RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557076.5

SCFD1-223, Transcript of sec1 family domain containing 1, human

TSL 3

Gene SCFD1, Length 743 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SCFD1-223	ENST00000557076	CXCR3	P49682	368 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076	MXI1	P50539	228 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076	SUMO1	P63165	101 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076	GNA12	Q03113	381 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076	HGFAC	Q04756	655 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076	LAMB3	Q13751	1172 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076	TAF5	Q15542	800 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076	MEA1	Q16626	185 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076	INO80D	Q53TQ3	878 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076	BRMS1L	Q5PSV4	323 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076	CHCHD2P9	Q5T1J5	151 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076	TMEM270	Q6UE05	265 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076	TFAP2D	Q7Z6R9	452 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076	KCNMB4	Q86W47	210 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076	PLXDC1	Q8IUK5	500 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076	GPR135	Q8IZ08	494 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076	GUF1	Q8N442	669 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076	SFRP1	Q8N474	314 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076	KIAA0895	Q8NCT3	520 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076	OR6K2	Q8NGY2	324 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076	CT55	Q8WUE5	264 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076	ITLN2	Q8WWU7	325 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076	PATE1	Q8WXA2	126 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076	ARHGEF2	Q92974	986 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076	DHX58	Q96C10	678 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076	C14orf79	Q96F83	325 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076	ZNF641	Q96N77	438 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076	NUDT9	Q9BW91	350 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076	SPATA9	Q9BWV2	254 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076	TTYH3	Q9C0H2	523 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076	BLZF1	Q9H2G9	400 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076	WDCP	Q9H6R7	721 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076	FAM204A	Q9H8W3	233 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076	SARS2	Q9NP81	518 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076	PCDH12	Q9NPG4	1184 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076	ASNSD1	Q9NWL6	643 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076	ARHGEF38	Q9NXL2	777 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076	GPR83	Q9NYM4	423 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076	MPP6	Q9NZW5	540 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076	ZNHIT2	Q9UHR6	403 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076	HPCAL4	Q9UM19	191 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076	ATR	Q13535	2644 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076	FBN1	P35555	2871 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076	TSPAN11	A1L157	253 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076	RASA4B	C9J798	803 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076		I6L893	689 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076	POLR2D	O15514	142 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076	TEX33	O43247	280 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076	RASA4	O43374	803 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076	GRID2	O43424	1007 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076	KLHL41	O60662	606 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076	HSF2BP	O75031	334 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076	SRGAP2	O75044	1071 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076	MPIG6B	O95866	241 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076	F9	P00740	461 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076	C9	P02748	559 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076	IVL	P07476	585 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076	PLEK	P08567	350 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076	MYCLP1	P12525	358 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076	NR2F2	P24468	414 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076	CASP1	P29466	404 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076	JAM2	P57087	298 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076	KRTAP10-9	P60411	292 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076	CD83	Q01151	205 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076	GUCY1A3	Q02108	690 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076	CEBPZ	Q03701	1054 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076	CHAF1B	Q13112	559 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076	NME3	Q13232	169 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076	CUL4B	Q13620	913 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076	GRM3	Q14832	879 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076	KRTAP15-1	Q3LI76	137 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076	LRRC73	Q5JTD7	316 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076	ATXN7L2	Q5T6C5	722 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076	VWA5B1	Q5TIE3	1220 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076	LYPLAL1	Q5VWZ2	237 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076	IZUMO3	Q5VZ72	239 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076	AFMID	Q63HM1	303 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076	ERAP2	Q6P179	960 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076	CYB5D1	Q6P9G0	228 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076	IYD	Q6PHW0	289 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076	BRAT1	Q6PJG6	821 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076	SLC30A9	Q6PML9	568 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076	XKRX	Q6PP77	449 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076	ZNF517	Q6ZMY9	492 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076		Q6ZS92	163 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076	PPP1R3B	Q86XI6	285 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076	RASGRP3	Q8IV61	690 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076	DEFB106A	Q8N104	65 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076	OR14K1	Q8NGZ2	314 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076	CASKIN2	Q8WXE0	1202 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076	NT5C3B	Q969T7	300 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076	PGAP3	Q96FM1	320 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076	C9orf72	Q96LT7	481 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076	GDAP1L1	Q96MZ0	367 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076	TEX101	Q9BY14	249 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076	LDHAL6B	Q9BYZ2	381 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076	FRMD8	Q9BZ67	464 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076	BRD8	Q9H0E9	1235 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076	TKTL2	Q9H0I9	626 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076	MAGEH1	Q9H213	219 aa		4.64	□□□□□ -1.67

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