RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000294304.11

LRP5-201, Transcript of LDL receptor related protein 5, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LRP5, Length 5,159 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP5-201ENST00000294304 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP20.86■□□□□ 0.93
LRP5-201ENST00000294304 SMIM31A0A1B0GVY4 71 aa20.85■□□□□ 0.93
LRP5-201ENST00000294304 LCHNA4D1U4 455 aa20.85■□□□□ 0.93
LRP5-201ENST00000294304 MT-ND1P03886 318 aa20.85■□□□□ 0.93
LRP5-201ENST00000294304 FABP3P05413 133 aa20.85■□□□□ 0.93
LRP5-201ENST00000294304 NELFEP18615 380 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
LRP5-201ENST00000294304 GKP32189 559 aa20.85■□□□□ 0.93
LRP5-201ENST00000294304 C16orf72Q14CZ0 275 aa20.85■□□□□ 0.93
LRP5-201ENST00000294304 ARMC4Q5T2S8 1044 aa20.85■□□□□ 0.93
LRP5-201ENST00000294304 TSTD1Q8NFU3 115 aa20.85■□□□□ 0.93
LRP5-201ENST00000294304 DERL2Q9GZP9 239 aa20.85■□□□□ 0.93
LRP5-201ENST00000294304 OGDHLQ9ULD0 1010 aa20.85■□□□□ 0.93
LRP5-201ENST00000294304 KAT6AQ92794 2004 aa20.85■□□□□ 0.93
LRP5-201ENST00000294304 M0QZQ0 153 aa20.85■□□□□ 0.93
LRP5-201ENST00000294304 CCNA2P20248 432 aa20.85■□□□□ 0.93
LRP5-201ENST00000294304 RAB6CQ53S08 254 aa20.85■□□□□ 0.93
LRP5-201ENST00000294304 SPANXN2Q5MJ10 180 aa20.85■□□□□ 0.93
LRP5-201ENST00000294304 ZNF776Q68DI1 518 aaPredicted RBP20.85■□□□□ 0.93
LRP5-201ENST00000294304 RAB6CQ9H0N0 254 aa20.85■□□□□ 0.93
LRP5-201ENST00000294304 PDP1Q9P0J1 537 aaPredicted RBP20.85■□□□□ 0.93
LRP5-201ENST00000294304 MRTO4Q9UKD2 239 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
LRP5-201ENST00000294304 N6AMT1Q9Y5N5 214 aa20.85■□□□□ 0.93
LRP5-201ENST00000294304 C2orf78A6NCI8 922 aa20.85■□□□□ 0.93
LRP5-201ENST00000294304 POP7O75817 140 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
LRP5-201ENST00000294304 ADAM7Q9H2U9 754 aa20.85■□□□□ 0.93
LRP5-201ENST00000294304 AKTIPQ9H8T0 292 aa20.85■□□□□ 0.93
LRP5-201ENST00000294304 PNMA8CA0A1B0GUJ8 204 aa20.85■□□□□ 0.93
LRP5-201ENST00000294304 FAM149AA5PLN7 773 aa20.85■□□□□ 0.93
LRP5-201ENST00000294304 KHDRBS2Q5VWX1 349 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
LRP5-201ENST00000294304 LRRC70Q7Z2Q7 622 aa20.85■□□□□ 0.93
LRP5-201ENST00000294304 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP20.85■□□□□ 0.93
LRP5-201ENST00000294304 OR52B2Q96RD2 323 aa20.85■□□□□ 0.93
LRP5-201ENST00000294304 ZDHHC2Q9UIJ5 367 aa20.85■□□□□ 0.93
LRP5-201ENST00000294304 POMPQ9Y244 141 aa20.85■□□□□ 0.93
LRP5-201ENST00000294304 FANCGO15287 622 aa20.84■□□□□ 0.93
LRP5-201ENST00000294304 EDIL3O43854 480 aa20.84■□□□□ 0.93
LRP5-201ENST00000294304 SOCS5O75159 536 aa20.84■□□□□ 0.93
LRP5-201ENST00000294304 STC2O76061 302 aa20.84■□□□□ 0.93
LRP5-201ENST00000294304 HLA-EP13747 358 aa20.84■□□□□ 0.93
LRP5-201ENST00000294304 C1QTNF8P60827 252 aa20.84■□□□□ 0.93
LRP5-201ENST00000294304 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa20.84■□□□□ 0.93
LRP5-201ENST00000294304 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP20.84■□□□□ 0.93
LRP5-201ENST00000294304 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP20.84■□□□□ 0.93
LRP5-201ENST00000294304 OR7A2PQ8NGA2 310 aa20.84■□□□□ 0.93
LRP5-201ENST00000294304 DUSP26Q9BV47 211 aa20.84■□□□□ 0.93
LRP5-201ENST00000294304 SUCOQ9UBS9 1254 aaKnown RBP20.84■□□□□ 0.93
LRP5-201ENST00000294304 MARCH8Q5T0T0 291 aa20.84■□□□□ 0.93
LRP5-201ENST00000294304 PDZK1Q5T2W1 519 aa20.84■□□□□ 0.93
LRP5-201ENST00000294304 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP20.84■□□□□ 0.93
LRP5-201ENST00000294304 ANKRD49Q8WVL7 239 aa20.84■□□□□ 0.93
LRP5-201ENST00000294304 BADQ92934 168 aa20.84■□□□□ 0.93
LRP5-201ENST00000294304 BTBD9Q96Q07 612 aa20.84■□□□□ 0.93
LRP5-201ENST00000294304 NUAK2Q9H093 628 aa20.84■□□□□ 0.93
LRP5-201ENST00000294304 TMLHEQ9NVH6 421 aa20.84■□□□□ 0.93
LRP5-201ENST00000294304 TMEM233B4DJY2 109 aa20.84■□□□□ 0.93
LRP5-201ENST00000294304 STX11O75558 287 aa20.84■□□□□ 0.93
LRP5-201ENST00000294304 EDN1P05305 212 aa20.84■□□□□ 0.93
LRP5-201ENST00000294304 ITPKBP27987 946 aa20.84■□□□□ 0.93
LRP5-201ENST00000294304 TPP2P29144 1249 aaPredicted RBP20.84■□□□□ 0.93
LRP5-201ENST00000294304 SPHK2Q9NRA0 654 aa20.84■□□□□ 0.93
LRP5-201ENST00000294304 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP20.84■□□□□ 0.93
LRP5-201ENST00000294304 SLC22A14Q9Y267 594 aa20.84■□□□□ 0.93
LRP5-201ENST00000294304 PCDH7O60245 1069 aa20.84■□□□□ 0.93
LRP5-201ENST00000294304 MAFKO60675 156 aa20.84■□□□□ 0.93
LRP5-201ENST00000294304 PGLSO95336 258 aa20.84■□□□□ 0.93
LRP5-201ENST00000294304 IFNW1P05000 195 aa20.84■□□□□ 0.93
LRP5-201ENST00000294304 NCK1P16333 377 aa20.84■□□□□ 0.93
LRP5-201ENST00000294304 CSNK2BP67870 215 aa20.84■□□□□ 0.93
LRP5-201ENST00000294304 B3GNT6Q6ZMB0 384 aa20.84■□□□□ 0.93
LRP5-201ENST00000294304 PTCHD4Q6ZW05 846 aa20.84■□□□□ 0.93
LRP5-201ENST00000294304 KIAA1191Q96A73 305 aa20.84■□□□□ 0.93
LRP5-201ENST00000294304 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa20.84■□□□□ 0.93
LRP5-201ENST00000294304 LARS2Q15031 903 aaKnown RBP20.83■□□□□ 0.93
LRP5-201ENST00000294304 TEAD4Q15561 434 aa20.83■□□□□ 0.93
LRP5-201ENST00000294304 GPRC6AQ5T6X5 926 aa20.83■□□□□ 0.93
LRP5-201ENST00000294304 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP20.83■□□□□ 0.933e-21■■■■■ 29.7
LRP5-201ENST00000294304 SEC14L1Q92503 715 aa20.83■□□□□ 0.93
LRP5-201ENST00000294304 MRGPRX2Q96LB1 330 aa20.83■□□□□ 0.93
LRP5-201ENST00000294304 HDHD2Q9H0R4 259 aa20.83■□□□□ 0.93
LRP5-201ENST00000294304 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa20.83■□□□□ 0.93
LRP5-201ENST00000294304 PRDM8Q9NQV8 689 aa20.83■□□□□ 0.93
LRP5-201ENST00000294304 VPS29Q9UBQ0 182 aa20.83■□□□□ 0.93
LRP5-201ENST00000294304 NWD2Q9ULI1 1742 aa20.83■□□□□ 0.93
LRP5-201ENST00000294304 TULP3O75386 442 aa20.83■□□□□ 0.93
LRP5-201ENST00000294304 CLCNKAP51800 687 aa20.83■□□□□ 0.93
LRP5-201ENST00000294304 PRR5P85299 388 aa20.83■□□□□ 0.93
LRP5-201ENST00000294304 LMAN2Q12907 356 aa20.83■□□□□ 0.93
LRP5-201ENST00000294304 GRM2Q14416 872 aa20.83■□□□□ 0.93
LRP5-201ENST00000294304 NEK10Q6ZWH5 1172 aa20.83■□□□□ 0.93
LRP5-201ENST00000294304 ZC4H2Q9NQZ6 224 aa20.83■□□□□ 0.93
LRP5-201ENST00000294304 SCN2BO60939 215 aa20.83■□□□□ 0.92
LRP5-201ENST00000294304 ITGB1P05556 798 aa20.83■□□□□ 0.92
LRP5-201ENST00000294304 PRG2P13727 222 aa20.83■□□□□ 0.92
LRP5-201ENST00000294304 DGKEP52429 567 aa20.83■□□□□ 0.92
LRP5-201ENST00000294304 CYP4F3Q08477 520 aa20.83■□□□□ 0.92
LRP5-201ENST00000294304 ZNF155Q12901 538 aaPredicted RBP20.83■□□□□ 0.92
LRP5-201ENST00000294304 LRRC32Q14392 662 aa20.83■□□□□ 0.92
LRP5-201ENST00000294304 MINDY4Q4G0A6 757 aa20.83■□□□□ 0.92
LRP5-201ENST00000294304 CLLU1OSQ5K130 101 aa20.83■□□□□ 0.92
LRP5-201ENST00000294304 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa20.83■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.8 ms