RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555562.1

FOXN3-AS1-201, FOXN3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene FOXN3-AS1, Length 1,077 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 OR8K5Q8NH50 307 aa18.92■□□□□ 0.62
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP18.92■□□□□ 0.62
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP18.92■□□□□ 0.62
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 GAPDHSO14556 408 aaPredicted RBP18.91■□□□□ 0.62
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 GPR39O43194 453 aa18.91■□□□□ 0.62
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 BUD23O43709 281 aaKnown RBP18.91■□□□□ 0.62
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TCP1P17987 556 aaKnown RBP18.91■□□□□ 0.62
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TUBB4BP68371 445 aa18.91■□□□□ 0.62
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 LAMB3Q13751 1172 aa18.91■□□□□ 0.62
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TUBB2AQ13885 445 aa18.91■□□□□ 0.62
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CYP1B1Q16678 543 aa18.91■□□□□ 0.62
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TMTC4Q5T4D3 741 aa18.91■□□□□ 0.62
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ARMC6Q6NXE6 501 aa18.91■□□□□ 0.62
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 FAM199XQ6PEV8 388 aaPredicted RBP18.91■□□□□ 0.62
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CERS6Q6ZMG9 384 aa18.91■□□□□ 0.62
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 OOSP2Q86WS3 158 aa18.91■□□□□ 0.62
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa18.91■□□□□ 0.62
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 C19orf43Q9BQ61 176 aa18.91■□□□□ 0.62
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TUBB2BQ9BVA1 445 aa18.91■□□□□ 0.62
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ARNT2Q9HBZ2 717 aa18.91■□□□□ 0.62
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PAK5Q9P286 719 aa18.91■□□□□ 0.62
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 FARSAQ9Y285 508 aaKnown RBP18.91■□□□□ 0.62
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP18.91■□□□□ 0.62
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP18.9■□□□□ 0.62
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP18.9■□□□□ 0.62
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ZNF185O15231 689 aa18.9■□□□□ 0.62
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CPNE3O75131 537 aaKnown RBP18.9■□□□□ 0.62
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 METTL18O95568 372 aa18.9■□□□□ 0.62
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ZBTB11O95625 1053 aaPredicted RBP18.9■□□□□ 0.62
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 AP2A1O95782 977 aa18.9■□□□□ 0.62
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PBLDP30039 288 aaPredicted RBP18.9■□□□□ 0.62
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 AKT1P31749 480 aa18.9■□□□□ 0.62
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SPARCL1Q14515 664 aa18.9■□□□□ 0.62
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa18.9■□□□□ 0.62
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 OR4K2Q8NGD2 314 aa18.9■□□□□ 0.62
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 OR2L2Q8NH16 312 aa18.9■□□□□ 0.62
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 C12orf66Q96MD2 445 aa18.9■□□□□ 0.62
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RUFY1Q96T51 708 aa18.9■□□□□ 0.62
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP18.9■□□□□ 0.62
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TRIM55Q9BYV6 548 aa18.9■□□□□ 0.62
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 WWP1Q9H0M0 922 aa18.9■□□□□ 0.62
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SLC24A2Q9UI40 661 aa18.9■□□□□ 0.62
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ARL5AQ9Y689 179 aa18.9■□□□□ 0.62
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP18.9■□□□□ 0.62
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa18.9■□□□□ 0.62
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP18.9■□□□□ 0.62
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 OR6C74A6NCV1 312 aa18.89■□□□□ 0.61
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SCRG1O75711 98 aa18.89■□□□□ 0.61
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 DNAJB5O75953 348 aa18.89■□□□□ 0.61
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PRAMEF1O95521 474 aa18.89■□□□□ 0.61
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PDGFAP04085 211 aa18.89■□□□□ 0.61
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RALBP11234 206 aa18.89■□□□□ 0.61
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ETF1P62495 437 aaKnown RBP18.89■□□□□ 0.61
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 KCTD11Q693B1 232 aa18.89■□□□□ 0.61
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ZNF517Q6ZMY9 492 aaPredicted RBP18.89■□□□□ 0.61
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 DET1Q7L5Y6 550 aa18.89■□□□□ 0.61
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CREG2Q8IUH2 290 aa18.89■□□□□ 0.61
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TMEM126BQ8IUX1 230 aa18.89■□□□□ 0.61
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 DNAAF3Q8N9W5 541 aa18.89■□□□□ 0.61
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 GLIS1Q8NBF1 620 aa18.89■□□□□ 0.61
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MR1Q95460 341 aa18.89■□□□□ 0.61
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ULK4Q96C45 1275 aa18.89■□□□□ 0.61
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ZNF501Q96CX3 271 aaPredicted RBP18.89■□□□□ 0.61
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 LINC00615Q96LM1 132 aaPredicted RBP18.89■□□□□ 0.61
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 KIR3DX1Q9H7L2 352 aa18.89■□□□□ 0.61
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 LATS2Q9NRM7 1088 aa18.89■□□□□ 0.61
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa18.89■□□□□ 0.61
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RP1L1Q8IWN7 2480 aaPredicted RBP18.88■□□□□ 0.61
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CTAGE9A4FU28 777 aa18.88■□□□□ 0.61
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TTLL8A6PVC2 850 aa18.88■□□□□ 0.61
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 KLK3P07288 261 aaPredicted RBP18.88■□□□□ 0.61
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SLC35G4P0C7Q5 338 aa18.88■□□□□ 0.61
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ITGALP20701 1170 aa18.88■□□□□ 0.61
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PGDP52209 483 aa18.88■□□□□ 0.61
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RPS18P62269 152 aaKnown RBP18.88■□□□□ 0.61
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PTPRCAPQ14761 206 aa18.88■□□□□ 0.61
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 BCL7AQ4VC05 210 aa18.88■□□□□ 0.61
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 IZUMO3Q5VZ72 239 aa18.88■□□□□ 0.61
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP18.88■□□□□ 0.61
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 DCUN1D1Q96GG9 259 aa18.88■□□□□ 0.61
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 LRFN5Q96NI6 719 aa18.88■□□□□ 0.61
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CCM2Q9BSQ5 444 aa18.88■□□□□ 0.61
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ASB8Q9H765 288 aa18.88■□□□□ 0.61
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MLXIPLQ9NP71 852 aa18.88■□□□□ 0.61
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RAB6BQ9NRW1 208 aa18.88■□□□□ 0.61
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 BTRCQ9Y297 605 aa18.88■□□□□ 0.61
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PCDHGA9Q9Y5G4 932 aaKnown RBP18.88■□□□□ 0.61
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SAR1BQ9Y6B6 198 aa18.88■□□□□ 0.61
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 VPS4BO75351 444 aa18.87■□□□□ 0.61
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SRP72O76094 671 aaKnown RBP18.87■□□□□ 0.61
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 NDUFS1P28331 727 aa18.87■□□□□ 0.61
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 KCNJ1P48048 391 aa18.87■□□□□ 0.61
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 KPNA2P52292 529 aaKnown RBP18.87■□□□□ 0.61
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CDH17Q12864 832 aa18.87■□□□□ 0.61
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 GPS2Q13227 327 aa18.87■□□□□ 0.61
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP18.87■□□□□ 0.61
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 KRT33BQ14525 404 aa18.87■□□□□ 0.61
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 GPR19Q15760 415 aa18.87■□□□□ 0.61
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CAPRIN2Q6IMN6 1127 aaKnown RBP18.87■□□□□ 0.61
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.7 ms