RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584229.1

GPS1-223, Transcript of G protein pathway suppressor 1, human

TSL 3

Gene GPS1, Length 535 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GPS1-223	ENST00000584229		A0A1W2PQM1	296 aa		24.32	■■□□□ 1.48
GPS1-223	ENST00000584229	LILRA5	A6NI73	299 aa		24.32	■■□□□ 1.48
GPS1-223	ENST00000584229	B4GAT1	O43505	415 aa		24.32	■■□□□ 1.48
GPS1-223	ENST00000584229	GPC4	O75487	556 aa		24.32	■■□□□ 1.48
GPS1-223	ENST00000584229	AMD1	P17707	334 aa		24.32	■■□□□ 1.48
GPS1-223	ENST00000584229	NDUFS1	P28331	727 aa		24.32	■■□□□ 1.48
GPS1-223	ENST00000584229	CLCN7	P51798	805 aa		24.32	■■□□□ 1.48
GPS1-223	ENST00000584229	PRKG2	Q13237	762 aa		24.32	■■□□□ 1.48
GPS1-223	ENST00000584229	PDAP1	Q13442	181 aa	Known RBP	24.32	■■□□□ 1.48
GPS1-223	ENST00000584229	NR1D2	Q14995	579 aa		24.32	■■□□□ 1.48
GPS1-223	ENST00000584229	UBAP2	Q5T6F2	1119 aa	Known RBP	24.32	■■□□□ 1.48
GPS1-223	ENST00000584229	HECTD2	Q5U5R9	776 aa		24.32	■■□□□ 1.48
GPS1-223	ENST00000584229	RBM44	Q6ZP01	1051 aa	Known RBP	24.32	■■□□□ 1.48
GPS1-223	ENST00000584229	USP53	Q70EK8	1073 aa		24.32	■■□□□ 1.48
GPS1-223	ENST00000584229	PIM3	Q86V86	326 aa		24.32	■■□□□ 1.48
GPS1-223	ENST00000584229	GALNT15	Q8N3T1	639 aa		24.32	■■□□□ 1.48
GPS1-223	ENST00000584229	OR5AR1	Q8NGP9	310 aa		24.32	■■□□□ 1.48
GPS1-223	ENST00000584229	UHMK1	Q8TAS1	419 aa	Known RBP	24.32	■■□□□ 1.48
GPS1-223	ENST00000584229	SLC30A3	Q99726	388 aa		24.32	■■□□□ 1.48
GPS1-223	ENST00000584229	TRIT1	Q9H3H1	467 aa	Known RBP	24.32	■■□□□ 1.48
GPS1-223	ENST00000584229	RDH14	Q9HBH5	336 aa		24.32	■■□□□ 1.48
GPS1-223	ENST00000584229	CLCA2	Q9UQC9	943 aa		24.32	■■□□□ 1.48
GPS1-223	ENST00000584229	CDYL	Q9Y232	598 aa		24.32	■■□□□ 1.48
GPS1-223	ENST00000584229	TDRKH	Q9Y2W6	561 aa	Known RBP	24.32	■■□□□ 1.48
GPS1-223	ENST00000584229	FAM95C	A0A1B0GW59	222 aa		24.31	■■□□□ 1.48
GPS1-223	ENST00000584229	FAM149A	A5PLN7	773 aa		24.31	■■□□□ 1.48
GPS1-223	ENST00000584229	TOP3B	O95985	862 aa	Known RBP	24.31	■■□□□ 1.48
GPS1-223	ENST00000584229	MT-CO3	P00414	261 aa		24.31	■■□□□ 1.48
GPS1-223	ENST00000584229	FAM153B	P0C7A2	387 aa		24.31	■■□□□ 1.48
GPS1-223	ENST00000584229	JUP	P14923	745 aa		24.31	■■□□□ 1.48
GPS1-223	ENST00000584229	TYRP1	P17643	537 aa		24.31	■■□□□ 1.48
GPS1-223	ENST00000584229	MCM3	P25205	808 aa		24.31	■■□□□ 1.48
GPS1-223	ENST00000584229	EPHA4	P54764	986 aa		24.31	■■□□□ 1.48
GPS1-223	ENST00000584229	CDKN2D	P55273	166 aa		24.31	■■□□□ 1.48
GPS1-223	ENST00000584229	GPLD1	P80108	840 aa		24.31	■■□□□ 1.48
GPS1-223	ENST00000584229	UAP1	Q16222	522 aa	Predicted RBP	24.31	■■□□□ 1.48
GPS1-223	ENST00000584229	FAM153C	Q494X1	144 aa		24.31	■■□□□ 1.48
GPS1-223	ENST00000584229	RAB44	Q7Z6P3	723 aa	Predicted RBP	24.31	■■□□□ 1.48
GPS1-223	ENST00000584229	ZC3HC1	Q86WB0	502 aa	Known RBP	24.31	■■□□□ 1.48
GPS1-223	ENST00000584229	RELL1	Q8IUW5	271 aa		24.31	■■□□□ 1.48
GPS1-223	ENST00000584229	GIMAP7	Q8NHV1	300 aa		24.31	■■□□□ 1.48
GPS1-223	ENST00000584229	INPP5D	Q92835	1189 aa		24.31	■■□□□ 1.48
GPS1-223	ENST00000584229	FOPNL	Q96NB1	174 aa		24.31	■■□□□ 1.48
GPS1-223	ENST00000584229	DEPDC7	Q96QD5	511 aa		24.31	■■□□□ 1.48
GPS1-223	ENST00000584229	CPNE1	Q99829	537 aa		24.31	■■□□□ 1.48
GPS1-223	ENST00000584229	RUVBL2	Q9Y230	463 aa	Known RBP	24.31	■■□□□ 1.48
GPS1-223	ENST00000584229		D6RAR5	112 aa		24.3	■■□□□ 1.48
GPS1-223	ENST00000584229	UBXN7	O94888	489 aa		24.3	■■□□□ 1.48
GPS1-223	ENST00000584229	SLCO2B1	O94956	709 aa		24.3	■■□□□ 1.48
GPS1-223	ENST00000584229	ADRB1	P08588	477 aa		24.3	■■□□□ 1.48
GPS1-223	ENST00000584229	MYBL2	P10244	700 aa		24.3	■■□□□ 1.48
GPS1-223	ENST00000584229	SPINK2	P20155	84 aa		24.3	■■□□□ 1.48
GPS1-223	ENST00000584229	GP5	P40197	560 aa		24.3	■■□□□ 1.48
GPS1-223	ENST00000584229	ACSBG2	Q5FVE4	666 aa		24.3	■■□□□ 1.48
GPS1-223	ENST00000584229	SPNS2	Q8IVW8	549 aa		24.3	■■□□□ 1.48
GPS1-223	ENST00000584229	CPNE9	Q8IYJ1	553 aa		24.3	■■□□□ 1.48
GPS1-223	ENST00000584229	CD200R1	Q8TD46	325 aa		24.3	■■□□□ 1.48
GPS1-223	ENST00000584229	NCSTN	Q92542	709 aa		24.3	■■□□□ 1.48
GPS1-223	ENST00000584229	VPS39	Q96JC1	886 aa		24.3	■■□□□ 1.48
GPS1-223	ENST00000584229	RHOJ	Q9H4E5	214 aa		24.3	■■□□□ 1.48
GPS1-223	ENST00000584229	KIR3DX1	Q9H7L2	352 aa		24.3	■■□□□ 1.48
GPS1-223	ENST00000584229	MVB12B	Q9H7P6	319 aa		24.3	■■□□□ 1.48
GPS1-223	ENST00000584229	UCK1	Q9HA47	277 aa		24.3	■■□□□ 1.48
GPS1-223	ENST00000584229	MED16	Q9Y2X0	877 aa		24.3	■■□□□ 1.48
GPS1-223	ENST00000584229	SPTBN2	O15020	2390 aa		24.3	■■□□□ 1.48
GPS1-223	ENST00000584229	TCEA3	O75764	348 aa		24.29	■■□□□ 1.48
GPS1-223	ENST00000584229	CPNE6	O95741	557 aa		24.29	■■□□□ 1.48
GPS1-223	ENST00000584229	RPN2	P04844	631 aa		24.29	■■□□□ 1.48
GPS1-223	ENST00000584229	PROS1	P07225	676 aa		24.29	■■□□□ 1.48
GPS1-223	ENST00000584229	ACADL	P28330	430 aa		24.29	■■□□□ 1.48
GPS1-223	ENST00000584229	TNFRSF8	P28908	595 aa		24.29	■■□□□ 1.48
GPS1-223	ENST00000584229	PMS2	P54278	862 aa		24.29	■■□□□ 1.48
GPS1-223	ENST00000584229	SLC12A2	P55011	1212 aa		24.29	■■□□□ 1.48
GPS1-223	ENST00000584229	NAB1	Q13506	487 aa		24.29	■■□□□ 1.48
GPS1-223	ENST00000584229	KLHL38	Q2WGJ6	581 aa		24.29	■■□□□ 1.48
GPS1-223	ENST00000584229	CYS1	Q717R9	158 aa		24.29	■■□□□ 1.48
GPS1-223	ENST00000584229	ERMP1	Q7Z2K6	904 aa		24.29	■■□□□ 1.48
GPS1-223	ENST00000584229	TMPRSS12	Q86WS5	348 aa		24.29	■■□□□ 1.48
GPS1-223	ENST00000584229	MARCH9	Q86YJ5	346 aa		24.29	■■□□□ 1.48
GPS1-223	ENST00000584229	ACVR1C	Q8NER5	493 aa		24.29	■■□□□ 1.48
GPS1-223	ENST00000584229	CYTH2	Q99418	400 aa		24.29	■■□□□ 1.48
GPS1-223	ENST00000584229	RBBP8	Q99708	897 aa		24.29	■■□□□ 1.48
GPS1-223	ENST00000584229	NUDT22	Q9BRQ3	303 aa		24.29	■■□□□ 1.48
GPS1-223	ENST00000584229	LATS2	Q9NRM7	1088 aa		24.29	■■□□□ 1.48
GPS1-223	ENST00000584229	SLC24A2	Q9UI40	661 aa		24.29	■■□□□ 1.48
GPS1-223	ENST00000584229	DHRS7	Q9Y394	339 aa		24.29	■■□□□ 1.48
GPS1-223	ENST00000584229	AGRP	O00253	132 aa		24.28	■■□□□ 1.48
GPS1-223	ENST00000584229	NTN3	O00634	580 aa	Predicted RBP	24.28	■■□□□ 1.48
GPS1-223	ENST00000584229	CS	O75390	466 aa	Known RBP	24.28	■■□□□ 1.48
GPS1-223	ENST00000584229	FAM155B	O75949	473 aa		24.28	■■□□□ 1.48
GPS1-223	ENST00000584229	CD1C	P29017	333 aa		24.28	■■□□□ 1.48
GPS1-223	ENST00000584229	BDKRB1	P46663	353 aa		24.28	■■□□□ 1.48
GPS1-223	ENST00000584229	ERCC6L	Q2NKX8	1250 aa		24.28	■■□□□ 1.48
GPS1-223	ENST00000584229	SNAP47	Q5SQN1	464 aa		24.28	■■□□□ 1.48
GPS1-223	ENST00000584229	PHF19	Q5T6S3	580 aa		24.28	■■□□□ 1.48
GPS1-223	ENST00000584229	TTC23L	Q6PF05	361 aa		24.28	■■□□□ 1.48
GPS1-223	ENST00000584229	UNC5D	Q6UXZ4	953 aa		24.28	■■□□□ 1.48
GPS1-223	ENST00000584229	TBC1D21	Q8IYX1	336 aa		24.28	■■□□□ 1.48
GPS1-223	ENST00000584229	OR52E1	Q8NGJ3	308 aa		24.28	■■□□□ 1.48
GPS1-223	ENST00000584229	OR5K2	Q8NHB8	316 aa		24.28	■■□□□ 1.48

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