RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568561.5

NME3-211, Transcript of NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene NME3, Length 813 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3-211ENST00000568561 ACVR1CQ8NER5 493 aa15.07■□□□□ 0
NME3-211ENST00000568561 HM13Q8TCT9 377 aa15.07■□□□□ 0
NME3-211ENST00000568561 SSC4DQ8WTU2 575 aa15.07■□□□□ 0
NME3-211ENST00000568561 ZFPM2Q8WW38 1151 aa15.07■□□□□ 0
NME3-211ENST00000568561 DCUN1D1Q96GG9 259 aa15.07■□□□□ 0
NME3-211ENST00000568561 FERD3LQ96RJ6 166 aa15.07■□□□□ 0
NME3-211ENST00000568561 HGH1Q9BTY7 390 aa15.07■□□□□ 0
NME3-211ENST00000568561 NLNQ9BYT8 704 aa15.07■□□□□ 0
NME3-211ENST00000568561 XKR8Q9H6D3 395 aa15.07■□□□□ 0
NME3-211ENST00000568561 C1GALT1Q9NS00 363 aa15.07■□□□□ 0
NME3-211ENST00000568561 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa15.07■□□□□ 0
NME3-211ENST00000568561 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa15.07■□□□□ 0
NME3-211ENST00000568561 HACD1B0YJ81 288 aa15.06■□□□□ 0
NME3-211ENST00000568561 TCP11X1B4DZS4 312 aa15.06■□□□□ 0
NME3-211ENST00000568561 ANXA9O76027 345 aa15.06■□□□□ 0
NME3-211ENST00000568561 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP15.06■□□□□ 07e-7■■■■□ 23.2
NME3-211ENST00000568561 RAB40ALP0C0E4 278 aa15.06■□□□□ 0
NME3-211ENST00000568561 PRSS56P0CW18 603 aa15.06■□□□□ 0
NME3-211ENST00000568561 NDUFS1P28331 727 aa15.06■□□□□ 0
NME3-211ENST00000568561 PRDX3P30048 256 aaKnown RBP15.06■□□□□ 0
NME3-211ENST00000568561 ADRA1AP35348 466 aa15.06■□□□□ 0
NME3-211ENST00000568561 VAV2P52735 878 aa15.06■□□□□ 0
NME3-211ENST00000568561 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP15.06■□□□□ 0
NME3-211ENST00000568561 SPARCL1Q14515 664 aa15.06■□□□□ 0
NME3-211ENST00000568561 EIF2S3LQ2VIR3 472 aaKnown RBP15.06■□□□□ 0
NME3-211ENST00000568561 SLC6A19Q695T7 634 aa15.06■□□□□ 0
NME3-211ENST00000568561 RANBP10Q6VN20 620 aa15.06■□□□□ 0
NME3-211ENST00000568561 BBS12Q6ZW61 710 aa15.06■□□□□ 0
NME3-211ENST00000568561 TRIM73Q86UV7 250 aa15.06■□□□□ 0
NME3-211ENST00000568561 CARFQ8N187 725 aa15.06■□□□□ 0
NME3-211ENST00000568561 ZBTB2Q8N680 514 aa15.06■□□□□ 0
NME3-211ENST00000568561 PHC3Q8NDX5 983 aa15.06■□□□□ 0
NME3-211ENST00000568561 OR52E1Q8NGJ3 308 aa15.06■□□□□ 0
NME3-211ENST00000568561 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP15.06■□□□□ 0
NME3-211ENST00000568561 LINC00615Q96LM1 132 aaPredicted RBP15.06■□□□□ 0
NME3-211ENST00000568561 COG4Q9H9E3 785 aa15.06■□□□□ 0
NME3-211ENST00000568561 CASS4Q9NQ75 786 aa15.06■□□□□ 0
NME3-211ENST00000568561 INTUQ9ULD6 942 aa15.06■□□□□ 0
NME3-211ENST00000568561 CACNA1DQ01668 2161 aa15.06■□□□□ 0
NME3-211ENST00000568561 KRT86O43790 486 aa15.05■□□□□ -0
NME3-211ENST00000568561 DPM1O60762 260 aa15.05■□□□□ -0
NME3-211ENST00000568561 RALBP11234 206 aa15.05■□□□□ -0
NME3-211ENST00000568561 ITGALP20701 1170 aa15.05■□□□□ -0
NME3-211ENST00000568561 PDHA2P29803 388 aa15.05■□□□□ -0
NME3-211ENST00000568561 OTX2P32243 289 aa15.05■□□□□ -0
NME3-211ENST00000568561 MAGEA1P43355 309 aa15.05■□□□□ -0
NME3-211ENST00000568561 CDKN1CP49918 316 aaPredicted RBP15.05■□□□□ -0
NME3-211ENST00000568561 FOXL2P58012 376 aa15.05■□□□□ -0
NME3-211ENST00000568561 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP15.05■□□□□ -0
NME3-211ENST00000568561 PRKG2Q13237 762 aa15.05■□□□□ -0
NME3-211ENST00000568561 NCF4Q15080 339 aa15.05■□□□□ -0
NME3-211ENST00000568561 KYNUQ16719 465 aa15.05■□□□□ -0
NME3-211ENST00000568561 DEFB110Q30KQ9 67 aa15.05■□□□□ -0
NME3-211ENST00000568561 CCDC181Q5TID7 509 aa15.05■□□□□ -0
NME3-211ENST00000568561 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa15.05■□□□□ -0
NME3-211ENST00000568561 CDHR3Q6ZTQ4 885 aa15.05■□□□□ -0
NME3-211ENST00000568561 RCOR2Q8IZ40 523 aa15.05■□□□□ -0
NME3-211ENST00000568561 RBMXL3Q8N7X1 1067 aaKnown RBP15.05■□□□□ -0
NME3-211ENST00000568561 ACTL9Q8TC94 416 aa15.05■□□□□ -0
NME3-211ENST00000568561 C19orf60Q96EN9 201 aa15.05■□□□□ -0
NME3-211ENST00000568561 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa15.05■□□□□ -0
NME3-211ENST00000568561 COPS8Q99627 209 aa15.05■□□□□ -0
NME3-211ENST00000568561 CCM2Q9BSQ5 444 aa15.05■□□□□ -0
NME3-211ENST00000568561 PITPNM3Q9BZ71 974 aa15.05■□□□□ -0
NME3-211ENST00000568561 SLC7A5P2Q9GIP4 190 aa15.05■□□□□ -0
NME3-211ENST00000568561 OR52A5Q9H2C5 316 aa15.05■□□□□ -0
NME3-211ENST00000568561 SLAMF7Q9NQ25 335 aa15.05■□□□□ -0
NME3-211ENST00000568561 GPR83Q9NYM4 423 aa15.05■□□□□ -0
NME3-211ENST00000568561 HEBP2Q9Y5Z4 205 aa15.05■□□□□ -0
NME3-211ENST00000568561 CREBBPQ92793 2442 aa15.04■□□□□ -0
NME3-211ENST00000568561 KLHL33A6NCF5 533 aa15.04■□□□□ -0
NME3-211ENST00000568561 C5orf60A6NFR6 353 aa15.04■□□□□ -0
NME3-211ENST00000568561 AGAP14A8MT82 685 aa15.04■□□□□ -0
NME3-211ENST00000568561 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa15.04■□□□□ -0
NME3-211ENST00000568561 ZNF749O43361 778 aa15.04■□□□□ -0
NME3-211ENST00000568561 HCRTR1O43613 425 aa15.04■□□□□ -0
NME3-211ENST00000568561 APOC2P02655 101 aa15.04■□□□□ -0
NME3-211ENST00000568561 PYGMP11217 842 aa15.04■□□□□ -0
NME3-211ENST00000568561 ATP1B2P14415 290 aaPredicted RBP15.04■□□□□ -0
NME3-211ENST00000568561 MC4RP32245 332 aa15.04■□□□□ -0
NME3-211ENST00000568561 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP15.04■□□□□ -0
NME3-211ENST00000568561 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa15.04■□□□□ -0
NME3-211ENST00000568561 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa15.04■□□□□ -0
NME3-211ENST00000568561 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa15.04■□□□□ -0
NME3-211ENST00000568561 SNX20Q7Z614 316 aa15.04■□□□□ -0
NME3-211ENST00000568561 TMEM151BQ8IW70 566 aa15.04■□□□□ -0
NME3-211ENST00000568561 CLDN19Q8N6F1 224 aa15.04■□□□□ -0
NME3-211ENST00000568561 CCDC110Q8TBZ0 833 aa15.04■□□□□ -0
NME3-211ENST00000568561 ULK4Q96C45 1275 aa15.04■□□□□ -0
NME3-211ENST00000568561 DNAJC1Q96KC8 554 aaKnown RBP15.04■□□□□ -0
NME3-211ENST00000568561 MDC1Q14676 2089 aaKnown RBP15.04■□□□□ -0
NME3-211ENST00000568561 NUP210LQ5VU65 1888 aa15.03■□□□□ -0
NME3-211ENST00000568561 C9J4A7 227 aa15.03■□□□□ -0
NME3-211ENST00000568561 CFAP99D6REC4 459 aa15.03■□□□□ -0
NME3-211ENST00000568561 E7EQ34 232 aa15.03■□□□□ -0
NME3-211ENST00000568561 MASP2O00187 686 aa15.03■□□□□ -0
NME3-211ENST00000568561 MATN2O00339 956 aa15.03■□□□□ -0
NME3-211ENST00000568561 KCNN4O15554 427 aa15.03■□□□□ -0
NME3-211ENST00000568561 CRTAMO95727 393 aa15.03■□□□□ -0
NME3-211ENST00000568561 CTSBP07858 339 aa15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.4 ms