RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561395.5

TPM1-231, Transcript of tropomyosin 1, human

TSL 5

Gene TPM1, Length 673 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TPM1-231	ENST00000561395	AADAT	Q8N5Z0	425 aa		7.39	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	ZBTB2	Q8N680	514 aa		7.39	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	ZNF781	Q8N8C0	355 aa		7.39	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	IL17RC	Q8NAC3	791 aa		7.39	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	OR2T3	Q8NH03	318 aa		7.39	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	RPLP0P6	Q8NHW5	317 aa		7.39	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	STAG3L4	Q8TBR4	150 aa		7.39	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	PIWIL2	Q8TC59	973 aa	Known RBP	7.39	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	CXorf40A	Q8TE69	158 aa		7.39	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	BTN2A2	Q8WVV5	523 aa		7.39	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	CCT6B	Q92526	530 aa		7.39	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	PIGK	Q92643	395 aa		7.39	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	EXT2	Q93063	718 aa		7.39	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	FUBP1	Q96AE4	644 aa	Known RBP	7.39	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	AP2M1	Q96CW1	435 aa		7.39	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	ERLEC1	Q96DZ1	483 aa		7.39	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	NUS1	Q96E22	293 aa		7.39	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	L3HYPDH	Q96EM0	354 aa		7.39	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	DCUN1D1	Q96GG9	259 aa		7.39	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	CRELD1	Q96HD1	420 aa		7.39	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	SPACA7	Q96KW9	195 aa		7.39	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	PANX3	Q96QZ0	392 aa		7.39	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	UBL7	Q96S82	380 aa	Predicted RBP	7.39	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	NUSAP1	Q9BXS6	441 aa	Known RBP	7.39	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	TPSD1	Q9BZJ3	242 aa		7.39	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	CYP4F12	Q9HCS2	524 aa		7.39	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	SPATS2L	Q9NUQ6	558 aa	Known RBP	7.39	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	NCKIPSD	Q9NZQ3	722 aa		7.39	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	RNF112	Q9ULX5	631 aa		7.39	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	COQ6	Q9Y2Z9	468 aa		7.39	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	RAP2C	Q9Y3L5	183 aa		7.39	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	PTPN13	Q12923	2485 aa		7.38	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395		A0A1W2PQF6	199 aa		7.38	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	SUPT3H	B4E1H0	165 aa		7.38	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	EIF3F	O00303	357 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	TSPAN6	O43657	245 aa		7.38	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	SGTA	O43765	313 aa		7.38	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	LZTS3	O60299	673 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	ADAM23	O75077	832 aa		7.38	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	MTX2	O75431	263 aa		7.38	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	SUPT3H	O75486	399 aa		7.38	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	CHRNG	P07510	517 aa		7.38	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	CBSL	P0DN79	551 aa		7.38	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	GFAP	P14136	432 aa		7.38	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	ATP1B2	P14415	290 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	MSH3	P20585	1137 aa		7.38	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	IMPDH1	P20839	514 aa		7.38	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	DGKA	P23743	735 aa		7.38	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	AOAH	P28039	575 aa		7.38	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	CBS	P35520	551 aa		7.38	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	CCR10	P46092	362 aa		7.38	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	HK2	P52789	917 aa		7.38	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	AQP5	P55064	265 aa		7.38	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	TAS2R38	P59533	333 aa		7.38	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	HERVK_113	P63132	956 aa		7.38	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	MRPS21	P82921	87 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	DPT	Q07507	201 aa		7.38	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	PRKAA1	Q13131	559 aa		7.38	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	GBX1	Q14549	363 aa		7.38	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	STARD3	Q14849	445 aa		7.38	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	TTLL9	Q3SXZ7	439 aa		7.38	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	GALNTL6	Q49A17	601 aa		7.38	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	HSF5	Q4G112	596 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	KHDC1	Q4VXA5	237 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	ACSBG2	Q5FVE4	666 aa		7.38	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	ARL13A	Q5H913	290 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	ZNF678	Q5SXM1	525 aa		7.38	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	SDE2	Q6IQ49	451 aa		7.38	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	FRMD7	Q6ZUT3	714 aa		7.38	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	DET1	Q7L5Y6	550 aa		7.38	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	SYT13	Q7L8C5	426 aa		7.38	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	MAVS	Q7Z434	540 aa		7.38	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	ADAMTSL2	Q86TH1	951 aa		7.38	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	NLRP8	Q86W28	1048 aa		7.38	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	CACUL1	Q86Y37	369 aa		7.38	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	GPSM1	Q86YR5	675 aa		7.38	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	WDR75	Q8IWA0	830 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	LSMEM2	Q8N112	164 aa		7.38	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	MYO1H	Q8N1T3	1032 aa		7.38	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	PELI3	Q8N2H9	469 aa		7.38	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	FBXO39	Q8N4B4	442 aa		7.38	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	FITM2	Q8N6M3	262 aa		7.38	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	CCNYL1	Q8N7R7	359 aa		7.38	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	PTGR2	Q8N8N7	351 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	GBP7	Q8N8V2	638 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	GLYATL1	Q969I3	302 aa		7.38	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	FAM131C	Q96AQ9	280 aa		7.38	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	SKA1	Q96BD8	255 aa		7.38	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	PHF21B	Q96EK2	531 aa		7.38	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	MOCOS	Q96EN8	888 aa		7.38	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	CNDP1	Q96KN2	507 aa		7.38	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	TRMO	Q9BU70	441 aa		7.38	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	ERVK-6	Q9BXR3	956 aa		7.38	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	GSTO2	Q9H4Y5	243 aa		7.38	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	STN1	Q9H668	368 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	CD248	Q9HCU0	757 aa		7.38	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	ACSS2	Q9NR19	701 aa		7.38	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	PNPO	Q9NVS9	261 aa		7.38	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	DNAJC28	Q9NX36	388 aa		7.38	□□□□□ -1.23
TPM1-231	ENST00000561395	KCTD5	Q9NXV2	234 aa		7.38	□□□□□ -1.23

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