RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549143.5

CS-215, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 2,811 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-215ENST00000549143 TBC1D3EA0A087X179 549 aa8.25□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 TBC1D3KA0A087X1G2 549 aa8.25□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 TBC1D3FA6NER0 549 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 TBC1D3LB9A6J9 549 aa8.25□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 SLC31A1O15431 190 aa8.25□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 TM7SF2O76062 418 aa8.25□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 FGF4P08620 206 aa8.25□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 TBC1D3HP0C7X1 549 aa8.25□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 ENO3P13929 434 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 HTR6P50406 440 aa8.25□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 MNAT1P51948 309 aa8.25□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 DIO3P55073 304 aa8.25□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 FASTKQ14296 549 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 INPP5AQ14642 412 aa8.25□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 NAA25Q14CX7 972 aa8.25□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 PTCHD3Q3KNS1 767 aa8.25□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 MMEL1Q495T6 779 aa8.25□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 AGBL4Q5VU57 503 aa8.25□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 KANK2Q63ZY3 851 aa8.25□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 TBC1D3GQ6DHY5 549 aa8.25□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 TBC1D3CQ6IPX1 549 aa8.25□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP8.25□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 TBC1D3Q8IZP1 549 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 PPFIBP2Q8ND30 876 aa8.25□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 MCOLN3Q8TDD5 553 aa8.25□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 ASB11Q8WXH4 323 aa8.25□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 RCN3Q96D15 328 aa8.25□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 MED8Q96G25 268 aa8.25□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 MAELQ96JY0 434 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 NPAS2Q99743 824 aa8.25□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 TMEM79Q9BSE2 394 aa8.25□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 CD244Q9BZW8 370 aa8.25□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 PARVBQ9HBI1 364 aa8.25□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 FZD3Q9NPG1 666 aa8.25□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 KLQ9UEF7 1012 aa8.25□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 POLG2Q9UHN1 485 aa8.25□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 PSMD13Q9UNM6 376 aa8.25□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 SLC22A14Q9Y267 594 aa8.25□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 L3MBTL1Q9Y468 752 aa8.25□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 PCYT1BQ9Y5K3 369 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 LOC730098B7Z3J9 87 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 PSMD11O00231 422 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 PSMD12O00232 456 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 OR7A17O14581 309 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 LATO43561 262 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 NARSO43776 548 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 MGRN1O60291 552 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 WDR47O94967 919 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 ATP6V1G2O95670 118 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 ALDOCP09972 364 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 THRAP10827 490 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 EPB42P16452 691 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 ZNF8P17098 575 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 HMOX2P30519 316 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 NTSR1P30989 418 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 NFE2L1Q14494 772 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 ZXDCQ2QGD7 858 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 WSCD2Q2TBF2 565 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 SULT1C3Q6IMI6 304 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 NRSN1Q8IZ57 195 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 SLC44A3Q8N4M1 653 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 PDPRQ8NCN5 879 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 WDR60Q8WVS4 1066 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 NECTIN4Q96NY8 510 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 CCM2Q9BSQ5 444 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 CCDC28BQ9BUN5 200 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 RSPH9Q9H1X1 276 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 ACTR8Q9H981 624 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 CD93Q9NPY3 652 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 MBNL1Q9NR56 388 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 TM7SF3Q9NS93 570 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 FARSBQ9NSD9 589 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 RNF11Q9Y3C5 154 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 TRPM6Q9BX84 2022 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 GRXCR2A6NFK2 248 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 H3BM21 787 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 NUAK1O60285 661 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 ADAM23O75077 832 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 POP7O75817 140 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 OTCP00480 354 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 DNTTP04053 509 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 CBSLP0DN79 551 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 UROSP10746 265 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 TCN1P20061 433 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 RPL10P27635 214 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 CBSP35520 551 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 BDKRB1P46663 353 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 STX1BP61266 288 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP8.24□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 SGCGQ13326 291 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 ART3Q13508 389 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.6 ms