RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000263202.14

UFD1-201, Transcript of ubiquitin recognition factor in ER associated degradation 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UFD1, Length 1,814 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFD1-201ENST00000263202 H2AFJQ9BTM1 129 aa22.14■■□□□ 1.13
UFD1-201ENST00000263202 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
UFD1-201ENST00000263202 PSMD13Q9UNM6 376 aa22.14■■□□□ 1.13
UFD1-201ENST00000263202 ASB1Q9Y576 335 aa22.14■■□□□ 1.13
UFD1-201ENST00000263202 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa22.13■■□□□ 1.13
UFD1-201ENST00000263202 C1orf105O95561 183 aa22.13■■□□□ 1.13
UFD1-201ENST00000263202 BDKRB1P46663 353 aa22.13■■□□□ 1.13
UFD1-201ENST00000263202 AP1S2P56377 157 aa22.13■■□□□ 1.13
UFD1-201ENST00000263202 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP22.13■■□□□ 1.13
UFD1-201ENST00000263202 ANKS6Q68DC2 871 aa22.13■■□□□ 1.13
UFD1-201ENST00000263202 WWP1Q9H0M0 922 aa22.13■■□□□ 1.13
UFD1-201ENST00000263202 OSGEPL1Q9H4B0 414 aa22.13■■□□□ 1.13
UFD1-201ENST00000263202 FANCMQ8IYD8 2048 aa22.13■■□□□ 1.13
UFD1-201ENST00000263202 A0A1W2PR77 199 aa22.13■■□□□ 1.13
UFD1-201ENST00000263202 KRT87PA6NCN2 255 aa22.13■■□□□ 1.13
UFD1-201ENST00000263202 SNX3O60493 162 aa22.13■■□□□ 1.13
UFD1-201ENST00000263202 TGDSO95455 350 aa22.13■■□□□ 1.13
UFD1-201ENST00000263202 WNT1P04628 370 aa22.13■■□□□ 1.13
UFD1-201ENST00000263202 RPL10P27635 214 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
UFD1-201ENST00000263202 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
UFD1-201ENST00000263202 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP22.13■■□□□ 1.13
UFD1-201ENST00000263202 UNC5DQ6UXZ4 953 aa22.13■■□□□ 1.13
UFD1-201ENST00000263202 MFSD2AQ8NA29 543 aa22.13■■□□□ 1.13
UFD1-201ENST00000263202 FBXO15Q8NCQ5 510 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
UFD1-201ENST00000263202 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
UFD1-201ENST00000263202 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
UFD1-201ENST00000263202 TMEM79Q9BSE2 394 aa22.13■■□□□ 1.13
UFD1-201ENST00000263202 PCTPQ9UKL6 214 aa22.13■■□□□ 1.13
UFD1-201ENST00000263202 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
UFD1-201ENST00000263202 DGKBQ9Y6T7 804 aa22.13■■□□□ 1.13
UFD1-201ENST00000263202 PABPN1LA6NDY0 278 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
UFD1-201ENST00000263202 E2F3O00716 465 aa22.12■■□□□ 1.13
UFD1-201ENST00000263202 CD38P28907 300 aa22.12■■□□□ 1.13
UFD1-201ENST00000263202 CLCNKAP51800 687 aa22.12■■□□□ 1.13
UFD1-201ENST00000263202 CDH13P55290 713 aa22.12■■□□□ 1.13
UFD1-201ENST00000263202 RACK1P63244 317 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
UFD1-201ENST00000263202 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
UFD1-201ENST00000263202 GALNT1Q10472 559 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
UFD1-201ENST00000263202 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
UFD1-201ENST00000263202 FZD2Q14332 565 aa22.12■■□□□ 1.13
UFD1-201ENST00000263202 CCSMST1Q4G0I0 132 aa22.12■■□□□ 1.13
UFD1-201ENST00000263202 CAPRIN2Q6IMN6 1127 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
UFD1-201ENST00000263202 LONP2Q86WA8 852 aa22.12■■□□□ 1.13
UFD1-201ENST00000263202 HID1Q8IV36 788 aa22.12■■□□□ 1.13
UFD1-201ENST00000263202 ZNF781Q8N8C0 355 aa22.12■■□□□ 1.13
UFD1-201ENST00000263202 C1orf216Q8TAB5 229 aa22.12■■□□□ 1.13
UFD1-201ENST00000263202 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
UFD1-201ENST00000263202 UBTD2Q8WUN7 234 aa22.12■■□□□ 1.13
UFD1-201ENST00000263202 RMDN2Q96LZ7 410 aa22.12■■□□□ 1.13
UFD1-201ENST00000263202 TRMOQ9BU70 441 aa22.12■■□□□ 1.13
UFD1-201ENST00000263202 NPHS2Q9NP85 383 aa22.12■■□□□ 1.13
UFD1-201ENST00000263202 WWOXQ9NZC7 414 aa22.12■■□□□ 1.13
UFD1-201ENST00000263202 HAO1Q9UJM8 370 aa22.12■■□□□ 1.13
UFD1-201ENST00000263202 WDR37Q9Y2I8 494 aa22.12■■□□□ 1.13
UFD1-201ENST00000263202 RAP2CQ9Y3L5 183 aa22.12■■□□□ 1.13
UFD1-201ENST00000263202 TP53BP1Q12888 1972 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
UFD1-201ENST00000263202 MUC3AQ02505 3323 aa22.11■■□□□ 1.13
UFD1-201ENST00000263202 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
UFD1-201ENST00000263202 SLC35G4P0C7Q5 338 aa22.11■■□□□ 1.13
UFD1-201ENST00000263202 TSPAN8P19075 237 aa22.11■■□□□ 1.13
UFD1-201ENST00000263202 HSPA7P48741 367 aa22.11■■□□□ 1.13
UFD1-201ENST00000263202 NAA20P61599 178 aa22.11■■□□□ 1.13
UFD1-201ENST00000263202 SPATA21Q7Z572 469 aa22.11■■□□□ 1.13
UFD1-201ENST00000263202 DCP2Q8IU60 420 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
UFD1-201ENST00000263202 PIWIL2Q8TC59 973 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
UFD1-201ENST00000263202 DNASE2BQ8WZ79 361 aa22.11■■□□□ 1.13
UFD1-201ENST00000263202 TFGQ92734 400 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
UFD1-201ENST00000263202 SHCBP1LQ9BZQ2 653 aa22.11■■□□□ 1.13
UFD1-201ENST00000263202 ILKAPQ9H0C8 392 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
UFD1-201ENST00000263202 TMEM168Q9H0V1 697 aa22.11■■□□□ 1.13
UFD1-201ENST00000263202 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa22.11■■□□□ 1.13
UFD1-201ENST00000263202 TM9SF3Q9HD45 589 aa22.11■■□□□ 1.13
UFD1-201ENST00000263202 PNPOQ9NVS9 261 aa22.11■■□□□ 1.13
UFD1-201ENST00000263202 MARCOQ9UEW3 520 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
UFD1-201ENST00000263202 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
UFD1-201ENST00000263202 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
UFD1-201ENST00000263202 UBFD1O14562 309 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
UFD1-201ENST00000263202 RASGRP1O95267 797 aa22.1■■□□□ 1.13
UFD1-201ENST00000263202 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP22.1■■□□□ 1.13
UFD1-201ENST00000263202 KITP10721 976 aa22.1■■□□□ 1.13
UFD1-201ENST00000263202 IDSP22304 550 aa22.1■■□□□ 1.13
UFD1-201ENST00000263202 MPSTP25325 297 aa22.1■■□□□ 1.13
UFD1-201ENST00000263202 GGT5P36269 586 aa22.1■■□□□ 1.13
UFD1-201ENST00000263202 HNMTP50135 292 aa22.1■■□□□ 1.13
UFD1-201ENST00000263202 CTBSQ01459 385 aa22.1■■□□□ 1.13
UFD1-201ENST00000263202 CLCQ05315 142 aa22.1■■□□□ 1.13
UFD1-201ENST00000263202 LRP8Q14114 963 aa22.1■■□□□ 1.13
UFD1-201ENST00000263202 ZXDCQ2QGD7 858 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
UFD1-201ENST00000263202 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
UFD1-201ENST00000263202 IQCHQ86VS3 1027 aa22.1■■□□□ 1.13
UFD1-201ENST00000263202 TCAIMQ8N3R3 496 aa22.1■■□□□ 1.13
UFD1-201ENST00000263202 DTWD2Q8NBA8 298 aa22.1■■□□□ 1.13
UFD1-201ENST00000263202 TRIM55Q9BYV6 548 aa22.1■■□□□ 1.13
UFD1-201ENST00000263202 CD244Q9BZW8 370 aa22.1■■□□□ 1.13
UFD1-201ENST00000263202 EML4Q9HC35 981 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
UFD1-201ENST00000263202 TRNAU1APQ9NX07 287 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
UFD1-201ENST00000263202 NCOR1O75376 2440 aa22.1■■□□□ 1.13
UFD1-201ENST00000263202 TNFP01375 233 aa22.1■■□□□ 1.13
UFD1-201ENST00000263202 PRKAA1Q13131 559 aa22.1■■□□□ 1.13
UFD1-201ENST00000263202 LAYNQ6UX15 382 aa22.1■■□□□ 1.13
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