RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552688.5

CS-233, Transcript of citrate synthase, human

TSL 4

Gene CS, Length 580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-233	ENST00000552688	ZNF787	Q6DD87	383 aa		6.68	□□□□□ -1.34
CS-233	ENST00000552688	IGFL3	Q6UXB1	125 aa		6.68	□□□□□ -1.34
CS-233	ENST00000552688	C11orf96	Q7Z7L8	435 aa		6.68	□□□□□ -1.34
CS-233	ENST00000552688	OOSP2	Q86WS3	158 aa		6.68	□□□□□ -1.34
CS-233	ENST00000552688	VSIG1	Q86XK7	387 aa		6.68	□□□□□ -1.34
CS-233	ENST00000552688	TRAPPC5	Q8IUR0	188 aa		6.68	□□□□□ -1.34
CS-233	ENST00000552688	DSEL	Q8IZU8	1212 aa		6.68	□□□□□ -1.34
CS-233	ENST00000552688	SLC25A41	Q8N5S1	370 aa		6.68	□□□□□ -1.34
CS-233	ENST00000552688	RBMXL3	Q8N7X1	1067 aa	Known RBP	6.68	□□□□□ -1.34
CS-233	ENST00000552688		Q8NA96	180 aa		6.68	□□□□□ -1.34
CS-233	ENST00000552688	IPMK	Q8NFU5	416 aa		6.68	□□□□□ -1.34
CS-233	ENST00000552688	TM9SF4	Q92544	642 aa		6.68	□□□□□ -1.34
CS-233	ENST00000552688	ZNF501	Q96CX3	271 aa	Predicted RBP	6.68	□□□□□ -1.34
CS-233	ENST00000552688	SNRNP40	Q96DI7	357 aa	Known RBP	6.68	□□□□□ -1.34
CS-233	ENST00000552688	SGSM3	Q96HU1	749 aa		6.68	□□□□□ -1.34
CS-233	ENST00000552688	TRIB3	Q96RU7	358 aa		6.68	□□□□□ -1.34
CS-233	ENST00000552688	RUFY1	Q96T51	708 aa		6.68	□□□□□ -1.34
CS-233	ENST00000552688	NAPG	Q99747	312 aa	Predicted RBP	6.68	□□□□□ -1.34
CS-233	ENST00000552688	C17orf62	Q9BQA9	187 aa		6.68	□□□□□ -1.34
CS-233	ENST00000552688	DHRS4	Q9BTZ2	278 aa		6.68	□□□□□ -1.34
CS-233	ENST00000552688	CHST8	Q9H2A9	424 aa		6.68	□□□□□ -1.34
CS-233	ENST00000552688	TRABD	Q9H4I3	376 aa		6.68	□□□□□ -1.34
CS-233	ENST00000552688	RUBCNL	Q9H714	662 aa		6.68	□□□□□ -1.34
CS-233	ENST00000552688	GLOD4	Q9HC38	313 aa		6.68	□□□□□ -1.34
CS-233	ENST00000552688	ARFGAP3	Q9NP61	516 aa		6.68	□□□□□ -1.34
CS-233	ENST00000552688	PIH1D1	Q9NWS0	290 aa	Known RBP	6.68	□□□□□ -1.34
CS-233	ENST00000552688	HRASLS2	Q9NWW9	162 aa		6.68	□□□□□ -1.34
CS-233	ENST00000552688	MAP10	Q9P2G4	905 aa		6.68	□□□□□ -1.34
CS-233	ENST00000552688	SNX12	Q9UMY4	172 aa		6.68	□□□□□ -1.34
CS-233	ENST00000552688	SHOC2	Q9UQ13	582 aa		6.68	□□□□□ -1.34
CS-233	ENST00000552688	BTRC	Q9Y297	605 aa		6.68	□□□□□ -1.34
CS-233	ENST00000552688	B3GNT3	Q9Y2A9	372 aa		6.68	□□□□□ -1.34
CS-233	ENST00000552688	WDR37	Q9Y2I8	494 aa		6.68	□□□□□ -1.34
CS-233	ENST00000552688	ZNF711	Q9Y462	761 aa		6.68	□□□□□ -1.34
CS-233	ENST00000552688	JRKL	Q9Y4A0	524 aa		6.68	□□□□□ -1.34
CS-233	ENST00000552688	CCDC78	A2IDD5	438 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CS-233	ENST00000552688	CTAGE9	A4FU28	777 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CS-233	ENST00000552688	ANKUB1	A6NFN9	424 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CS-233	ENST00000552688	MTX2	O75431	263 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CS-233	ENST00000552688	POP7	O75817	140 aa	Known RBP	6.67	□□□□□ -1.34
CS-233	ENST00000552688	METTL18	O95568	372 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CS-233	ENST00000552688	HBQ1	P09105	142 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CS-233	ENST00000552688	BPI	P17213	487 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CS-233	ENST00000552688	AGXT	P21549	392 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CS-233	ENST00000552688	MSN	P26038	577 aa	Known RBP	6.67	□□□□□ -1.34
CS-233	ENST00000552688	COL8A1	P27658	744 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CS-233	ENST00000552688	NDUFS1	P28331	727 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CS-233	ENST00000552688	TNFRSF8	P28908	595 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CS-233	ENST00000552688	CASQ1	P31415	396 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CS-233	ENST00000552688	PER3	P56645	1201 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CS-233	ENST00000552688	PRKAA1	Q13131	559 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CS-233	ENST00000552688	SSPN	Q14714	243 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CS-233	ENST00000552688	RPE65	Q16518	533 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CS-233	ENST00000552688	PLEKHN1	Q494U1	663 aa	Predicted RBP	6.67	□□□□□ -1.34
CS-233	ENST00000552688	ATP13A5	Q4VNC0	1218 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CS-233	ENST00000552688	TEX44	Q53QW1	395 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CS-233	ENST00000552688	PRR30	Q53SZ7	412 aa	Predicted RBP	6.67	□□□□□ -1.34
CS-233	ENST00000552688	ANKRD20A2	Q5SQ80	823 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CS-233	ENST00000552688	PLEKHS1	Q5SXH7	462 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CS-233	ENST00000552688	ANKRD20A1	Q5TYW2	823 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CS-233	ENST00000552688	ANKRD20A3	Q5VUR7	823 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CS-233	ENST00000552688	LYPLAL1	Q5VWZ2	237 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CS-233	ENST00000552688	METRNL	Q641Q3	311 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CS-233	ENST00000552688	TTC27	Q6P3X3	843 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CS-233	ENST00000552688	ARHGEF18	Q6ZSZ5	1173 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CS-233	ENST00000552688	BZW1	Q7L1Q6	419 aa	Known RBP	6.67	□□□□□ -1.34
CS-233	ENST00000552688	GSTA5	Q7RTV2	222 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CS-233	ENST00000552688	RAB43	Q86YS6	212 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CS-233	ENST00000552688	KLHL7	Q8IXQ5	586 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CS-233	ENST00000552688	ENDOV	Q8N8Q3	282 aa	Known RBP	6.67	□□□□□ -1.34
CS-233	ENST00000552688	PRELID2	Q8N945	189 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CS-233	ENST00000552688	SLC38A9	Q8NBW4	561 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CS-233	ENST00000552688	CLEC1A	Q8NC01	280 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CS-233	ENST00000552688	GDAP1	Q8TB36	358 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CS-233	ENST00000552688	SLC35B2	Q8TB61	432 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CS-233	ENST00000552688	CLIP3	Q96DZ5	547 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CS-233	ENST00000552688	MOCOS	Q96EN8	888 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CS-233	ENST00000552688	RNF31	Q96EP0	1072 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CS-233	ENST00000552688	IMP4	Q96G21	291 aa	Known RBP	6.67	□□□□□ -1.34
CS-233	ENST00000552688	TCTN2	Q96GX1	697 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CS-233	ENST00000552688	OXNAD1	Q96HP4	312 aa	Predicted RBP	6.67	□□□□□ -1.34
CS-233	ENST00000552688	TEKT5	Q96M29	485 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CS-233	ENST00000552688	FER1L6-AS2	Q96M78	137 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CS-233	ENST00000552688	BARD1	Q99728	777 aa	Known RBP	6.67	□□□□□ -1.34
CS-233	ENST00000552688	GORASP1	Q9BQQ3	440 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CS-233	ENST00000552688	FICD	Q9BVA6	458 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CS-233	ENST00000552688	NUDT9	Q9BW91	350 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CS-233	ENST00000552688	SLC25A51	Q9H1U9	297 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CS-233	ENST00000552688	AGPAT4	Q9NRZ5	378 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CS-233	ENST00000552688	C1GALT1	Q9NS00	363 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CS-233	ENST00000552688	ASF1B	Q9NVP2	202 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CS-233	ENST00000552688	SERTAD3	Q9UJW9	196 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CS-233	ENST00000552688	ACSL5	Q9ULC5	683 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CS-233	ENST00000552688	ZNF148	Q9UQR1	794 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CS-233	ENST00000552688	PADI2	Q9Y2J8	665 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CS-233	ENST00000552688	ZKSCAN5	Q9Y2L8	839 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CS-233	ENST00000552688	COLEC10	Q9Y6Z7	277 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CS-233	ENST00000552688	ICE1	Q9Y2F5	2266 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CS-233	ENST00000552688	SPTAN1	Q13813	2472 aa	Known RBP	6.66	□□□□□ -1.34
CS-233	ENST00000552688		A6NL46	340 aa		6.66	□□□□□ -1.34

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