RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588374.1

EFTUD2-211, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 3

Gene EFTUD2, Length 524 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-211ENST00000588374 WDR74Q6RFH5 385 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 UNC5AQ6ZN44 842 aa6.63□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 CAPN12Q6ZSI9 719 aa6.63□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 FAM92BQ6ZTR7 304 aa6.63□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 CCDC25Q86WR0 208 aa6.63□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 LRRC6Q86X45 466 aa6.63□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 PLXDC1Q8IUK5 500 aa6.63□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 CILP2Q8IUL8 1156 aa6.63□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 SLITRK4Q8IW52 837 aa6.63□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 ZBED8Q8IZ13 594 aa6.63□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 FBXO36Q8NEA4 188 aa6.63□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 OR5AR1Q8NGP9 310 aa6.63□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 GSDMBQ8TAX9 411 aa6.63□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 CALML6Q8TD86 181 aa6.63□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 ZFPM2Q8WW38 1151 aa6.63□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 ASZ1Q8WWH4 475 aa6.63□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 LCN9Q8WX39 176 aa6.63□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 ZCCHC14Q8WYQ9 949 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 LPGAT1Q92604 370 aa6.63□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 RSC1A1Q92681 617 aa6.63□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 GRAMD1AQ96CP6 724 aa6.63□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 NXPE2Q96DL1 559 aa6.63□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 SLC46A1Q96NT5 459 aa6.63□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 BIRC8Q96P09 236 aa6.63□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 TGM7Q96PF1 710 aa6.63□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 PANX3Q96QZ0 392 aa6.63□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 CMKLR1Q99788 373 aa6.63□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 DPYSL5Q9BPU6 564 aa6.63□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 TUBB2BQ9BVA1 445 aa6.63□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 RAB17Q9H0T7 212 aa6.63□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 XKR8Q9H6D3 395 aa6.63□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 UCK1Q9HA47 277 aa6.63□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 SAYSD1Q9NPB0 183 aa6.63□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 INTS10Q9NVR2 710 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 HRASLS2Q9NWW9 162 aa6.63□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 OCIAD1Q9NX40 245 aa6.63□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 GRHL1Q9NZI5 618 aa6.63□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 AKAP7Q9P0M2 348 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 PISDQ9UG56 409 aa6.63□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 CIDEBQ9UHD4 219 aa6.63□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 SLC24A2Q9UI40 661 aa6.63□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 GNPTGQ9UJJ9 305 aa6.63□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 FBXO5Q9UKT4 447 aa6.63□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 ASF1AQ9Y294 204 aa6.63□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 HEBP2Q9Y5Z4 205 aa6.63□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 MRFAP1Q9Y605 127 aa6.63□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 SPEGQ15772 3267 aa6.62□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 AKAP13Q12802 2813 aa6.62□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 CTAGE15A4D2H0 777 aa6.62□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 EFCAB7A8K855 629 aa6.62□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 KPNA5O15131 536 aa6.62□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 KIF1CO43896 1103 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 GPC4O75487 556 aa6.62□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 RASSF9O75901 435 aa6.62□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 ESR1P03372 595 aa6.62□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 CTAGE8P0CG41 777 aa6.62□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 FGF3P11487 239 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 ACADLP28330 430 aa6.62□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 NDUFS1P28331 727 aa6.62□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 SSTR1P30872 391 aa6.62□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 SLC1A2P43004 574 aa6.62□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 ABCG1P45844 678 aa6.62□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 LEPRP48357 1165 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 PPP1CAP62136 330 aa6.62□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 MPP1Q00013 466 aa6.62□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 PLOD1Q02809 727 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 CAV1Q03135 178 aa6.62□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP6.62□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 TMED2Q15363 201 aa6.62□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 ST3GAL2Q16842 350 aa6.62□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 PLEKHS1Q5SXH7 462 aa6.62□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa6.62□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 CACHD1Q5VU97 1274 aa6.62□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 ARMC6Q6NXE6 501 aa6.62□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 ZNF549Q6P9A3 640 aa6.62□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 KLHL35Q6PF15 583 aa6.62□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa6.62□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 OTOAQ7RTW8 1153 aa6.62□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 ARHGAP22Q7Z5H3 698 aa6.62□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 CTAGE6Q86UF2 777 aa6.62□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 PDZD3Q86UT5 571 aa6.62□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 CTAGE4Q8IX94 777 aa6.62□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 LMNTD2Q8IXW0 634 aa6.62□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 TBC1D21Q8IYX1 336 aa6.62□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 LSMEM2Q8N112 164 aa6.62□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 MMGT1Q8N4V1 131 aa6.62□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 C2orf73Q8N5S3 287 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 NOA1Q8NC60 698 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 AGBL5Q8NDL9 886 aa6.62□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 MNS1Q8NEH6 495 aa6.62□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 ACVR1CQ8NER5 493 aa6.62□□□□□ -1.35
EFTUD2-211ENST00000588374 OR52E1Q8NGJ3 308 aa6.62□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.9 ms