RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533342.5

ANKRD42-209, Transcript of ankyrin repeat domain 42, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene ANKRD42, Length 1,949 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD42-209ENST00000533342 LOC101059948A0A1B0GTJ6 334 aa10.52□□□□□ -0.72
ANKRD42-209ENST00000533342 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP10.52□□□□□ -0.72
ANKRD42-209ENST00000533342 BTN3A1O00481 513 aa10.52□□□□□ -0.72
ANKRD42-209ENST00000533342 STK17BO94768 372 aa10.52□□□□□ -0.72
ANKRD42-209ENST00000533342 OR56A5P0C7T3 313 aa10.52□□□□□ -0.72
ANKRD42-209ENST00000533342 FMO4P31512 558 aa10.52□□□□□ -0.72
ANKRD42-209ENST00000533342 NPY2RP49146 381 aa10.52□□□□□ -0.72
ANKRD42-209ENST00000533342 HSPA14Q0VDF9 509 aa10.52□□□□□ -0.72
ANKRD42-209ENST00000533342 ITIH4Q14624 930 aa10.52□□□□□ -0.72
ANKRD42-209ENST00000533342 ZNF789Q5FWF6 425 aa10.52□□□□□ -0.72
ANKRD42-209ENST00000533342 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP10.52□□□□□ -0.72
ANKRD42-209ENST00000533342 ARMC6Q6NXE6 501 aa10.52□□□□□ -0.72
ANKRD42-209ENST00000533342 PACS1Q6VY07 963 aa10.52□□□□□ -0.72
ANKRD42-209ENST00000533342 TAX1BP1Q86VP1 789 aa10.52□□□□□ -0.72
ANKRD42-209ENST00000533342 OOSP2Q86WS3 158 aa10.52□□□□□ -0.72
ANKRD42-209ENST00000533342 RASGRP3Q8IV61 690 aa10.52□□□□□ -0.72
ANKRD42-209ENST00000533342 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP10.52□□□□□ -0.72
ANKRD42-209ENST00000533342 GALNT6Q8NCL4 622 aa10.52□□□□□ -0.72
ANKRD42-209ENST00000533342 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa10.52□□□□□ -0.72
ANKRD42-209ENST00000533342 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP10.52□□□□□ -0.72
ANKRD42-209ENST00000533342 PWWP2AQ96N64 755 aa10.52□□□□□ -0.72
ANKRD42-209ENST00000533342 DDA1Q9BW61 102 aa10.52□□□□□ -0.72
ANKRD42-209ENST00000533342 SRMSQ9H3Y6 488 aa10.52□□□□□ -0.72
ANKRD42-209ENST00000533342 ZNF768Q9H5H4 540 aaKnown RBP10.52□□□□□ -0.72
ANKRD42-209ENST00000533342 VPS37BQ9H9H4 285 aa10.52□□□□□ -0.72
ANKRD42-209ENST00000533342 HOMER3Q9NSC5 361 aa10.52□□□□□ -0.72
ANKRD42-209ENST00000533342 ASF1AQ9Y294 204 aa10.52□□□□□ -0.72
ANKRD42-209ENST00000533342 C17orf113A0A1B0GUU1 675 aa10.52□□□□□ -0.73
ANKRD42-209ENST00000533342 SLC5A10A0PJK1 596 aa10.52□□□□□ -0.73
ANKRD42-209ENST00000533342 SLC9B1P1A6NJY1 282 aa10.52□□□□□ -0.73
ANKRD42-209ENST00000533342 K7ENP7 123 aa10.52□□□□□ -0.73
ANKRD42-209ENST00000533342 KIAA0754O94854 1291 aa10.52□□□□□ -0.73
ANKRD42-209ENST00000533342 AP2A2O94973 939 aa10.52□□□□□ -0.73
ANKRD42-209ENST00000533342 FTH1P02794 183 aa10.52□□□□□ -0.73
ANKRD42-209ENST00000533342 TPBGLP0DKB5 382 aa10.52□□□□□ -0.73
ANKRD42-209ENST00000533342 ARL4DP49703 201 aa10.52□□□□□ -0.73
ANKRD42-209ENST00000533342 PPP1R7Q15435 360 aa10.52□□□□□ -0.73
ANKRD42-209ENST00000533342 CYP1B1Q16678 543 aa10.52□□□□□ -0.73
ANKRD42-209ENST00000533342 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP10.52□□□□□ -0.73
ANKRD42-209ENST00000533342 ATP1A1-AS1Q5TC04 95 aa10.52□□□□□ -0.73
ANKRD42-209ENST00000533342 PTRHD1Q6GMV3 140 aaKnown RBP10.52□□□□□ -0.73
ANKRD42-209ENST00000533342 INO80CQ6PI98 192 aaPredicted RBP10.52□□□□□ -0.73
ANKRD42-209ENST00000533342 CEACAM20Q6UY09 585 aa10.52□□□□□ -0.73
ANKRD42-209ENST00000533342 PRSS42Q7Z5A4 293 aa10.52□□□□□ -0.73
ANKRD42-209ENST00000533342 SIDT2Q8NBJ9 832 aaKnown RBP10.52□□□□□ -0.73
ANKRD42-209ENST00000533342 ACTRT1Q8TDG2 376 aa10.52□□□□□ -0.73
ANKRD42-209ENST00000533342 EXTL1Q92935 676 aa10.52□□□□□ -0.73
ANKRD42-209ENST00000533342 IL17FQ96PD4 163 aa10.52□□□□□ -0.73
ANKRD42-209ENST00000533342 SEMA4CQ9C0C4 833 aa10.52□□□□□ -0.73
ANKRD42-209ENST00000533342 IL22Q9GZX6 179 aa10.52□□□□□ -0.73
ANKRD42-209ENST00000533342 AKIRIN1Q9H9L7 192 aaPredicted RBP10.52□□□□□ -0.73
ANKRD42-209ENST00000533342 SOHLH2Q9NX45 425 aa10.52□□□□□ -0.73
ANKRD42-209ENST00000533342 GALPQ9UBC7 116 aa10.52□□□□□ -0.73
ANKRD42-209ENST00000533342 IL17BQ9UHF5 180 aa10.52□□□□□ -0.73
ANKRD42-209ENST00000533342 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa10.52□□□□□ -0.73
ANKRD42-209ENST00000533342 PILRAQ9UKJ1 303 aa10.52□□□□□ -0.73
ANKRD42-209ENST00000533342 SOX13Q9UN79 622 aa10.52□□□□□ -0.73
ANKRD42-209ENST00000533342 ICKQ9UPZ9 632 aa10.52□□□□□ -0.73
ANKRD42-209ENST00000533342 CRYL1Q9Y2S2 319 aa10.52□□□□□ -0.73
ANKRD42-209ENST00000533342 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa10.52□□□□□ -0.73
ANKRD42-209ENST00000533342 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa10.52□□□□□ -0.73
ANKRD42-209ENST00000533342 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP10.52□□□□□ -0.73
ANKRD42-209ENST00000533342 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa10.52□□□□□ -0.73
ANKRD42-209ENST00000533342 NDUFS3O75489 264 aa10.51□□□□□ -0.73
ANKRD42-209ENST00000533342 NTRK1P04629 796 aa10.51□□□□□ -0.73
ANKRD42-209ENST00000533342 ANKRD34CP0C6C1 535 aa10.51□□□□□ -0.73
ANKRD42-209ENST00000533342 PRKAR1AP10644 381 aa10.51□□□□□ -0.73
ANKRD42-209ENST00000533342 NELFEP18615 380 aaKnown RBP10.51□□□□□ -0.73
ANKRD42-209ENST00000533342 CDH3P22223 829 aa10.51□□□□□ -0.73
ANKRD42-209ENST00000533342 LAMB3Q13751 1172 aa10.51□□□□□ -0.73
ANKRD42-209ENST00000533342 CTSL3PQ5NE16 218 aa10.51□□□□□ -0.73
ANKRD42-209ENST00000533342 C4orf22Q6V702 233 aa10.51□□□□□ -0.73
ANKRD42-209ENST00000533342 NLRP9Q7RTR0 991 aa10.51□□□□□ -0.73
ANKRD42-209ENST00000533342 ACVR1CQ8NER5 493 aa10.51□□□□□ -0.73
ANKRD42-209ENST00000533342 SERPINB12Q96P63 405 aa10.51□□□□□ -0.73
ANKRD42-209ENST00000533342 RUFY1Q96T51 708 aa10.51□□□□□ -0.73
ANKRD42-209ENST00000533342 C19orf43Q9BQ61 176 aa10.51□□□□□ -0.73
ANKRD42-209ENST00000533342 TRIM51Q9BSJ1 452 aa10.51□□□□□ -0.73
ANKRD42-209ENST00000533342 KIFC1Q9BW19 673 aa10.51□□□□□ -0.73
ANKRD42-209ENST00000533342 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa10.51□□□□□ -0.73
ANKRD42-209ENST00000533342 ULBP3Q9BZM4 244 aa10.51□□□□□ -0.73
ANKRD42-209ENST00000533342 FBXO8Q9NRD0 319 aa10.51□□□□□ -0.73
ANKRD42-209ENST00000533342 SPHK1Q9NYA1 384 aa10.51□□□□□ -0.73
ANKRD42-209ENST00000533342 ASIC3Q9UHC3 531 aa10.51□□□□□ -0.73
ANKRD42-209ENST00000533342 ACSL6Q9UKU0 697 aa10.51□□□□□ -0.73
ANKRD42-209ENST00000533342 RIMKLBQ9ULI2 386 aa10.51□□□□□ -0.73
ANKRD42-209ENST00000533342 KLHL20Q9Y2M5 609 aa10.51□□□□□ -0.73
ANKRD42-209ENST00000533342 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa10.51□□□□□ -0.73
ANKRD42-209ENST00000533342 ATRXP46100 2492 aa10.51□□□□□ -0.73
ANKRD42-209ENST00000533342 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP10.5□□□□□ -0.73
ANKRD42-209ENST00000533342 NIPSNAP2O75323 286 aa10.5□□□□□ -0.73
ANKRD42-209ENST00000533342 ST6GAL1P15907 406 aa10.5□□□□□ -0.73
ANKRD42-209ENST00000533342 F8A1P23610 371 aa10.5□□□□□ -0.73
ANKRD42-209ENST00000533342 ACADLP28330 430 aa10.5□□□□□ -0.73
ANKRD42-209ENST00000533342 BDKRB1P46663 353 aa10.5□□□□□ -0.73
ANKRD42-209ENST00000533342 ATP1A2P50993 1020 aa10.5□□□□□ -0.73
ANKRD42-209ENST00000533342 UCNP55089 124 aa10.5□□□□□ -0.73
ANKRD42-209ENST00000533342 RAB15P59190 212 aa10.5□□□□□ -0.73
ANKRD42-209ENST00000533342 TUBB3Q13509 450 aa10.5□□□□□ -0.73
ANKRD42-209ENST00000533342 LYPLAL1Q5VWZ2 237 aa10.5□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.9 ms