RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000626236.2

SGMS1-211, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SGMS1, Length 1,013 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-211ENST00000626236 LINGO1Q96FE5 620 aa8.33□□□□□ -1.08
SGMS1-211ENST00000626236 RMDN2Q96LZ7 410 aa8.33□□□□□ -1.08
SGMS1-211ENST00000626236 EDEM2Q9BV94 578 aa8.33□□□□□ -1.08
SGMS1-211ENST00000626236 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
SGMS1-211ENST00000626236 OR52A5Q9H2C5 316 aa8.33□□□□□ -1.08
SGMS1-211ENST00000626236 DPEP2Q9H4A9 486 aa8.33□□□□□ -1.08
SGMS1-211ENST00000626236 VIPAS39Q9H9C1 493 aa8.33□□□□□ -1.08
SGMS1-211ENST00000626236 SYTL2Q9HCH5 934 aa8.33□□□□□ -1.08
SGMS1-211ENST00000626236 PCMTD2Q9NV79 361 aa8.33□□□□□ -1.08
SGMS1-211ENST00000626236 SIRPGQ9P1W8 387 aa8.33□□□□□ -1.08
SGMS1-211ENST00000626236 RUVBL2Q9Y230 463 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
SGMS1-211ENST00000626236 WDR37Q9Y2I8 494 aa8.33□□□□□ -1.08
SGMS1-211ENST00000626236 ACOT9Q9Y305 439 aa8.33□□□□□ -1.08
SGMS1-211ENST00000626236 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
SGMS1-211ENST00000626236 MUC6Q6W4X9 2439 aa8.33□□□□□ -1.08
SGMS1-211ENST00000626236 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa8.32□□□□□ -1.08
SGMS1-211ENST00000626236 NEMP2A6NFY4 417 aa8.32□□□□□ -1.08
SGMS1-211ENST00000626236 OR52A4PA6NMU1 304 aa8.32□□□□□ -1.08
SGMS1-211ENST00000626236 AGPSO00116 658 aa8.32□□□□□ -1.08
SGMS1-211ENST00000626236 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
SGMS1-211ENST00000626236 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
SGMS1-211ENST00000626236 MAP2K7O14733 419 aa8.32□□□□□ -1.08
SGMS1-211ENST00000626236 WISP3O95389 354 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
SGMS1-211ENST00000626236 TSPAN12O95859 305 aa8.32□□□□□ -1.08
SGMS1-211ENST00000626236 C2P06681 752 aa8.32□□□□□ -1.08
SGMS1-211ENST00000626236 MPC1LP0DKB6 136 aa8.32□□□□□ -1.08
SGMS1-211ENST00000626236 F3P13726 295 aa8.32□□□□□ -1.08
SGMS1-211ENST00000626236 ENO3P13929 434 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
SGMS1-211ENST00000626236 SLC2A4P14672 509 aa8.32□□□□□ -1.08
SGMS1-211ENST00000626236 BRAFP15056 766 aa8.32□□□□□ -1.08
SGMS1-211ENST00000626236 ATP5DP30049 168 aa8.32□□□□□ -1.08
SGMS1-211ENST00000626236 MAGEA12P43365 314 aa8.32□□□□□ -1.08
SGMS1-211ENST00000626236 CSRP3P50461 194 aa8.32□□□□□ -1.08
SGMS1-211ENST00000626236 ABRQ12979 859 aa8.32□□□□□ -1.08
SGMS1-211ENST00000626236 CSHL1Q14406 222 aa8.32□□□□□ -1.08
SGMS1-211ENST00000626236 CLCA4Q14CN2 919 aa8.32□□□□□ -1.08
SGMS1-211ENST00000626236 UAP1L1Q3KQV9 507 aa8.32□□□□□ -1.08
SGMS1-211ENST00000626236 AGAP9Q5VTM2 703 aa8.32□□□□□ -1.08
SGMS1-211ENST00000626236 LRRC8EQ6NSJ5 796 aa8.32□□□□□ -1.08
SGMS1-211ENST00000626236 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
SGMS1-211ENST00000626236 TIFABQ6ZNK6 161 aa8.32□□□□□ -1.08
SGMS1-211ENST00000626236 PRR23CQ6ZRP0 262 aa8.32□□□□□ -1.08
SGMS1-211ENST00000626236 ASCL5Q7RTU5 278 aa8.32□□□□□ -1.08
SGMS1-211ENST00000626236 KANSL1Q7Z3B3 1105 aa8.32□□□□□ -1.08
SGMS1-211ENST00000626236 PDZD3Q86UT5 571 aa8.32□□□□□ -1.08
SGMS1-211ENST00000626236 SFTPA2Q8IWL1 248 aa8.32□□□□□ -1.08
SGMS1-211ENST00000626236 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
SGMS1-211ENST00000626236 C4orf33Q8N1A6 199 aa8.32□□□□□ -1.08
SGMS1-211ENST00000626236 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa8.32□□□□□ -1.08
SGMS1-211ENST00000626236 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa8.32□□□□□ -1.08
SGMS1-211ENST00000626236 CFAP61Q8NHU2 1237 aa8.32□□□□□ -1.08
SGMS1-211ENST00000626236 PATE1Q8WXA2 126 aa8.32□□□□□ -1.08
SGMS1-211ENST00000626236 CABS1Q96KC9 395 aa8.32□□□□□ -1.08
SGMS1-211ENST00000626236 C12orf66Q96MD2 445 aa8.32□□□□□ -1.08
SGMS1-211ENST00000626236 UNKQ9C0B0 810 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
SGMS1-211ENST00000626236 ACBD3Q9H3P7 528 aa8.32□□□□□ -1.08
SGMS1-211ENST00000626236 TMEM9BQ9NQ34 198 aa8.32□□□□□ -1.08
SGMS1-211ENST00000626236 RXFP3Q9NSD7 469 aa8.32□□□□□ -1.08
SGMS1-211ENST00000626236 IMP3Q9NV31 184 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
SGMS1-211ENST00000626236 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
SGMS1-211ENST00000626236 NLGN3Q9NZ94 848 aa8.32□□□□□ -1.08
SGMS1-211ENST00000626236 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
SGMS1-211ENST00000626236 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa8.32□□□□□ -1.08
SGMS1-211ENST00000626236 CACNA1HO95180 2353 aa8.32□□□□□ -1.08
SGMS1-211ENST00000626236 ARHGEF17Q96PE2 2063 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
SGMS1-211ENST00000626236 A6NCN8 305 aa8.31□□□□□ -1.08
SGMS1-211ENST00000626236 NPEPPSL1A6NEC2 478 aa8.31□□□□□ -1.08
SGMS1-211ENST00000626236 BTN3A1O00481 513 aa8.31□□□□□ -1.08
SGMS1-211ENST00000626236 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
SGMS1-211ENST00000626236 PCDHGA12O60330 932 aa8.31□□□□□ -1.08
SGMS1-211ENST00000626236 KLHL2O95198 593 aa8.31□□□□□ -1.08
SGMS1-211ENST00000626236 LTA4HP09960 611 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
SGMS1-211ENST00000626236 ZNF883P0CG24 379 aa8.31□□□□□ -1.08
SGMS1-211ENST00000626236 GIMD1P0DJR0 217 aa8.31□□□□□ -1.08
SGMS1-211ENST00000626236 ALPPL2P10696 532 aa8.31□□□□□ -1.08
SGMS1-211ENST00000626236 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
SGMS1-211ENST00000626236 CD1DP15813 335 aa8.31□□□□□ -1.08
SGMS1-211ENST00000626236 KRT4P19013 534 aa8.31□□□□□ -1.08
SGMS1-211ENST00000626236 ACADLP28330 430 aa8.31□□□□□ -1.08
SGMS1-211ENST00000626236 SLC26A3P40879 764 aa8.31□□□□□ -1.08
SGMS1-211ENST00000626236 BDKRB1P46663 353 aa8.31□□□□□ -1.08
SGMS1-211ENST00000626236 DLG1Q12959 904 aa8.31□□□□□ -1.08
SGMS1-211ENST00000626236 KRT33BQ14525 404 aa8.31□□□□□ -1.08
SGMS1-211ENST00000626236 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
SGMS1-211ENST00000626236 RPE65Q16518 533 aa8.31□□□□□ -1.08
SGMS1-211ENST00000626236 FAM83EQ2M2I3 478 aa8.31□□□□□ -1.08
SGMS1-211ENST00000626236 CAPRIN2Q6IMN6 1127 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
SGMS1-211ENST00000626236 IYDQ6PHW0 289 aa8.31□□□□□ -1.08
SGMS1-211ENST00000626236 LVRNQ6Q4G3 990 aa8.31□□□□□ -1.08
SGMS1-211ENST00000626236 ABRAXAS1Q6UWZ7 409 aa8.31□□□□□ -1.08
SGMS1-211ENST00000626236 WASH2PQ6VEQ5 465 aa8.31□□□□□ -1.08
SGMS1-211ENST00000626236 NEK10Q6ZWH5 1172 aa8.31□□□□□ -1.08
SGMS1-211ENST00000626236 CCDC91Q7Z6B0 441 aa8.31□□□□□ -1.08
SGMS1-211ENST00000626236 SLC9B2Q86UD5 537 aa8.31□□□□□ -1.08
SGMS1-211ENST00000626236 TRABD2AQ86V40 505 aa8.31□□□□□ -1.08
SGMS1-211ENST00000626236 TRIM48Q8IWZ4 208 aa8.31□□□□□ -1.08
SGMS1-211ENST00000626236 CENPLQ8N0S6 344 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
SGMS1-211ENST00000626236 NAGSQ8N159 534 aa8.31□□□□□ -1.08
SGMS1-211ENST00000626236 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
SGMS1-211ENST00000626236 EID2Q8N6I1 236 aa8.31□□□□□ -1.08
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