RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567690.5

CCNDBP1-212, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene CCNDBP1, Length 936 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-212ENST00000567690 OR52E1Q8NGJ3 308 aa6.98□□□□□ -1.29
CCNDBP1-212ENST00000567690 DTX3LQ8TDB6 740 aa6.98□□□□□ -1.29
CCNDBP1-212ENST00000567690 LRRC45Q96CN5 670 aa6.98□□□□□ -1.29
CCNDBP1-212ENST00000567690 FERD3LQ96RJ6 166 aa6.98□□□□□ -1.29
CCNDBP1-212ENST00000567690 CD180Q99467 661 aa6.98□□□□□ -1.29
CCNDBP1-212ENST00000567690 TMEM121Q9BTD3 319 aa6.98□□□□□ -1.29
CCNDBP1-212ENST00000567690 TRIM55Q9BYV6 548 aa6.98□□□□□ -1.29
CCNDBP1-212ENST00000567690 RAB33BQ9H082 229 aa6.98□□□□□ -1.29
CCNDBP1-212ENST00000567690 SRMSQ9H3Y6 488 aa6.98□□□□□ -1.29
CCNDBP1-212ENST00000567690 LRRC40Q9H9A6 602 aa6.98□□□□□ -1.29
CCNDBP1-212ENST00000567690 COG4Q9H9E3 785 aa6.98□□□□□ -1.29
CCNDBP1-212ENST00000567690 L2HGDHQ9H9P8 463 aa6.98□□□□□ -1.29
CCNDBP1-212ENST00000567690 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa6.98□□□□□ -1.29
CCNDBP1-212ENST00000567690 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa6.98□□□□□ -1.29
CCNDBP1-212ENST00000567690 TUBD1Q9UJT1 453 aa6.98□□□□□ -1.29
CCNDBP1-212ENST00000567690 KCND3Q9UK17 655 aa6.98□□□□□ -1.29
CCNDBP1-212ENST00000567690 AMFRQ9UKV5 643 aa6.98□□□□□ -1.29
CCNDBP1-212ENST00000567690 POMT2Q9UKY4 750 aa6.98□□□□□ -1.29
CCNDBP1-212ENST00000567690 ACSL5Q9ULC5 683 aa6.98□□□□□ -1.29
CCNDBP1-212ENST00000567690 PADI1Q9ULC6 663 aa6.98□□□□□ -1.29
CCNDBP1-212ENST00000567690 PLAGL1Q9UM63 463 aa6.98□□□□□ -1.29
CCNDBP1-212ENST00000567690 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
CCNDBP1-212ENST00000567690 PTPN13Q12923 2485 aa6.98□□□□□ -1.29
CCNDBP1-212ENST00000567690 ARGFXA6NJG6 315 aa6.97□□□□□ -1.29
CCNDBP1-212ENST00000567690 BTNL10A8MVZ5 291 aa6.97□□□□□ -1.29
CCNDBP1-212ENST00000567690 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
CCNDBP1-212ENST00000567690 BTN3A3O00478 584 aa6.97□□□□□ -1.29
CCNDBP1-212ENST00000567690 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
CCNDBP1-212ENST00000567690 MT-ND3P03897 115 aa6.97□□□□□ -1.29
CCNDBP1-212ENST00000567690 PDGFAP04085 211 aa6.97□□□□□ -1.29
CCNDBP1-212ENST00000567690 ST6GAL1P15907 406 aa6.97□□□□□ -1.29
CCNDBP1-212ENST00000567690 ACRV1P26436 265 aa6.97□□□□□ -1.29
CCNDBP1-212ENST00000567690 NDUFS1P28331 727 aa6.97□□□□□ -1.29
CCNDBP1-212ENST00000567690 HADHAP40939 763 aa6.97□□□□□ -1.29
CCNDBP1-212ENST00000567690 CASRP41180 1078 aa6.97□□□□□ -1.29
CCNDBP1-212ENST00000567690 PMS2P54278 862 aa6.97□□□□□ -1.29
CCNDBP1-212ENST00000567690 TUBB4BP68371 445 aa6.97□□□□□ -1.29
CCNDBP1-212ENST00000567690 PDE1BQ01064 536 aa6.97□□□□□ -1.29
CCNDBP1-212ENST00000567690 TUBB2AQ13885 445 aa6.97□□□□□ -1.29
CCNDBP1-212ENST00000567690 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
CCNDBP1-212ENST00000567690 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
CCNDBP1-212ENST00000567690 PTCHD3Q3KNS1 767 aa6.97□□□□□ -1.29
CCNDBP1-212ENST00000567690 SYTL3Q4VX76 610 aa6.97□□□□□ -1.29
CCNDBP1-212ENST00000567690 TMTC4Q5T4D3 741 aa6.97□□□□□ -1.29
CCNDBP1-212ENST00000567690 CAPRIN2Q6IMN6 1127 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
CCNDBP1-212ENST00000567690 LCN10Q6JVE6 187 aa6.97□□□□□ -1.29
CCNDBP1-212ENST00000567690 CYB5D1Q6P9G0 228 aa6.97□□□□□ -1.29
CCNDBP1-212ENST00000567690 ASB18Q6ZVZ8 466 aa6.97□□□□□ -1.29
CCNDBP1-212ENST00000567690 PRUNE1Q86TP1 453 aa6.97□□□□□ -1.29
CCNDBP1-212ENST00000567690 KMT5CQ86Y97 462 aa6.97□□□□□ -1.29
CCNDBP1-212ENST00000567690 TMEM139Q8IV31 216 aa6.97□□□□□ -1.29
CCNDBP1-212ENST00000567690 D2HGDHQ8N465 521 aa6.97□□□□□ -1.29
CCNDBP1-212ENST00000567690 SLC38A9Q8NBW4 561 aa6.97□□□□□ -1.29
CCNDBP1-212ENST00000567690 ACVR1CQ8NER5 493 aa6.97□□□□□ -1.29
CCNDBP1-212ENST00000567690 OR52K1Q8NGK4 314 aa6.97□□□□□ -1.29
CCNDBP1-212ENST00000567690 OR5AR1Q8NGP9 310 aa6.97□□□□□ -1.29
CCNDBP1-212ENST00000567690 OR1L3Q8NH93 324 aa6.97□□□□□ -1.29
CCNDBP1-212ENST00000567690 ZNF501Q96CX3 271 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
CCNDBP1-212ENST00000567690 CLIP3Q96DZ5 547 aa6.97□□□□□ -1.29
CCNDBP1-212ENST00000567690 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
CCNDBP1-212ENST00000567690 CCM2Q9BSQ5 444 aa6.97□□□□□ -1.29
CCNDBP1-212ENST00000567690 TUBB2BQ9BVA1 445 aa6.97□□□□□ -1.29
CCNDBP1-212ENST00000567690 CHST8Q9H2A9 424 aa6.97□□□□□ -1.29
CCNDBP1-212ENST00000567690 OR52A5Q9H2C5 316 aa6.97□□□□□ -1.29
CCNDBP1-212ENST00000567690 FANCEQ9HB96 536 aa6.97□□□□□ -1.29
CCNDBP1-212ENST00000567690 NLE1Q9NVX2 485 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
CCNDBP1-212ENST00000567690 SEMA5BQ9P283 1151 aa6.97□□□□□ -1.29
CCNDBP1-212ENST00000567690 CIDEBQ9UHD4 219 aa6.97□□□□□ -1.29
CCNDBP1-212ENST00000567690 ANAPC2Q9UJX6 822 aa6.97□□□□□ -1.29
CCNDBP1-212ENST00000567690 TLK1Q9UKI8 766 aa6.97□□□□□ -1.29
CCNDBP1-212ENST00000567690 PLAAQ9Y263 795 aa6.97□□□□□ -1.29
CCNDBP1-212ENST00000567690 EFR3BQ9Y2G0 817 aa6.97□□□□□ -1.29
CCNDBP1-212ENST00000567690 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
CCNDBP1-212ENST00000567690 HEBP2Q9Y5Z4 205 aa6.97□□□□□ -1.29
CCNDBP1-212ENST00000567690 PRSS21Q9Y6M0 314 aa6.97□□□□□ -1.29
CCNDBP1-212ENST00000567690 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa6.97□□□□□ -1.29
CCNDBP1-212ENST00000567690 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa6.97□□□□□ -1.29
CCNDBP1-212ENST00000567690 NBASA2RRP1 2371 aa6.96□□□□□ -1.29
CCNDBP1-212ENST00000567690 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa6.96□□□□□ -1.29
CCNDBP1-212ENST00000567690 IGLV3-16A0A075B6K0 115 aa6.96□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 TRBV5-4A0A0C4DH59 114 aa6.96□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 KLHL33A6NCF5 533 aa6.96□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 AGAP14A8MT82 685 aa6.96□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 C21orf140B9A014 251 aa6.96□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 AP2A1O95782 977 aa6.96□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 IFNB1P01574 187 aa6.96□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 CYP2A7P20853 494 aa6.96□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 GRIA1P42261 906 aa6.96□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 PTGIRP43119 386 aa6.96□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 MLLT10P55197 1068 aa6.96□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 RPS15P62841 145 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 CACNG1Q06432 222 aa6.96□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 KIF5AQ12840 1032 aa6.96□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 KLRB1Q12918 225 aa6.96□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 SNX1Q13596 522 aa6.96□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 SLC9A5Q14940 896 aa6.96□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.7 ms