RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366554.2

OPN3-201, Transcript of opsin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene OPN3, Length 2,620 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN3-201ENST00000366554 SCELO95171 688 aa21.35■■□□□ 1.01
OPN3-201ENST00000366554 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
OPN3-201ENST00000366554 PRIM2P49643 509 aa21.35■■□□□ 1.01
OPN3-201ENST00000366554 FAM214AQ32MH5 1076 aa21.35■■□□□ 1.01
OPN3-201ENST00000366554 DCAF15Q66K64 600 aa21.35■■□□□ 1.01
OPN3-201ENST00000366554 KDM4DQ6B0I6 523 aa21.35■■□□□ 1.01
OPN3-201ENST00000366554 ZMIZ2Q8NF64 920 aa21.35■■□□□ 1.01
OPN3-201ENST00000366554 GTF2H4Q92759 462 aa21.35■■□□□ 1.01
OPN3-201ENST00000366554 Q96MT0 163 aa21.35■■□□□ 1.01
OPN3-201ENST00000366554 FSD1LQ9BXM9 530 aa21.35■■□□□ 1.01
OPN3-201ENST00000366554 IKZF5Q9H5V7 419 aa21.35■■□□□ 1.01
OPN3-201ENST00000366554 NARFLQ9H6Q4 476 aa21.35■■□□□ 1.01
OPN3-201ENST00000366554 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
OPN3-201ENST00000366554 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
OPN3-201ENST00000366554 ELOVL7A1L3X0 281 aa21.35■■□□□ 1.01
OPN3-201ENST00000366554 FADS2P1A8MWK0 482 aa21.35■■□□□ 1.01
OPN3-201ENST00000366554 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
OPN3-201ENST00000366554 EPHA2P29317 976 aa21.35■■□□□ 1.01
OPN3-201ENST00000366554 DGKQP52824 942 aa21.35■■□□□ 1.01
OPN3-201ENST00000366554 IRF3Q14653 427 aa21.35■■□□□ 1.01
OPN3-201ENST00000366554 NOMO2Q5JPE7 1267 aa21.35■■□□□ 1.01
OPN3-201ENST00000366554 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
OPN3-201ENST00000366554 EFCAB12Q6NXP0 572 aa21.35■■□□□ 1.01
OPN3-201ENST00000366554 SYVN1Q86TM6 617 aa21.35■■□□□ 1.01
OPN3-201ENST00000366554 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa21.35■■□□□ 1.01
OPN3-201ENST00000366554 LSM14AQ8ND56 463 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
OPN3-201ENST00000366554 RETP07949 1114 aa21.34■■□□□ 1.01
OPN3-201ENST00000366554 MSH3P20585 1137 aa21.34■■□□□ 1.01
OPN3-201ENST00000366554 FDXRP22570 491 aa21.34■■□□□ 1.01
OPN3-201ENST00000366554 PLIN5Q00G26 463 aa21.34■■□□□ 1.01
OPN3-201ENST00000366554 KCTD2Q14681 263 aa21.34■■□□□ 1.01
OPN3-201ENST00000366554 KYAT1Q16773 422 aa21.34■■□□□ 1.01
OPN3-201ENST00000366554 SLC43A3Q8NBI5 491 aa21.34■■□□□ 1.01
OPN3-201ENST00000366554 SLC30A2Q9BRI3 323 aa21.34■■□□□ 1.01
OPN3-201ENST00000366554 RASSF1Q9NS23 344 aa21.34■■□□□ 1.01
OPN3-201ENST00000366554 RGS18Q9NS28 235 aa21.34■■□□□ 1.01
OPN3-201ENST00000366554 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa21.34■■□□□ 1.01
OPN3-201ENST00000366554 UROSP10746 265 aa21.34■■□□□ 1.01
OPN3-201ENST00000366554 CA5AP35218 305 aa21.34■■□□□ 1.01
OPN3-201ENST00000366554 HNF4AP41235 474 aa21.34■■□□□ 1.01
OPN3-201ENST00000366554 LAPTM4AQ15012 233 aa21.34■■□□□ 1.01
OPN3-201ENST00000366554 TBCEQ15813 527 aaPredicted RBP21.34■■□□□ 1.01
OPN3-201ENST00000366554 SYCE2Q6PIF2 218 aa21.34■■□□□ 1.01
OPN3-201ENST00000366554 GPR149Q86SP6 731 aa21.34■■□□□ 1.01
OPN3-201ENST00000366554 OR8H2Q8N162 312 aa21.34■■□□□ 1.01
OPN3-201ENST00000366554 TTC29Q8NA56 475 aaPredicted RBP21.34■■□□□ 1.01
OPN3-201ENST00000366554 ZFAND1Q8TCF1 268 aa21.34■■□□□ 1.01
OPN3-201ENST00000366554 OR51E2Q9H255 320 aa21.34■■□□□ 1.01
OPN3-201ENST00000366554 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa21.34■■□□□ 1.01
OPN3-201ENST00000366554 A0A096LPI6 279 aa21.33■■□□□ 1.01
OPN3-201ENST00000366554 CPNE3O75131 537 aaKnown RBP21.33■■□□□ 1.01
OPN3-201ENST00000366554 CCNCP24863 283 aa21.33■■□□□ 1.01
OPN3-201ENST00000366554 C21orf33P30042 268 aaPredicted RBP21.33■■□□□ 1.01
OPN3-201ENST00000366554 HOXA9P31269 272 aa21.33■■□□□ 1.01
OPN3-201ENST00000366554 IL1RL1Q01638 556 aa21.33■■□□□ 1.01
OPN3-201ENST00000366554 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP21.33■■□□□ 1.01
OPN3-201ENST00000366554 FBXO48Q5FWF7 155 aa21.33■■□□□ 1.01
OPN3-201ENST00000366554 ANKS6Q68DC2 871 aa21.33■■□□□ 1.01
OPN3-201ENST00000366554 CEP68Q76N32 757 aa21.33■■□□□ 1.01
OPN3-201ENST00000366554 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP21.33■■□□□ 1.01
OPN3-201ENST00000366554 LIX1LQ8IVB5 337 aa21.33■■□□□ 1.01
OPN3-201ENST00000366554 APH1BQ8WW43 257 aa21.33■■□□□ 1.01
OPN3-201ENST00000366554 HEBP1Q9NRV9 189 aa21.33■■□□□ 1.01
OPN3-201ENST00000366554 OR12D3Q9UGF7 316 aa21.33■■□□□ 1.01
OPN3-201ENST00000366554 NUFIP1Q9UHK0 495 aaKnown RBP21.33■■□□□ 1.01
OPN3-201ENST00000366554 CRYL1Q9Y2S2 319 aa21.33■■□□□ 1.01
OPN3-201ENST00000366554 LCTP09848 1927 aa21.33■■□□□ 1.01
OPN3-201ENST00000366554 MEN1O00255 615 aa21.33■■□□□ 1
OPN3-201ENST00000366554 PCDHGA12O60330 932 aa21.33■■□□□ 1
OPN3-201ENST00000366554 ZNF37AP17032 561 aaPredicted RBP21.33■■□□□ 1
OPN3-201ENST00000366554 NRIP1P48552 1158 aa21.33■■□□□ 1
OPN3-201ENST00000366554 CARD16Q5EG05 197 aa21.33■■□□□ 1
OPN3-201ENST00000366554 TJAP1Q5JTD0 557 aa21.33■■□□□ 1
OPN3-201ENST00000366554 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP21.33■■□□□ 1
OPN3-201ENST00000366554 ZNF549Q6P9A3 640 aa21.33■■□□□ 1
OPN3-201ENST00000366554 METTL7BQ6UX53 244 aa21.33■■□□□ 1
OPN3-201ENST00000366554 Q6ZSR9 355 aa21.33■■□□□ 1
OPN3-201ENST00000366554 DNASE1L2Q92874 299 aa21.33■■□□□ 1
OPN3-201ENST00000366554 THUMPD3Q9BV44 507 aaKnown RBP21.33■■□□□ 1
OPN3-201ENST00000366554 TFB2MQ9H5Q4 396 aaKnown RBP21.33■■□□□ 1
OPN3-201ENST00000366554 MARCH4Q9P2E8 410 aaPredicted RBP21.33■■□□□ 1
OPN3-201ENST00000366554 RECQL5O94762 991 aaPredicted RBP21.32■■□□□ 1
OPN3-201ENST00000366554 RPS17P08708 135 aaKnown RBP21.32■■□□□ 1
OPN3-201ENST00000366554 NAGAP17050 411 aa21.32■■□□□ 1
OPN3-201ENST00000366554 CTRB1P17538 263 aa21.32■■□□□ 1
OPN3-201ENST00000366554 IL1RNP18510 177 aa21.32■■□□□ 1
OPN3-201ENST00000366554 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP21.32■■□□□ 1
OPN3-201ENST00000366554 ESCO2Q56NI9 601 aa21.32■■□□□ 1
OPN3-201ENST00000366554 CTRB2Q6GPI1 263 aa21.32■■□□□ 1
OPN3-201ENST00000366554 PAF1Q8N7H5 531 aa21.32■■□□□ 1
OPN3-201ENST00000366554 TBC1D20Q96BZ9 403 aa21.32■■□□□ 1
OPN3-201ENST00000366554 SLITRK5O94991 958 aa21.32■■□□□ 1
OPN3-201ENST00000366554 CYP4F3Q08477 520 aa21.32■■□□□ 1
OPN3-201ENST00000366554 CYP4Z2PQ8N1L4 340 aa21.32■■□□□ 1
OPN3-201ENST00000366554 FLCNQ8NFG4 579 aa21.32■■□□□ 1
OPN3-201ENST00000366554 SLC39A13Q96H72 371 aa21.32■■□□□ 1
OPN3-201ENST00000366554 COPS4Q9BT78 406 aa21.32■■□□□ 1
OPN3-201ENST00000366554 TBCDQ9BTW9 1192 aa21.32■■□□□ 1
OPN3-201ENST00000366554 TEX13BQ9BXU2 312 aa21.32■■□□□ 1
OPN3-201ENST00000366554 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.5 ms