RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000325599.12

SHQ1-201, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SHQ1, Length 2,879 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-201ENST00000325599 CRLS1Q9UJA2 301 aa16.05■□□□□ 0.16
SHQ1-201ENST00000325599 OARD1Q9Y530 152 aa16.05■□□□□ 0.16
SHQ1-201ENST00000325599 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa16.05■□□□□ 0.16
SHQ1-201ENST00000325599 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
SHQ1-201ENST00000325599 PITPNM1O00562 1244 aa16.04■□□□□ 0.16
SHQ1-201ENST00000325599 BMP10O95393 424 aa16.04■□□□□ 0.16
SHQ1-201ENST00000325599 UMPSP11172 480 aa16.04■□□□□ 0.16
SHQ1-201ENST00000325599 ITGALP20701 1170 aa16.04■□□□□ 0.16
SHQ1-201ENST00000325599 ACRV1P26436 265 aa16.04■□□□□ 0.16
SHQ1-201ENST00000325599 GPRC6AQ5T6X5 926 aa16.04■□□□□ 0.16
SHQ1-201ENST00000325599 RFLNAQ6ZTI6 216 aa16.04■□□□□ 0.16
SHQ1-201ENST00000325599 PROSER1Q86XN7 944 aa16.04■□□□□ 0.16
SHQ1-201ENST00000325599 RIMKLAQ8IXN7 391 aa16.04■□□□□ 0.16
SHQ1-201ENST00000325599 DHRSXQ8N5I4 330 aa16.04■□□□□ 0.16
SHQ1-201ENST00000325599 ZBTB2Q8N680 514 aa16.04■□□□□ 0.16
SHQ1-201ENST00000325599 CLHC1Q8NHS4 586 aa16.04■□□□□ 0.16
SHQ1-201ENST00000325599 RHBDF1Q96CC6 855 aa16.04■□□□□ 0.16
SHQ1-201ENST00000325599 ZNF583Q96ND8 569 aa16.04■□□□□ 0.16
SHQ1-201ENST00000325599 HEPHQ9BQS7 1158 aa16.04■□□□□ 0.16
SHQ1-201ENST00000325599 CD244Q9BZW8 370 aa16.04■□□□□ 0.16
SHQ1-201ENST00000325599 TBCCD1Q9NVR7 557 aa16.04■□□□□ 0.16
SHQ1-201ENST00000325599 DOCK6Q96HP0 2047 aa16.04■□□□□ 0.16
SHQ1-201ENST00000325599 GLYATL1P3A0A0U1RQE8 302 aa16.04■□□□□ 0.16
SHQ1-201ENST00000325599 LOC730098B7Z3J9 87 aa16.04■□□□□ 0.16
SHQ1-201ENST00000325599 ARNTLO00327 626 aa16.04■□□□□ 0.16
SHQ1-201ENST00000325599 GFRA2O00451 464 aa16.04■□□□□ 0.16
SHQ1-201ENST00000325599 ZNF821O75541 412 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
SHQ1-201ENST00000325599 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP16.04■□□□□ 0.16
SHQ1-201ENST00000325599 RGS4P49798 205 aa16.04■□□□□ 0.16
SHQ1-201ENST00000325599 CYP4F8P98187 520 aa16.04■□□□□ 0.16
SHQ1-201ENST00000325599 PWP1Q13610 501 aa16.04■□□□□ 0.16
SHQ1-201ENST00000325599 FAM174BQ3ZCQ3 159 aa16.04■□□□□ 0.16
SHQ1-201ENST00000325599 DGKKQ5KSL6 1271 aa16.04■□□□□ 0.16
SHQ1-201ENST00000325599 BPIFB1Q8TDL5 484 aa16.04■□□□□ 0.16
SHQ1-201ENST00000325599 LATS2Q9NRM7 1088 aa16.04■□□□□ 0.16
SHQ1-201ENST00000325599 OPTCQ9UBM4 332 aa16.04■□□□□ 0.16
SHQ1-201ENST00000325599 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
SHQ1-201ENST00000325599 NUP214P35658 2090 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
SHQ1-201ENST00000325599 MICAL3Q7RTP6 2002 aa16.03■□□□□ 0.16
SHQ1-201ENST00000325599 NPPAP01160 153 aa16.03■□□□□ 0.16
SHQ1-201ENST00000325599 SOD2P04179 222 aa16.03■□□□□ 0.16
SHQ1-201ENST00000325599 TCF3P15923 654 aa16.03■□□□□ 0.16
SHQ1-201ENST00000325599 DGKAP23743 735 aa16.03■□□□□ 0.16
SHQ1-201ENST00000325599 CAPGP40121 348 aa16.03■□□□□ 0.16
SHQ1-201ENST00000325599 CDK9P50750 372 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
SHQ1-201ENST00000325599 ANKDD1AQ495B1 522 aa16.03■□□□□ 0.16
SHQ1-201ENST00000325599 Q6ZNB5 142 aa16.03■□□□□ 0.16
SHQ1-201ENST00000325599 GPR26Q8NDV2 337 aa16.03■□□□□ 0.16
SHQ1-201ENST00000325599 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa16.03■□□□□ 0.16
SHQ1-201ENST00000325599 EBF1Q9UH73 591 aa16.03■□□□□ 0.16
SHQ1-201ENST00000325599 FAM32AQ9Y421 112 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
SHQ1-201ENST00000325599 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
SHQ1-201ENST00000325599 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
SHQ1-201ENST00000325599 JAK1P23458 1154 aa16.03■□□□□ 0.16
SHQ1-201ENST00000325599 CD70P32970 193 aa16.03■□□□□ 0.16
SHQ1-201ENST00000325599 STK19P49842 368 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
SHQ1-201ENST00000325599 NOGQ13253 232 aa16.03■□□□□ 0.16
SHQ1-201ENST00000325599 SPANXN4Q5MJ08 99 aa16.03■□□□□ 0.16
SHQ1-201ENST00000325599 TPGS2Q68CL5 300 aa16.03■□□□□ 0.16
SHQ1-201ENST00000325599 RETSATQ6NUM9 610 aa16.03■□□□□ 0.16
SHQ1-201ENST00000325599 Q6ZNX1 250 aa16.03■□□□□ 0.16
SHQ1-201ENST00000325599 LIX1Q8N485 282 aa16.03■□□□□ 0.16
SHQ1-201ENST00000325599 OR10A6Q8NH74 314 aa16.03■□□□□ 0.16
SHQ1-201ENST00000325599 FIG4Q92562 907 aa16.03■□□□□ 0.16
SHQ1-201ENST00000325599 CENPOQ9BU64 300 aa16.03■□□□□ 0.16
SHQ1-201ENST00000325599 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
SHQ1-201ENST00000325599 NDEL1Q9GZM8 345 aa16.03■□□□□ 0.16
SHQ1-201ENST00000325599 CREBZFQ9NS37 354 aa16.03■□□□□ 0.16
SHQ1-201ENST00000325599 THEGQ9P2T0 379 aa16.03■□□□□ 0.16
SHQ1-201ENST00000325599 UTS2RQ9UKP6 389 aa16.03■□□□□ 0.16
SHQ1-201ENST00000325599 ZNF490Q9ULM2 529 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
SHQ1-201ENST00000325599 A0A087WXM4 84 aa16.02■□□□□ 0.16
SHQ1-201ENST00000325599 H0Y858 1186 aa16.02■□□□□ 0.16
SHQ1-201ENST00000325599 UPK1AO00322 258 aa16.02■□□□□ 0.16
SHQ1-201ENST00000325599 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
SHQ1-201ENST00000325599 IST1P53990 364 aa16.02■□□□□ 0.16
SHQ1-201ENST00000325599 LMAN2Q12907 356 aa16.02■□□□□ 0.16
SHQ1-201ENST00000325599 ARHGEF7Q14155 803 aa16.02■□□□□ 0.16
SHQ1-201ENST00000325599 GTDC1Q4AE62 458 aa16.02■□□□□ 0.16
SHQ1-201ENST00000325599 SUSD1Q6UWL2 747 aa16.02■□□□□ 0.16
SHQ1-201ENST00000325599 CLVS1Q8IUQ0 354 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
SHQ1-201ENST00000325599 BBS7Q8IWZ6 715 aa16.02■□□□□ 0.16
SHQ1-201ENST00000325599 ITFG1Q8TB96 612 aa16.02■□□□□ 0.16
SHQ1-201ENST00000325599 SLC13A3Q8WWT9 602 aa16.02■□□□□ 0.16
SHQ1-201ENST00000325599 GTF2H4Q92759 462 aa16.02■□□□□ 0.16
SHQ1-201ENST00000325599 PPP3R2Q96LZ3 170 aa16.02■□□□□ 0.16
SHQ1-201ENST00000325599 TBCDQ9BTW9 1192 aa16.02■□□□□ 0.16
SHQ1-201ENST00000325599 THUMPD3Q9BV44 507 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
SHQ1-201ENST00000325599 HIPK3Q9H422 1215 aa16.02■□□□□ 0.16
SHQ1-201ENST00000325599 IL21Q9HBE4 155 aa16.02■□□□□ 0.16
SHQ1-201ENST00000325599 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
SHQ1-201ENST00000325599 MAGEL2Q9UJ55 1249 aa16.02■□□□□ 0.16
SHQ1-201ENST00000325599 OBSL1O75147 1896 aa16.02■□□□□ 0.15
SHQ1-201ENST00000325599 TRBV5-4A0A0C4DH59 114 aa16.02■□□□□ 0.15
SHQ1-201ENST00000325599 SEC22BO75396 215 aa16.02■□□□□ 0.15
SHQ1-201ENST00000325599 CDH1P12830 882 aa16.02■□□□□ 0.15
SHQ1-201ENST00000325599 DMPKQ09013 629 aa16.02■□□□□ 0.15
SHQ1-201ENST00000325599 NKG7Q16617 165 aa16.02■□□□□ 0.15
SHQ1-201ENST00000325599 LRRC73Q5JTD7 316 aa16.02■□□□□ 0.15
SHQ1-201ENST00000325599 ENPP6Q6UWR7 440 aa16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.6 ms