RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000405546.7

ATG4B-206, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene ATG4B, Length 3,294 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-206ENST00000405546 CCDC103Q8IW40 242 aa14.76□□□□□ -0.05
ATG4B-206ENST00000405546 FAM86B1Q8N7N1 296 aa14.76□□□□□ -0.05
ATG4B-206ENST00000405546 BIRC7Q96CA5 298 aa14.76□□□□□ -0.05
ATG4B-206ENST00000405546 ITPKCQ96DU7 683 aa14.76□□□□□ -0.05
ATG4B-206ENST00000405546 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP14.76□□□□□ -0.058e-7■■□□□ 13.8
ATG4B-206ENST00000405546 NLE1Q9NVX2 485 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
ATG4B-206ENST00000405546 PCDH10Q9P2E7 1040 aa14.76□□□□□ -0.05
ATG4B-206ENST00000405546 NOTOA8MTQ0 251 aa14.76□□□□□ -0.05
ATG4B-206ENST00000405546 K7ERQ8 282 aa14.76□□□□□ -0.05
ATG4B-206ENST00000405546 PRRG1O14668 218 aa14.76□□□□□ -0.05
ATG4B-206ENST00000405546 COCHO43405 550 aa14.76□□□□□ -0.05
ATG4B-206ENST00000405546 EPOP01588 193 aa14.76□□□□□ -0.05
ATG4B-206ENST00000405546 KLKB1P03952 638 aa14.76□□□□□ -0.05
ATG4B-206ENST00000405546 TMBIM6P55061 237 aa14.76□□□□□ -0.05
ATG4B-206ENST00000405546 GALNT1Q10472 559 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
ATG4B-206ENST00000405546 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
ATG4B-206ENST00000405546 DPY19L1Q2PZI1 675 aa14.76□□□□□ -0.05
ATG4B-206ENST00000405546 SPESP1Q6UW49 350 aa14.76□□□□□ -0.05
ATG4B-206ENST00000405546 CLHC1Q8NHS4 586 aa14.76□□□□□ -0.05
ATG4B-206ENST00000405546 ULK4Q96C45 1275 aa14.76□□□□□ -0.05
ATG4B-206ENST00000405546 C17orf80Q9BSJ5 609 aa14.76□□□□□ -0.05
ATG4B-206ENST00000405546 CIPCQ9C0C6 399 aa14.76□□□□□ -0.05
ATG4B-206ENST00000405546 CLPBQ9H078 707 aa14.76□□□□□ -0.05
ATG4B-206ENST00000405546 MYO7AQ13402 2215 aa14.76□□□□□ -0.05
ATG4B-206ENST00000405546 TRIM64CA6NLI5 447 aa14.76□□□□□ -0.05
ATG4B-206ENST00000405546 FXYD1O00168 92 aa14.76□□□□□ -0.05
ATG4B-206ENST00000405546 SEC14L2O76054 403 aa14.76□□□□□ -0.05
ATG4B-206ENST00000405546 HTR1AP08908 422 aa14.76□□□□□ -0.05
ATG4B-206ENST00000405546 ENO2P09104 434 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
ATG4B-206ENST00000405546 ATF6P18850 670 aa14.76□□□□□ -0.05
ATG4B-206ENST00000405546 MAGEA11P43364 429 aa14.76□□□□□ -0.05
ATG4B-206ENST00000405546 CDH4P55283 916 aa14.76□□□□□ -0.05
ATG4B-206ENST00000405546 SLC14A2Q15849 920 aa14.76□□□□□ -0.05
ATG4B-206ENST00000405546 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP14.76□□□□□ -0.059e-11■■□□□ 13.2
ATG4B-206ENST00000405546 ARTNQ5T4W7 220 aa14.76□□□□□ -0.05
ATG4B-206ENST00000405546 ADAMTS16Q8TE57 1224 aa14.76□□□□□ -0.05
ATG4B-206ENST00000405546 FIG4Q92562 907 aa14.76□□□□□ -0.05
ATG4B-206ENST00000405546 MYOCQ99972 504 aa14.76□□□□□ -0.05
ATG4B-206ENST00000405546 BBS2Q9BXC9 721 aa14.76□□□□□ -0.05
ATG4B-206ENST00000405546 DERL2Q9GZP9 239 aa14.76□□□□□ -0.05
ATG4B-206ENST00000405546 C6orf62Q9GZU0 229 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
ATG4B-206ENST00000405546 TMEM161AQ9NX61 479 aa14.76□□□□□ -0.05
ATG4B-206ENST00000405546 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
ATG4B-206ENST00000405546 C2orf78A6NCI8 922 aa14.75□□□□□ -0.05
ATG4B-206ENST00000405546 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
ATG4B-206ENST00000405546 CLDN11O75508 207 aa14.75□□□□□ -0.05
ATG4B-206ENST00000405546 SEC24AO95486 1093 aa14.75□□□□□ -0.05
ATG4B-206ENST00000405546 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
ATG4B-206ENST00000405546 HTR6P50406 440 aa14.75□□□□□ -0.05
ATG4B-206ENST00000405546 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
ATG4B-206ENST00000405546 KCNC4Q03721 635 aa14.75□□□□□ -0.05
ATG4B-206ENST00000405546 CTU2Q2VPK5 515 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
ATG4B-206ENST00000405546 ADPRMQ3LIE5 342 aa14.75□□□□□ -0.05
ATG4B-206ENST00000405546 KANK2Q63ZY3 851 aa14.75□□□□□ -0.05
ATG4B-206ENST00000405546 TPGS1Q6ZTW0 290 aa14.75□□□□□ -0.05
ATG4B-206ENST00000405546 LRRC8DQ7L1W4 858 aa14.75□□□□□ -0.05
ATG4B-206ENST00000405546 AKAP14Q86UN6 197 aa14.75□□□□□ -0.05
ATG4B-206ENST00000405546 RHEBL1Q8TAI7 183 aa14.75□□□□□ -0.05
ATG4B-206ENST00000405546 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP14.75□□□□□ -0.051e-7■■■■■ 43.2
ATG4B-206ENST00000405546 ASB8Q9H765 288 aa14.75□□□□□ -0.05
ATG4B-206ENST00000405546 INTS10Q9NVR2 710 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
ATG4B-206ENST00000405546 TBC1D14Q9P2M4 693 aa14.75□□□□□ -0.05
ATG4B-206ENST00000405546 MOSPD1Q9UJG1 213 aa14.75□□□□□ -0.05
ATG4B-206ENST00000405546 POLR3HQ9Y535 204 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
ATG4B-206ENST00000405546 BBIP1A8MTZ0 92 aa14.75□□□□□ -0.05
ATG4B-206ENST00000405546 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
ATG4B-206ENST00000405546 HS6ST1O60243 411 aa14.75□□□□□ -0.05
ATG4B-206ENST00000405546 ABCB7O75027 752 aa14.75□□□□□ -0.05
ATG4B-206ENST00000405546 PRAMEF12O95522 483 aa14.75□□□□□ -0.05
ATG4B-206ENST00000405546 PPP2R2DQ66LE6 453 aa14.75□□□□□ -0.05
ATG4B-206ENST00000405546 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa14.75□□□□□ -0.05
ATG4B-206ENST00000405546 SLC16A12Q6ZSM3 486 aa14.75□□□□□ -0.05
ATG4B-206ENST00000405546 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
ATG4B-206ENST00000405546 FAM83FQ8NEG4 500 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
ATG4B-206ENST00000405546 CDC26Q8NHZ8 85 aa14.75□□□□□ -0.05
ATG4B-206ENST00000405546 FRS2Q8WU20 508 aa14.75□□□□□ -0.05
ATG4B-206ENST00000405546 WBP2Q969T9 261 aa14.75□□□□□ -0.05
ATG4B-206ENST00000405546 NCLNQ969V3 563 aa14.75□□□□□ -0.05
ATG4B-206ENST00000405546 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
ATG4B-206ENST00000405546 MLYCDO95822 493 aa14.74□□□□□ -0.05
ATG4B-206ENST00000405546 FGF4P08620 206 aa14.74□□□□□ -0.05
ATG4B-206ENST00000405546 UROSP10746 265 aa14.74□□□□□ -0.05
ATG4B-206ENST00000405546 TRPC1P48995 793 aa14.74□□□□□ -0.05
ATG4B-206ENST00000405546 IL5RAQ01344 420 aa14.74□□□□□ -0.05
ATG4B-206ENST00000405546 EPS8Q12929 822 aa14.74□□□□□ -0.05
ATG4B-206ENST00000405546 PRKG2Q13237 762 aa14.74□□□□□ -0.05
ATG4B-206ENST00000405546 ARHGEF7Q14155 803 aa14.74□□□□□ -0.05
ATG4B-206ENST00000405546 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
ATG4B-206ENST00000405546 AP5B1Q2VPB7 878 aa14.74□□□□□ -0.05
ATG4B-206ENST00000405546 PLEKHG7Q6ZR37 379 aa14.74□□□□□ -0.05
ATG4B-206ENST00000405546 ANKS3Q6ZW76 656 aa14.74□□□□□ -0.05
ATG4B-206ENST00000405546 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
ATG4B-206ENST00000405546 IPPKQ9H8X2 491 aa14.74□□□□□ -0.05
ATG4B-206ENST00000405546 TRIM39Q9HCM9 518 aa14.74□□□□□ -0.05
ATG4B-206ENST00000405546 TLR9Q9NR96 1032 aa14.74□□□□□ -0.05
ATG4B-206ENST00000405546 SDR39U1Q9NRG7 319 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
ATG4B-206ENST00000405546 A0A1W2PP18 115 aa14.74□□□□□ -0.05
ATG4B-206ENST00000405546 H7C4K7 107 aa14.74□□□□□ -0.05
ATG4B-206ENST00000405546 FADS2O95864 444 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
ATG4B-206ENST00000405546 G6PDP11413 515 aa14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.5 ms