RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000629983.2

CAPNS1-217, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 799 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-217ENST00000629983 ABCA12Q86UK0 2595 aa26.53■■□□□ 1.84
CAPNS1-217ENST00000629983 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP26.52■■□□□ 1.84
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CAPNS1-217ENST00000629983 BCL7AQ4VC05 210 aa26.52■■□□□ 1.84
CAPNS1-217ENST00000629983 VSIG1Q86XK7 387 aa26.52■■□□□ 1.84
CAPNS1-217ENST00000629983 HM13Q8TCT9 377 aa26.52■■□□□ 1.84
CAPNS1-217ENST00000629983 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa26.52■■□□□ 1.84
CAPNS1-217ENST00000629983 INPP5DQ92835 1189 aa26.52■■□□□ 1.84
CAPNS1-217ENST00000629983 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa26.52■■□□□ 1.84
CAPNS1-217ENST00000629983 FSD1LQ9BXM9 530 aa26.52■■□□□ 1.84
CAPNS1-217ENST00000629983 ASB8Q9H765 288 aa26.52■■□□□ 1.84
CAPNS1-217ENST00000629983 NDOR1Q9UHB4 597 aa26.52■■□□□ 1.84
CAPNS1-217ENST00000629983 CAPN11Q9UMQ6 739 aa26.52■■□□□ 1.84
CAPNS1-217ENST00000629983 CELSR2Q9HCU4 2923 aa26.52■■□□□ 1.84
CAPNS1-217ENST00000629983 ARHGAP10A1A4S6 786 aa26.51■■□□□ 1.83
CAPNS1-217ENST00000629983 BTN3A3O00478 584 aa26.51■■□□□ 1.83
CAPNS1-217ENST00000629983 EPOP01588 193 aa26.51■■□□□ 1.83
CAPNS1-217ENST00000629983 MSL3P1P0C860 447 aa26.51■■□□□ 1.83
CAPNS1-217ENST00000629983 CBSLP0DN79 551 aa26.51■■□□□ 1.83
CAPNS1-217ENST00000629983 CBSP35520 551 aa26.51■■□□□ 1.83
CAPNS1-217ENST00000629983 CDHR3Q6ZTQ4 885 aa26.51■■□□□ 1.83
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CAPNS1-217ENST00000629983 SLC34A3Q8N130 599 aa26.51■■□□□ 1.83
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF552Q9H707 407 aaPredicted RBP26.51■■□□□ 1.83
CAPNS1-217ENST00000629983 P4HTMQ9NXG6 502 aa26.51■■□□□ 1.83
CAPNS1-217ENST00000629983 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP26.51■■□□□ 1.83
CAPNS1-217ENST00000629983 SRPK3Q9UPE1 567 aa26.51■■□□□ 1.83
CAPNS1-217ENST00000629983 NTNG1Q9Y2I2 539 aa26.51■■□□□ 1.83
CAPNS1-217ENST00000629983 CCDC66A2RUB6 948 aa26.5■■□□□ 1.83
CAPNS1-217ENST00000629983 C2orf74A8MZ97 194 aa26.5■■□□□ 1.83
CAPNS1-217ENST00000629983 MASP2O00187 686 aa26.5■■□□□ 1.83
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CAPNS1-217ENST00000629983 KLF7O75840 302 aaPredicted RBP26.5■■□□□ 1.83
CAPNS1-217ENST00000629983 MBD3O95983 291 aa26.5■■□□□ 1.83
CAPNS1-217ENST00000629983 RALBP11234 206 aa26.5■■□□□ 1.83
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CAPNS1-217ENST00000629983 PER3P56645 1201 aa26.5■■□□□ 1.83
CAPNS1-217ENST00000629983 WASHC5Q12768 1159 aa26.5■■□□□ 1.83
CAPNS1-217ENST00000629983 CYP2A13Q16696 494 aa26.5■■□□□ 1.83
CAPNS1-217ENST00000629983 IGFL3Q6UXB1 125 aa26.5■■□□□ 1.83
CAPNS1-217ENST00000629983 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa26.5■■□□□ 1.83
CAPNS1-217ENST00000629983 PID1Q7Z2X4 250 aa26.5■■□□□ 1.83
CAPNS1-217ENST00000629983 MOCOSQ96EN8 888 aa26.5■■□□□ 1.83
CAPNS1-217ENST00000629983 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP26.5■■□□□ 1.83
CAPNS1-217ENST00000629983 NRTNQ99748 197 aa26.5■■□□□ 1.83
CAPNS1-217ENST00000629983 PITPNM3Q9BZ71 974 aa26.5■■□□□ 1.83
CAPNS1-217ENST00000629983 IRAK4Q9NWZ3 460 aa26.5■■□□□ 1.83
CAPNS1-217ENST00000629983 IFT80Q9P2H3 777 aaPredicted RBP26.5■■□□□ 1.83
CAPNS1-217ENST00000629983 FKBPLQ9UIM3 349 aa26.5■■□□□ 1.83
CAPNS1-217ENST00000629983 CRLS1Q9UJA2 301 aa26.5■■□□□ 1.83
CAPNS1-217ENST00000629983 NENFQ9UMX5 172 aa26.5■■□□□ 1.83
CAPNS1-217ENST00000629983 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa26.5■■□□□ 1.83
CAPNS1-217ENST00000629983 ARL5AQ9Y689 179 aa26.5■■□□□ 1.83
CAPNS1-217ENST00000629983 PCSK5Q92824 1860 aa26.49■■□□□ 1.83
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC9A5Q14940 896 aa26.49■■□□□ 1.83
CAPNS1-217ENST00000629983 DEFB110Q30KQ9 67 aa26.49■■□□□ 1.83
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP26.49■■□□□ 1.83
CAPNS1-217ENST00000629983 CUZD1Q86UP6 607 aa26.49■■□□□ 1.83
CAPNS1-217ENST00000629983 OR52E1Q8NGJ3 308 aa26.49■■□□□ 1.83
CAPNS1-217ENST00000629983 MARVELD3Q96A59 401 aa26.49■■□□□ 1.83
CAPNS1-217ENST00000629983 LINC00615Q96LM1 132 aaPredicted RBP26.49■■□□□ 1.83
CAPNS1-217ENST00000629983 HGH1Q9BTY7 390 aa26.49■■□□□ 1.83
CAPNS1-217ENST00000629983 XKR8Q9H6D3 395 aa26.49■■□□□ 1.83
CAPNS1-217ENST00000629983 LRBAP50851 2863 aa26.48■■□□□ 1.83
CAPNS1-217ENST00000629983 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP26.48■■□□□ 1.83
CAPNS1-217ENST00000629983 OR2B3O76000 313 aa26.48■■□□□ 1.83
CAPNS1-217ENST00000629983 SRP72O76094 671 aaKnown RBP26.48■■□□□ 1.83
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CAPNS1-217ENST00000629983 FANCCQ00597 558 aa26.48■■□□□ 1.83
CAPNS1-217ENST00000629983 SARM1Q6SZW1 724 aa26.48■■□□□ 1.83
CAPNS1-217ENST00000629983 Q6ZS92 163 aa26.48■■□□□ 1.83
CAPNS1-217ENST00000629983 AMIGO1Q86WK6 493 aa26.48■■□□□ 1.83
CAPNS1-217ENST00000629983 ST6GALNAC3Q8NDV1 305 aa26.48■■□□□ 1.83
CAPNS1-217ENST00000629983 OR4K2Q8NGD2 314 aa26.48■■□□□ 1.83
CAPNS1-217ENST00000629983 IQCDQ96DY2 449 aa26.48■■□□□ 1.83
CAPNS1-217ENST00000629983 FCRL5Q96RD9 977 aa26.48■■□□□ 1.83
CAPNS1-217ENST00000629983 ACTR10Q9NZ32 417 aa26.48■■□□□ 1.83
CAPNS1-217ENST00000629983 RSPH14Q9UHP6 348 aa26.48■■□□□ 1.83
CAPNS1-217ENST00000629983 OSGIN2Q9Y236 505 aa26.48■■□□□ 1.83
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CAPNS1-217ENST00000629983 C2orf81A6NN90 581 aa26.47■■□□□ 1.83
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CAPNS1-217ENST00000629983 NR2C2P49116 596 aa26.47■■□□□ 1.83
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CAPNS1-217ENST00000629983 MFSD7Q6UXD7 560 aa26.47■■□□□ 1.83
CAPNS1-217ENST00000629983 TRIM73Q86UV7 250 aa26.47■■□□□ 1.83
CAPNS1-217ENST00000629983 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP26.47■■□□□ 1.83
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF567Q8N184 647 aa26.47■■□□□ 1.83
CAPNS1-217ENST00000629983 C19orf47Q8N9M1 422 aaKnown RBP26.47■■□□□ 1.83
CAPNS1-217ENST00000629983 PHC3Q8NDX5 983 aa26.47■■□□□ 1.83
CAPNS1-217ENST00000629983 ANP32EQ9BTT0 268 aa26.47■■□□□ 1.83
CAPNS1-217ENST00000629983 FICDQ9BVA6 458 aa26.47■■□□□ 1.83
CAPNS1-217ENST00000629983 ZBTB20Q9HC78 741 aaPredicted RBP26.47■■□□□ 1.83
CAPNS1-217ENST00000629983 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa26.47■■□□□ 1.83
CAPNS1-217ENST00000629983 TXLNGQ9NUQ3 528 aa26.47■■□□□ 1.83
CAPNS1-217ENST00000629983 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP26.47■■□□□ 1.83
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