RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566180.5

RNPS1-218, Transcript of RNA binding protein with serine rich domain 1, humanhuman

TSL 5

Gene RNPS1, Length 814 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNPS1-218ENST00000566180 CES3Q6UWW8 571 aa20.77■□□□□ 0.92
RNPS1-218ENST00000566180 NAPRTQ6XQN6 538 aa20.77■□□□□ 0.92
RNPS1-218ENST00000566180 KMT5CQ86Y97 462 aa20.77■□□□□ 0.92
RNPS1-218ENST00000566180 OR52E1Q8NGJ3 308 aa20.77■□□□□ 0.92
RNPS1-218ENST00000566180 OR6C1Q96RD1 312 aa20.77■□□□□ 0.92
RNPS1-218ENST00000566180 CARD6Q9BX69 1037 aa20.77■□□□□ 0.92
RNPS1-218ENST00000566180 SRMSQ9H3Y6 488 aa20.77■□□□□ 0.92
RNPS1-218ENST00000566180 TMEM184BQ9Y519 407 aaPredicted RBP20.77■□□□□ 0.92
RNPS1-218ENST00000566180 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa20.76■□□□□ 0.91
RNPS1-218ENST00000566180 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP20.76■□□□□ 0.91
RNPS1-218ENST00000566180 STK17BO94768 372 aa20.76■□□□□ 0.91
RNPS1-218ENST00000566180 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP20.76■□□□□ 0.91
RNPS1-218ENST00000566180 RHDQ02161 417 aa20.76■□□□□ 0.91
RNPS1-218ENST00000566180 SYTL3Q4VX76 610 aa20.76■□□□□ 0.91
RNPS1-218ENST00000566180 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP20.76■□□□□ 0.91
RNPS1-218ENST00000566180 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa20.76■□□□□ 0.91
RNPS1-218ENST00000566180 CARFQ8N187 725 aa20.76■□□□□ 0.91
RNPS1-218ENST00000566180 TSSK1BQ9BXA7 367 aa20.76■□□□□ 0.91
RNPS1-218ENST00000566180 P2RY12Q9H244 342 aa20.76■□□□□ 0.91
RNPS1-218ENST00000566180 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP20.76■□□□□ 0.91
RNPS1-218ENST00000566180 ASF1AQ9Y294 204 aa20.76■□□□□ 0.91
RNPS1-218ENST00000566180 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa20.75■□□□□ 0.91
RNPS1-218ENST00000566180 MAGEB16A2A368 324 aa20.75■□□□□ 0.91
RNPS1-218ENST00000566180 IQCF5A8MTL0 148 aa20.75■□□□□ 0.91
RNPS1-218ENST00000566180 MATN2O00339 956 aa20.75■□□□□ 0.91
RNPS1-218ENST00000566180 NDUFS3O75489 264 aa20.75■□□□□ 0.91
RNPS1-218ENST00000566180 FGF5P12034 268 aa20.75■□□□□ 0.91
RNPS1-218ENST00000566180 ITGB6P18564 788 aa20.75■□□□□ 0.91
RNPS1-218ENST00000566180 ARCN1P48444 511 aaKnown RBP20.75■□□□□ 0.91
RNPS1-218ENST00000566180 KPNA2P52292 529 aaKnown RBP20.75■□□□□ 0.91
RNPS1-218ENST00000566180 PRKAA1Q13131 559 aa20.75■□□□□ 0.91
RNPS1-218ENST00000566180 PRKG2Q13237 762 aa20.75■□□□□ 0.91
RNPS1-218ENST00000566180 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP20.75■□□□□ 0.91
RNPS1-218ENST00000566180 MRNIPQ6NTE8 343 aa20.75■□□□□ 0.91
RNPS1-218ENST00000566180 TIPARPQ7Z3E1 657 aaKnown RBP20.75■□□□□ 0.91
RNPS1-218ENST00000566180 LRRC6Q86X45 466 aa20.75■□□□□ 0.91
RNPS1-218ENST00000566180 TBC1D21Q8IYX1 336 aa20.75■□□□□ 0.91
RNPS1-218ENST00000566180 NLGN4XQ8N0W4 816 aa20.75■□□□□ 0.91
RNPS1-218ENST00000566180 IL22RA1Q8N6P7 574 aa20.75■□□□□ 0.91
RNPS1-218ENST00000566180 NAT8LQ8N9F0 302 aa20.75■□□□□ 0.91
RNPS1-218ENST00000566180 SIDT2Q8NBJ9 832 aaKnown RBP20.75■□□□□ 0.91
RNPS1-218ENST00000566180 NLGN4YQ8NFZ3 816 aaPredicted RBP20.75■□□□□ 0.91
RNPS1-218ENST00000566180 OR5AR1Q8NGP9 310 aa20.75■□□□□ 0.91
RNPS1-218ENST00000566180 LKAAEAR1Q8TD35 194 aa20.75■□□□□ 0.91
RNPS1-218ENST00000566180 SERPINB12Q96P63 405 aa20.75■□□□□ 0.91
RNPS1-218ENST00000566180 HGH1Q9BTY7 390 aa20.75■□□□□ 0.91
RNPS1-218ENST00000566180 POMT2Q9UKY4 750 aa20.75■□□□□ 0.91
RNPS1-218ENST00000566180 SDR42E2A6NKP2 422 aa20.74■□□□□ 0.91
RNPS1-218ENST00000566180 GOLGA8MH3BSY2 632 aa20.74■□□□□ 0.91
RNPS1-218ENST00000566180 BTN3A3O00478 584 aa20.74■□□□□ 0.91
RNPS1-218ENST00000566180 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP20.74■□□□□ 0.91
RNPS1-218ENST00000566180 GPC4O75487 556 aa20.74■□□□□ 0.91
RNPS1-218ENST00000566180 DLGAP3O95886 979 aa20.74■□□□□ 0.91
RNPS1-218ENST00000566180 WT1P19544 449 aaPredicted RBP20.74■□□□□ 0.91
RNPS1-218ENST00000566180 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP20.74■□□□□ 0.91
RNPS1-218ENST00000566180 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP20.74■□□□□ 0.91
RNPS1-218ENST00000566180 MAGEA3P43357 314 aa20.74■□□□□ 0.91
RNPS1-218ENST00000566180 PTRHD1Q6GMV3 140 aaKnown RBP20.74■□□□□ 0.91
RNPS1-218ENST00000566180 CASC4Q6P4E1 433 aa20.74■□□□□ 0.91
RNPS1-218ENST00000566180 CYB5D1Q6P9G0 228 aa20.74■□□□□ 0.91
RNPS1-218ENST00000566180 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP20.74■□□□□ 0.91
RNPS1-218ENST00000566180 AMIGO1Q86WK6 493 aa20.74■□□□□ 0.91
RNPS1-218ENST00000566180 SLC22A15Q8IZD6 547 aa20.74■□□□□ 0.91
RNPS1-218ENST00000566180 D2HGDHQ8N465 521 aa20.74■□□□□ 0.91
RNPS1-218ENST00000566180 LSM14AQ8ND56 463 aaKnown RBP20.74■□□□□ 0.91
RNPS1-218ENST00000566180 ASZ1Q8WWH4 475 aa20.74■□□□□ 0.91
RNPS1-218ENST00000566180 SLCO2A1Q92959 643 aa20.74■□□□□ 0.91
RNPS1-218ENST00000566180 NRTNQ99748 197 aa20.74■□□□□ 0.91
RNPS1-218ENST00000566180 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP20.74■□□□□ 0.91
RNPS1-218ENST00000566180 TRIT1Q9H3H1 467 aaKnown RBP20.74■□□□□ 0.91
RNPS1-218ENST00000566180 SAMD15Q9P1V8 674 aa20.74■□□□□ 0.91
RNPS1-218ENST00000566180 POLG2Q9UHN1 485 aa20.74■□□□□ 0.91
RNPS1-218ENST00000566180 CDYLQ9Y232 598 aa20.74■□□□□ 0.91
RNPS1-218ENST00000566180 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa20.73■□□□□ 0.91
RNPS1-218ENST00000566180 GOLGA8KD6RF30 607 aa20.73■□□□□ 0.91
RNPS1-218ENST00000566180 GOLGA8TH3BQL2 631 aa20.73■□□□□ 0.91
RNPS1-218ENST00000566180 ERVH48-1M5A8F1 160 aa20.73■□□□□ 0.91
RNPS1-218ENST00000566180 BTN3A1O00481 513 aa20.73■□□□□ 0.91
RNPS1-218ENST00000566180 ZBTB11O95625 1053 aaPredicted RBP20.73■□□□□ 0.91
RNPS1-218ENST00000566180 FOLR1P15328 257 aa20.73■□□□□ 0.91
RNPS1-218ENST00000566180 PAMP19021 973 aa20.73■□□□□ 0.91
RNPS1-218ENST00000566180 AOAHP28039 575 aa20.73■□□□□ 0.91
RNPS1-218ENST00000566180 ARL4DP49703 201 aa20.73■□□□□ 0.91
RNPS1-218ENST00000566180 HSD11B2P80365 405 aa20.73■□□□□ 0.91
RNPS1-218ENST00000566180 ACY1Q03154 408 aa20.73■□□□□ 0.91
RNPS1-218ENST00000566180 HSPA14Q0VDF9 509 aa20.73■□□□□ 0.91
RNPS1-218ENST00000566180 PPP1R7Q15435 360 aa20.73■□□□□ 0.91
RNPS1-218ENST00000566180 TYSND1Q2T9J0 566 aa20.73■□□□□ 0.91
RNPS1-218ENST00000566180 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP20.73■□□□□ 0.91
RNPS1-218ENST00000566180 PCSK4Q6UW60 755 aa20.73■□□□□ 0.91
RNPS1-218ENST00000566180 CREG2Q8IUH2 290 aa20.73■□□□□ 0.91
RNPS1-218ENST00000566180 PPIL6Q8IXY8 311 aa20.73■□□□□ 0.91
RNPS1-218ENST00000566180 KRT222Q8N1A0 295 aa20.73■□□□□ 0.91
RNPS1-218ENST00000566180 OTUD6BQ8N6M0 293 aa20.73■□□□□ 0.91
RNPS1-218ENST00000566180 OR5K2Q8NHB8 316 aa20.73■□□□□ 0.91
RNPS1-218ENST00000566180 PPM1MQ96MI6 270 aa20.73■□□□□ 0.91
RNPS1-218ENST00000566180 TCF12Q99081 682 aa20.73■□□□□ 0.91
RNPS1-218ENST00000566180 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP20.73■□□□□ 0.91
RNPS1-218ENST00000566180 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP20.73■□□□□ 0.91
RNPS1-218ENST00000566180 ULBP3Q9BZM4 244 aa20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.8 ms