RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000620394.1

SRRT-218, Transcript of serrate, RNA effector molecule, humanhuman

TSL 2

Gene SRRT, Length 582 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRT-218ENST00000620394 PGDP52209 483 aa21.44■■□□□ 1.02
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SRRT-218ENST00000620394 HSD11B2P80365 405 aa21.44■■□□□ 1.02
SRRT-218ENST00000620394 TMPRSS15P98073 1019 aa21.44■■□□□ 1.02
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SRRT-218ENST00000620394 CERS6Q6ZMG9 384 aa21.44■■□□□ 1.02
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SRRT-218ENST00000620394 CT55Q8WUE5 264 aa21.44■■□□□ 1.02
SRRT-218ENST00000620394 HES6Q96HZ4 224 aa21.44■■□□□ 1.02
SRRT-218ENST00000620394 OR52A5Q9H2C5 316 aa21.44■■□□□ 1.02
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SRRT-218ENST00000620394 CFAP206Q8IYR0 622 aa21.43■■□□□ 1.02
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SRRT-218ENST00000620394 TUBB2BQ9BVA1 445 aa21.43■■□□□ 1.02
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SRRT-218ENST00000620394 ACTL8Q9H568 366 aa21.43■■□□□ 1.02
SRRT-218ENST00000620394 FAM96AQ9H5X1 160 aa21.43■■□□□ 1.02
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SRRT-218ENST00000620394 SEMA7AO75326 666 aa21.42■■□□□ 1.02
SRRT-218ENST00000620394 FTCDO95954 541 aa21.42■■□□□ 1.02
SRRT-218ENST00000620394 POLBP06746 335 aa21.42■■□□□ 1.02
SRRT-218ENST00000620394 GSTM1P09488 218 aa21.42■■□□□ 1.02
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SRRT-218ENST00000620394 GSTM4Q03013 218 aa21.42■■□□□ 1.02
SRRT-218ENST00000620394 RPA4Q13156 261 aa21.42■■□□□ 1.02
SRRT-218ENST00000620394 SERPINA9Q86WD7 417 aa21.42■■□□□ 1.02
SRRT-218ENST00000620394 GAS2L3Q86XJ1 694 aa21.42■■□□□ 1.02
SRRT-218ENST00000620394 OR8K5Q8NH50 307 aa21.42■■□□□ 1.02
SRRT-218ENST00000620394 STYXQ8WUJ0 223 aa21.42■■□□□ 1.02
SRRT-218ENST00000620394 THAP4Q8WY91 577 aa21.42■■□□□ 1.02
SRRT-218ENST00000620394 CREBBPQ92793 2442 aa21.42■■□□□ 1.02
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SRRT-218ENST00000620394 TMEM121Q9BTD3 319 aa21.42■■□□□ 1.02
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SRRT-218ENST00000620394 UGT8Q16880 541 aa21.41■■□□□ 1.02
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SRRT-218ENST00000620394 ARMC6Q6NXE6 501 aa21.41■■□□□ 1.02
SRRT-218ENST00000620394 MICALCLQ6ZW33 695 aa21.41■■□□□ 1.02
SRRT-218ENST00000620394 PIANPQ8IYJ0 282 aa21.41■■□□□ 1.02
SRRT-218ENST00000620394 ZNF501Q96CX3 271 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
SRRT-218ENST00000620394 CDKN2AIPNLQ96HQ2 116 aa21.41■■□□□ 1.02
SRRT-218ENST00000620394 IMPACTQ9P2X3 320 aa21.41■■□□□ 1.02
SRRT-218ENST00000620394 SPTBP11277 2137 aa21.41■■□□□ 1.02
SRRT-218ENST00000620394 A1L4Q6 167 aa21.4■■□□□ 1.02
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SRRT-218ENST00000620394 LAMB3Q13751 1172 aa21.4■■□□□ 1.02
SRRT-218ENST00000620394 GSE1Q14687 1217 aa21.4■■□□□ 1.02
SRRT-218ENST00000620394 POU6F1Q14863 301 aa21.4■■□□□ 1.02
SRRT-218ENST00000620394 DBN1Q16643 649 aa21.4■■□□□ 1.02
SRRT-218ENST00000620394 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa21.4■■□□□ 1.02
SRRT-218ENST00000620394 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
SRRT-218ENST00000620394 ZNF517Q6ZMY9 492 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
SRRT-218ENST00000620394 PPM1MQ96MI6 270 aa21.4■■□□□ 1.02
SRRT-218ENST00000620394 GPR87Q9BY21 358 aa21.4■■□□□ 1.02
SRRT-218ENST00000620394 SLC29A3Q9BZD2 475 aa21.4■■□□□ 1.02
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SRRT-218ENST00000620394 TPH1P17752 444 aa21.39■■□□□ 1.01
SRRT-218ENST00000620394 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
SRRT-218ENST00000620394 ARCN1P48444 511 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
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SRRT-218ENST00000620394 ITIH4Q14624 930 aa21.39■■□□□ 1.01
SRRT-218ENST00000620394 OASLQ15646 514 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
SRRT-218ENST00000620394 GPR19Q15760 415 aa21.39■■□□□ 1.01
SRRT-218ENST00000620394 CPZQ66K79 652 aa21.39■■□□□ 1.01
SRRT-218ENST00000620394 PACS1Q6VY07 963 aa21.39■■□□□ 1.01
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