PRDX3P30048 256 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
UBXN4-203ENST00000416538 PEBP1P30086 187 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
UBXN4-203ENST00000416538 ARL4DP49703 201 aa14.64□□□□□ -0.07
UBXN4-203ENST00000416538 CRADDP78560 199 aa14.64□□□□□ -0.07
UBXN4-203ENST00000416538 KRT33BQ14525 404 aa14.64□□□□□ -0.07
UBXN4-203ENST00000416538 ZIC1Q15915 447 aa14.64□□□□□ -0.07
UBXN4-203ENST00000416538 ARMC6Q6NXE6 501 aa14.64□□□□□ -0.07
UBXN4-203ENST00000416538 AFTPHQ6ULP2 937 aa14.64□□□□□ -0.07
UBXN4-203ENST00000416538 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa14.64□□□□□ -0.07
UBXN4-203ENST00000416538 TMEM126BQ8IUX1 230 aa14.64□□□□□ -0.07
UBXN4-203ENST00000416538 CARFQ8N187 725 aa14.64□□□□□ -0.07
UBXN4-203ENST00000416538 LMNTD1Q8N9Z9 388 aa14.64□□□□□ -0.07
UBXN4-203ENST00000416538 ABHD17AQ96GS6 310 aa14.64□□□□□ -0.07
UBXN4-203ENST00000416538 FCRL4Q96PJ5 515 aa14.64□□□□□ -0.07
UBXN4-203ENST00000416538 TRIM55Q9BYV6 548 aa14.64□□□□□ -0.07
UBXN4-203ENST00000416538 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
UBXN4-203ENST00000416538 EPN3Q9H201 632 aa14.64□□□□□ -0.07
UBXN4-203ENST00000416538 MVB12BQ9H7P6 319 aa14.64□□□□□ -0.07
UBXN4-203ENST00000416538 VPS37BQ9H9H4 285 aa14.64□□□□□ -0.07
UBXN4-203ENST00000416538 LATS2Q9NRM7 1088 aa14.64□□□□□ -0.07
UBXN4-203ENST00000416538 C1GALT1Q9NS00 363 aa14.64□□□□□ -0.07
UBXN4-203ENST00000416538 SPHK1Q9NYA1 384 aa14.64□□□□□ -0.07
UBXN4-203ENST00000416538 ACTR10Q9NZ32 417 aa14.64□□□□□ -0.07
UBXN4-203ENST00000416538 PADI1Q9ULC6 663 aa14.64□□□□□ -0.07
UBXN4-203ENST00000416538 RIMKLBQ9ULI2 386 aa14.64□□□□□ -0.07
UBXN4-203ENST00000416538 PLAGL1Q9UM63 463 aa14.64□□□□□ -0.07
UBXN4-203ENST00000416538 CDYLQ9Y232 598 aa14.64□□□□□ -0.07
UBXN4-203ENST00000416538 HEATR5BQ9P2D3 2071 aa14.63□□□□□ -0.07
UBXN4-203ENST00000416538 IQCF5A8MTL0 148 aa14.63□□□□□ -0.07
UBXN4-203ENST00000416538 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
UBXN4-203ENST00000416538 LIN7AO14910 233 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
UBXN4-203ENST00000416538 CPNE3O75131 537 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
UBXN4-203ENST00000416538 DNAJB5O75953 348 aa14.63□□□□□ -0.07
UBXN4-203ENST00000416538 PDGFAP04085 211 aa14.63□□□□□ -0.07
UBXN4-203ENST00000416538 APRTP07741 180 aa14.63□□□□□ -0.07
UBXN4-203ENST00000416538 CTSBP07858 339 aa14.63□□□□□ -0.07
UBXN4-203ENST00000416538 RORAP35398 523 aa14.63□□□□□ -0.07
UBXN4-203ENST00000416538 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
UBXN4-203ENST00000416538 GSDMDP57764 484 aa14.63□□□□□ -0.07
UBXN4-203ENST00000416538 MC1RQ01726 317 aa14.63□□□□□ -0.07
UBXN4-203ENST00000416538 RPS6KA1Q15418 735 aa14.63□□□□□ -0.07
UBXN4-203ENST00000416538 PLEKHS1Q5SXH7 462 aa14.63□□□□□ -0.07
UBXN4-203ENST00000416538 CPZQ66K79 652 aa14.63□□□□□ -0.07
UBXN4-203ENST00000416538 FAM198BQ6UWH4 519 aa14.63□□□□□ -0.07
UBXN4-203ENST00000416538 ATG14Q6ZNE5 492 aa14.63□□□□□ -0.07
UBXN4-203ENST00000416538 CDHR3Q6ZTQ4 885 aa14.63□□□□□ -0.07
UBXN4-203ENST00000416538 AMIGO1Q86WK6 493 aa14.63□□□□□ -0.07
UBXN4-203ENST00000416538 C9orf43Q8TAL5 461 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
UBXN4-203ENST00000416538 APOBEC4Q8WW27 367 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
UBXN4-203ENST00000416538 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa14.63□□□□□ -0.07
UBXN4-203ENST00000416538 CHST8Q9H2A9 424 aa14.63□□□□□ -0.07
UBXN4-203ENST00000416538 FAM60AQ9NP50 221 aa14.63□□□□□ -0.07
UBXN4-203ENST00000416538 TP53TG5Q9Y2B4 290 aa14.63□□□□□ -0.07
UBXN4-203ENST00000416538 SHANK1Q9Y566 2161 aa14.63□□□□□ -0.07
UBXN4-203ENST00000416538 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa14.62□□□□□ -0.07
UBXN4-203ENST00000416538 C21orf140B9A014 251 aa14.62□□□□□ -0.07
UBXN4-203ENST00000416538 TMEM150CB9EJG8 249 aa14.62□□□□□ -0.07
UBXN4-203ENST00000416538 H3BMH7 237 aa14.62□□□□□ -0.07
UBXN4-203ENST00000416538 MATN2O00339 956 aa14.62□□□□□ -0.07
UBXN4-203ENST00000416538 WISP1O95388 367 aa14.62□□□□□ -0.07
UBXN4-203ENST00000416538 FTH1P02794 183 aa14.62□□□□□ -0.07
UBXN4-203ENST00000416538 MT-ND3P03897 115 aa14.62□□□□□ -0.07
UBXN4-203ENST00000416538 CAPN1P07384 714 aa14.62□□□□□ -0.07
UBXN4-203ENST00000416538 GSTM1P09488 218 aa14.62□□□□□ -0.07
UBXN4-203ENST00000416538 UGT2B7P16662 529 aa14.62□□□□□ -0.07
UBXN4-203ENST00000416538 ADRA1DP25100 572 aa14.62□□□□□ -0.07
UBXN4-203ENST00000416538 ARNTP27540 789 aa14.62□□□□□ -0.07
UBXN4-203ENST00000416538 CCR7P32248 378 aa14.62□□□□□ -0.07
UBXN4-203ENST00000416538 KCNJ1P48048 391 aa14.62□□□□□ -0.07
UBXN4-203ENST00000416538 GABRA4P48169 554 aa14.62□□□□□ -0.07
UBXN4-203ENST00000416538 GSTM4Q03013 218 aa14.62□□□□□ -0.07
UBXN4-203ENST00000416538 TLE1Q04724 770 aa14.62□□□□□ -0.07
UBXN4-203ENST00000416538 PRKAA1Q13131 559 aa14.62□□□□□ -0.07
UBXN4-203ENST00000416538 DEFB110Q30KQ9 67 aa14.62□□□□□ -0.07
UBXN4-203ENST00000416538 CYB5D1Q6P9G0 228 aa14.62□□□□□ -0.07
UBXN4-203ENST00000416538 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
UBXN4-203ENST00000416538 SPESP1Q6UW49 350 aa14.62□□□□□ -0.07
UBXN4-203ENST00000416538 UNC5AQ6ZN44 842 aa14.62□□□□□ -0.07
UBXN4-203ENST00000416538 ZNF662Q6ZS27 426 aa14.62□□□□□ -0.07
UBXN4-203ENST00000416538 MENTQ9BUN1 341 aa14.62□□□□□ -0.07
UBXN4-203ENST00000416538 CHRAC1Q9NRG0 131 aa14.62□□□□□ -0.07
UBXN4-203ENST00000416538 KCND1Q9NSA2 647 aa14.62□□□□□ -0.07
UBXN4-203ENST00000416538 TREX1Q9NSU2 369 aa14.62□□□□□ -0.07
UBXN4-203ENST00000416538 PCMTD2Q9NV79 361 aa14.62□□□□□ -0.07
UBXN4-203ENST00000416538 PAK5Q9P286 719 aa14.62□□□□□ -0.07
UBXN4-203ENST00000416538 CIDEBQ9UHD4 219 aa14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.7 ms