RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000382998.8

CTIF-202, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CTIF, Length 4,407 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-202ENST00000382998 RPF2Q9H7B2 306 aaKnown RBP13.5□□□□□ -0.25
CTIF-202ENST00000382998 PPIEQ9UNP9 301 aaKnown RBP13.5□□□□□ -0.25
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CTIF-202ENST00000382998 LY86O95711 162 aa13.5□□□□□ -0.25
CTIF-202ENST00000382998 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa13.5□□□□□ -0.25
CTIF-202ENST00000382998 TSPAN7P41732 249 aa13.5□□□□□ -0.25
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CTIF-202ENST00000382998 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP13.5□□□□□ -0.25
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CTIF-202ENST00000382998 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP13.49□□□□□ -0.25
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CTIF-202ENST00000382998 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP13.48□□□□□ -0.25
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CTIF-202ENST00000382998 RGS13O14921 159 aa13.48□□□□□ -0.25
CTIF-202ENST00000382998 CIDEAO60543 219 aa13.48□□□□□ -0.25
CTIF-202ENST00000382998 RLN2P04090 185 aa13.48□□□□□ -0.25
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CTIF-202ENST00000382998 ITGA1P56199 1179 aa13.48□□□□□ -0.25
CTIF-202ENST00000382998 RALGPS1Q5JS13 557 aa13.48□□□□□ -0.25
CTIF-202ENST00000382998 LDLRAD1Q5T700 205 aa13.48□□□□□ -0.25
CTIF-202ENST00000382998 KHDRBS2Q5VWX1 349 aaKnown RBP13.48□□□□□ -0.25
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