RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590874.5

CAPNS1-211, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 926 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-211ENST00000590874 DCUN1D1Q96GG9 259 aa24.88■■□□□ 1.57
CAPNS1-211ENST00000590874 FERD3LQ96RJ6 166 aa24.88■■□□□ 1.57
CAPNS1-211ENST00000590874 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP24.88■■□□□ 1.57
CAPNS1-211ENST00000590874 UNC79Q9P2D8 2635 aa24.87■■□□□ 1.57
CAPNS1-211ENST00000590874 KRT86O43790 486 aa24.87■■□□□ 1.57
CAPNS1-211ENST00000590874 MFAP3LO75121 409 aa24.87■■□□□ 1.57
CAPNS1-211ENST00000590874 RBL1P28749 1068 aa24.87■■□□□ 1.57
CAPNS1-211ENST00000590874 ADRA1AP35348 466 aa24.87■■□□□ 1.57
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP24.87■■□□□ 1.57
CAPNS1-211ENST00000590874 RANBP10Q6VN20 620 aa24.87■■□□□ 1.57
CAPNS1-211ENST00000590874 MICALCLQ6ZW33 695 aa24.87■■□□□ 1.57
CAPNS1-211ENST00000590874 OR13C4Q8NGS5 318 aa24.87■■□□□ 1.57
CAPNS1-211ENST00000590874 PRR7Q8TB68 274 aa24.87■■□□□ 1.57
CAPNS1-211ENST00000590874 C19orf60Q96EN9 201 aa24.87■■□□□ 1.57
CAPNS1-211ENST00000590874 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa24.87■■□□□ 1.57
CAPNS1-211ENST00000590874 ANP32EQ9BTT0 268 aa24.87■■□□□ 1.57
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC29A3Q9BZD2 475 aa24.87■■□□□ 1.57
CAPNS1-211ENST00000590874 OR52A5Q9H2C5 316 aa24.87■■□□□ 1.57
CAPNS1-211ENST00000590874 FAM96AQ9H5X1 160 aa24.87■■□□□ 1.57
CAPNS1-211ENST00000590874 COG4Q9H9E3 785 aa24.87■■□□□ 1.57
CAPNS1-211ENST00000590874 ALG6Q9Y672 507 aa24.87■■□□□ 1.57
CAPNS1-211ENST00000590874 CCDC66A2RUB6 948 aa24.86■■□□□ 1.57
CAPNS1-211ENST00000590874 C5orf60A6NFR6 353 aa24.86■■□□□ 1.57
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CAPNS1-211ENST00000590874 TMPRSS15P98073 1019 aa24.86■■□□□ 1.57
CAPNS1-211ENST00000590874 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP24.86■■□□□ 1.57
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF658BQ4V348 819 aaPredicted RBP24.86■■□□□ 1.57
CAPNS1-211ENST00000590874 CDHR3Q6ZTQ4 885 aa24.86■■□□□ 1.57
CAPNS1-211ENST00000590874 CCDC50Q8IVM0 306 aa24.86■■□□□ 1.57
CAPNS1-211ENST00000590874 KATNAL2Q8IYT4 538 aa24.86■■□□□ 1.57
CAPNS1-211ENST00000590874 NXPE1Q8N323 547 aa24.86■■□□□ 1.57
CAPNS1-211ENST00000590874 OR52E1Q8NGJ3 308 aa24.86■■□□□ 1.57
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CAPNS1-211ENST00000590874 SLC7A5P2Q9GIP4 190 aa24.86■■□□□ 1.57
CAPNS1-211ENST00000590874 SERTAD3Q9UJW9 196 aa24.86■■□□□ 1.57
CAPNS1-211ENST00000590874 INTUQ9ULD6 942 aa24.86■■□□□ 1.57
CAPNS1-211ENST00000590874 E7EQ34 232 aa24.85■■□□□ 1.57
CAPNS1-211ENST00000590874 CCL22O00626 93 aa24.85■■□□□ 1.57
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF749O43361 778 aa24.85■■□□□ 1.57
CAPNS1-211ENST00000590874 ANXA9O76027 345 aa24.85■■□□□ 1.57
CAPNS1-211ENST00000590874 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP24.85■■□□□ 1.57
CAPNS1-211ENST00000590874 RALBP11234 206 aa24.85■■□□□ 1.57
CAPNS1-211ENST00000590874 ATP1B2P14415 290 aaPredicted RBP24.85■■□□□ 1.57
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP24.85■■□□□ 1.57
CAPNS1-211ENST00000590874 PHC3Q8NDX5 983 aa24.85■■□□□ 1.57
CAPNS1-211ENST00000590874 ULK4Q96C45 1275 aa24.85■■□□□ 1.57
CAPNS1-211ENST00000590874 COPS8Q99627 209 aa24.85■■□□□ 1.57
CAPNS1-211ENST00000590874 TFB2MQ9H5Q4 396 aaKnown RBP24.85■■□□□ 1.57
CAPNS1-211ENST00000590874 XKR8Q9H6D3 395 aa24.85■■□□□ 1.57
CAPNS1-211ENST00000590874 C17orf113A0A1B0GUU1 675 aa24.84■■□□□ 1.57
CAPNS1-211ENST00000590874 C9J4A7 227 aa24.84■■□□□ 1.57
CAPNS1-211ENST00000590874 DDAH2O95865 285 aa24.84■■□□□ 1.57
CAPNS1-211ENST00000590874 PDHA2P29803 388 aa24.84■■□□□ 1.57
CAPNS1-211ENST00000590874 OTX2P32243 289 aa24.84■■□□□ 1.57
CAPNS1-211ENST00000590874 BBS12Q6ZW61 710 aa24.84■■□□□ 1.57
CAPNS1-211ENST00000590874 MRGPREQ86SM8 312 aa24.84■■□□□ 1.57
CAPNS1-211ENST00000590874 RAB43Q86YS6 212 aa24.84■■□□□ 1.57
CAPNS1-211ENST00000590874 RCOR2Q8IZ40 523 aa24.84■■□□□ 1.57
CAPNS1-211ENST00000590874 SNRNP40Q96DI7 357 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
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CAPNS1-211ENST00000590874 HEMGNQ9BXL5 484 aa24.84■■□□□ 1.57
CAPNS1-211ENST00000590874 ACTR10Q9NZ32 417 aa24.84■■□□□ 1.57
CAPNS1-211ENST00000590874 H7C0C1 242 aa24.83■■□□□ 1.57
CAPNS1-211ENST00000590874 KLF7O75840 302 aaPredicted RBP24.83■■□□□ 1.57
CAPNS1-211ENST00000590874 ITGALP20701 1170 aa24.83■■□□□ 1.57
CAPNS1-211ENST00000590874 VARSP26640 1264 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.57
CAPNS1-211ENST00000590874 PSMB4P28070 264 aa24.83■■□□□ 1.57
CAPNS1-211ENST00000590874 ATP5OP48047 213 aa24.83■■□□□ 1.57
CAPNS1-211ENST00000590874 NR6A1Q15406 480 aa24.83■■□□□ 1.57
CAPNS1-211ENST00000590874 KYNUQ16719 465 aa24.83■■□□□ 1.57
CAPNS1-211ENST00000590874 PLEKHN1Q494U1 663 aaPredicted RBP24.83■■□□□ 1.57
CAPNS1-211ENST00000590874 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa24.83■■□□□ 1.57
CAPNS1-211ENST00000590874 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa24.83■■□□□ 1.57
CAPNS1-211ENST00000590874 SNX20Q7Z614 316 aa24.83■■□□□ 1.57
CAPNS1-211ENST00000590874 AMIGO1Q86WK6 493 aa24.83■■□□□ 1.57
CAPNS1-211ENST00000590874 VSTM4Q8IW00 320 aa24.83■■□□□ 1.57
CAPNS1-211ENST00000590874 ADGRF3Q8IZF5 1079 aa24.83■■□□□ 1.57
CAPNS1-211ENST00000590874 KRT35Q92764 455 aa24.83■■□□□ 1.57
CAPNS1-211ENST00000590874 TCTN2Q96GX1 697 aa24.83■■□□□ 1.57
CAPNS1-211ENST00000590874 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP24.83■■□□□ 1.57
CAPNS1-211ENST00000590874 ERRFI1Q9UJM3 462 aaPredicted RBP24.83■■□□□ 1.57
CAPNS1-211ENST00000590874 PADI2Q9Y2J8 665 aa24.83■■□□□ 1.57
CAPNS1-211ENST00000590874 NOTCH2Q04721 2471 aa24.83■■□□□ 1.56
CAPNS1-211ENST00000590874 C2orf74A8MZ97 194 aa24.82■■□□□ 1.56
CAPNS1-211ENST00000590874 CFAP99D6REC4 459 aa24.82■■□□□ 1.56
CAPNS1-211ENST00000590874 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa24.82■■□□□ 1.56
CAPNS1-211ENST00000590874 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP24.82■■□□□ 1.56
CAPNS1-211ENST00000590874 MAP3K7O43318 606 aa24.82■■□□□ 1.56
CAPNS1-211ENST00000590874 CRTAMO95727 393 aa24.82■■□□□ 1.56
CAPNS1-211ENST00000590874 CLDN1O95832 211 aa24.82■■□□□ 1.56
CAPNS1-211ENST00000590874 APOC2P02655 101 aa24.82■■□□□ 1.56
CAPNS1-211ENST00000590874 AGXTP21549 392 aa24.82■■□□□ 1.56
CAPNS1-211ENST00000590874 COL8A1P27658 744 aa24.82■■□□□ 1.56
CAPNS1-211ENST00000590874 CDKN1CP49918 316 aaPredicted RBP24.82■■□□□ 1.56
CAPNS1-211ENST00000590874 HADHBP55084 474 aaKnown RBP24.82■■□□□ 1.56
CAPNS1-211ENST00000590874 PRKG2Q13237 762 aa24.82■■□□□ 1.56
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF787Q6DD87 383 aa24.82■■□□□ 1.56
CAPNS1-211ENST00000590874 SARM1Q6SZW1 724 aa24.82■■□□□ 1.56
CAPNS1-211ENST00000590874 DHRS4Q9BTZ2 278 aa24.82■■□□□ 1.56
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