RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298454.3

VSTM4-201, Transcript of V-set and transmembrane domain containing 4, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene VSTM4, Length 2,170 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM4-201ENST00000298454 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
VSTM4-201ENST00000298454 GULP1Q9UBP9 304 aa22.24■■□□□ 1.15
VSTM4-201ENST00000298454 GSTM1P09488 218 aa22.23■■□□□ 1.15
VSTM4-201ENST00000298454 EBLN1P0CF75 366 aa22.23■■□□□ 1.15
VSTM4-201ENST00000298454 TIE1P35590 1138 aa22.23■■□□□ 1.15
VSTM4-201ENST00000298454 SESN3P58005 492 aa22.23■■□□□ 1.15
VSTM4-201ENST00000298454 ERVK-8P63133 956 aa22.23■■□□□ 1.15
VSTM4-201ENST00000298454 GSTM4Q03013 218 aa22.23■■□□□ 1.15
VSTM4-201ENST00000298454 CEACAM7Q14002 265 aa22.23■■□□□ 1.15
VSTM4-201ENST00000298454 PTCHD3Q3KNS1 767 aa22.23■■□□□ 1.15
VSTM4-201ENST00000298454 ATP6AP1LQ52LC2 224 aa22.23■■□□□ 1.15
VSTM4-201ENST00000298454 TCAIMQ8N3R3 496 aa22.23■■□□□ 1.15
VSTM4-201ENST00000298454 RAB7BQ96AH8 199 aa22.23■■□□□ 1.15
VSTM4-201ENST00000298454 TEX37Q96LM6 180 aa22.23■■□□□ 1.15
VSTM4-201ENST00000298454 SERPINI1Q99574 410 aa22.23■■□□□ 1.15
VSTM4-201ENST00000298454 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
VSTM4-201ENST00000298454 FARSBQ9NSD9 589 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
VSTM4-201ENST00000298454 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa22.23■■□□□ 1.15
VSTM4-201ENST00000298454 K7EQS6 105 aa22.23■■□□□ 1.15
VSTM4-201ENST00000298454 MRASO14807 208 aa22.23■■□□□ 1.15
VSTM4-201ENST00000298454 SYNCRIPO60506 623 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
VSTM4-201ENST00000298454 WDR47O94967 919 aa22.23■■□□□ 1.15
VSTM4-201ENST00000298454 PDHA2P29803 388 aa22.23■■□□□ 1.15
VSTM4-201ENST00000298454 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
VSTM4-201ENST00000298454 SLC6A12P48065 614 aa22.23■■□□□ 1.15
VSTM4-201ENST00000298454 HNMTP50135 292 aa22.23■■□□□ 1.15
VSTM4-201ENST00000298454 CST6Q15828 149 aa22.23■■□□□ 1.15
VSTM4-201ENST00000298454 ZNF423Q2M1K9 1284 aa22.23■■□□□ 1.15
VSTM4-201ENST00000298454 VPS26BQ4G0F5 336 aa22.23■■□□□ 1.15
VSTM4-201ENST00000298454 EEF1AKMT2Q5JPI9 291 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
VSTM4-201ENST00000298454 LAYNQ6UX15 382 aa22.23■■□□□ 1.15
VSTM4-201ENST00000298454 PLA2G15Q8NCC3 412 aa22.23■■□□□ 1.15
VSTM4-201ENST00000298454 HIPK4Q8NE63 616 aa22.23■■□□□ 1.15
VSTM4-201ENST00000298454 ZNF576Q9H609 170 aa22.23■■□□□ 1.15
VSTM4-201ENST00000298454 EBF2Q9HAK2 575 aa22.23■■□□□ 1.15
VSTM4-201ENST00000298454 KLQ9UEF7 1012 aa22.23■■□□□ 1.15
VSTM4-201ENST00000298454 ARHGEF33A8MVX0 844 aa22.22■■□□□ 1.15
VSTM4-201ENST00000298454 CAPN3P20807 821 aa22.22■■□□□ 1.15
VSTM4-201ENST00000298454 PSME3P61289 254 aa22.22■■□□□ 1.15
VSTM4-201ENST00000298454 C2orf27AQ580R0 203 aa22.22■■□□□ 1.15
VSTM4-201ENST00000298454 NEK5Q6P3R8 708 aa22.22■■□□□ 1.15
VSTM4-201ENST00000298454 RAB11FIP1Q6WKZ4 1283 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
VSTM4-201ENST00000298454 LRRC70Q7Z2Q7 622 aa22.22■■□□□ 1.15
VSTM4-201ENST00000298454 RETREG3Q86VR2 466 aa22.22■■□□□ 1.15
VSTM4-201ENST00000298454 GLMNQ92990 594 aa22.22■■□□□ 1.15
VSTM4-201ENST00000298454 ATG10Q9H0Y0 220 aa22.22■■□□□ 1.15
VSTM4-201ENST00000298454 RSPH9Q9H1X1 276 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
VSTM4-201ENST00000298454 ATXN10Q9UBB4 475 aa22.22■■□□□ 1.15
VSTM4-201ENST00000298454 TRPS1Q9UHF7 1281 aa22.22■■□□□ 1.15
VSTM4-201ENST00000298454 LSM1O15116 133 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
VSTM4-201ENST00000298454 LILRB5O75023 590 aa22.22■■□□□ 1.15
VSTM4-201ENST00000298454 PSIP1O75475 530 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
VSTM4-201ENST00000298454 MTHFRP42898 656 aa22.22■■□□□ 1.15
VSTM4-201ENST00000298454 KIR2DL1P43626 348 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
VSTM4-201ENST00000298454 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
VSTM4-201ENST00000298454 AP1S2P56377 157 aa22.22■■□□□ 1.15
VSTM4-201ENST00000298454 TAS2R38P59533 333 aa22.22■■□□□ 1.15
VSTM4-201ENST00000298454 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
VSTM4-201ENST00000298454 NR6A1Q15406 480 aa22.22■■□□□ 1.15
VSTM4-201ENST00000298454 SLC44A4Q53GD3 710 aa22.22■■□□□ 1.15
VSTM4-201ENST00000298454 AGBL4Q5VU57 503 aa22.22■■□□□ 1.15
VSTM4-201ENST00000298454 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa22.22■■□□□ 1.15
VSTM4-201ENST00000298454 EPHX3Q9H6B9 360 aa22.22■■□□□ 1.15
VSTM4-201ENST00000298454 STX18Q9P2W9 335 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
VSTM4-201ENST00000298454 SERGEFQ9UGK8 458 aa22.22■■□□□ 1.15
VSTM4-201ENST00000298454 CIDEBQ9UHD4 219 aa22.22■■□□□ 1.15
VSTM4-201ENST00000298454 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa22.22■■□□□ 1.15
VSTM4-201ENST00000298454 SLC22A14Q9Y267 594 aa22.22■■□□□ 1.15
VSTM4-201ENST00000298454 CCL27Q9Y4X3 112 aa22.22■■□□□ 1.15
VSTM4-201ENST00000298454 UFM1P61960 85 aa22.21■■□□□ 1.15
VSTM4-201ENST00000298454 CCSMST1Q4G0I0 132 aa22.21■■□□□ 1.15
VSTM4-201ENST00000298454 ZNF658BQ4V348 819 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
VSTM4-201ENST00000298454 BCL7AQ4VC05 210 aa22.21■■□□□ 1.15
VSTM4-201ENST00000298454 ACTR8Q9H981 624 aa22.21■■□□□ 1.15
VSTM4-201ENST00000298454 TRIM39Q9HCM9 518 aa22.21■■□□□ 1.15
VSTM4-201ENST00000298454 IGLON5A6NGN9 336 aa22.21■■□□□ 1.15
VSTM4-201ENST00000298454 E7ENX8 843 aa22.21■■□□□ 1.15
VSTM4-201ENST00000298454 CLDN9O95484 217 aa22.21■■□□□ 1.15
VSTM4-201ENST00000298454 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
VSTM4-201ENST00000298454 ITPKAP23677 461 aa22.21■■□□□ 1.15
VSTM4-201ENST00000298454 SLC34A1Q06495 639 aa22.21■■□□□ 1.15
VSTM4-201ENST00000298454 SGO1Q5FBB7 561 aa22.21■■□□□ 1.15
VSTM4-201ENST00000298454 MTSS1LQ765P7 747 aa22.21■■□□□ 1.15
VSTM4-201ENST00000298454 CFAP206Q8IYR0 622 aa22.21■■□□□ 1.15
VSTM4-201ENST00000298454 MSLNLQ96KJ4 702 aa22.21■■□□□ 1.15
VSTM4-201ENST00000298454 BRINP2Q9C0B6 783 aa22.21■■□□□ 1.15
VSTM4-201ENST00000298454 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
VSTM4-201ENST00000298454 ADA2Q9NZK5 511 aa22.21■■□□□ 1.15
VSTM4-201ENST00000298454 ZNF8P17098 575 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
VSTM4-201ENST00000298454 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
VSTM4-201ENST00000298454 BDKRB1P46663 353 aa22.2■■□□□ 1.14
VSTM4-201ENST00000298454 AP5B1Q2VPB7 878 aa22.2■■□□□ 1.14
VSTM4-201ENST00000298454 RFTN2Q52LD8 501 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
VSTM4-201ENST00000298454 TTC23LQ6PF05 361 aa22.2■■□□□ 1.14
VSTM4-201ENST00000298454 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa22.2■■□□□ 1.14
VSTM4-201ENST00000298454 ZNF547Q8IVP9 402 aa22.2■■□□□ 1.14
VSTM4-201ENST00000298454 SLC22A15Q8IZD6 547 aa22.2■■□□□ 1.14
VSTM4-201ENST00000298454 HDDC3Q8N4P3 179 aa22.2■■□□□ 1.14
VSTM4-201ENST00000298454 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa22.2■■□□□ 1.14
VSTM4-201ENST00000298454 SLC26A7Q8TE54 656 aa22.2■■□□□ 1.14
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