RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519846.5

CLVS1-205, Transcript of clavesin 1, human

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene CLVS1, Length 3,622 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CLVS1-205	ENST00000519846	CACNG1	Q06432	222 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLVS1-205	ENST00000519846	SIX1	Q15475	284 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CLVS1-205	ENST00000519846	DBN1	Q16643	649 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLVS1-205	ENST00000519846	HIF1A	Q16665	826 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLVS1-205	ENST00000519846	PYCR3	Q53H96	274 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLVS1-205	ENST00000519846	NEPRO	Q6NW34	567 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLVS1-205	ENST00000519846	FBXO38	Q6PIJ6	1188 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLVS1-205	ENST00000519846	AFTPH	Q6ULP2	937 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLVS1-205	ENST00000519846	FAM92B	Q6ZTR7	304 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLVS1-205	ENST00000519846	OTOA	Q7RTW8	1153 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLVS1-205	ENST00000519846	ADCK2	Q7Z695	626 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLVS1-205	ENST00000519846	ZBED8	Q8IZ13	594 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLVS1-205	ENST00000519846	UNC5B	Q8IZJ1	945 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLVS1-205	ENST00000519846	SPATA4	Q8NEY3	305 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLVS1-205	ENST00000519846	OR4E2	Q8NGC2	313 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLVS1-205	ENST00000519846	ACTRT1	Q8TDG2	376 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLVS1-205	ENST00000519846	ASB12	Q8WXK4	309 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLVS1-205	ENST00000519846	CPT1B	Q92523	772 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLVS1-205	ENST00000519846	C9orf72	Q96LT7	481 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLVS1-205	ENST00000519846	ACAT2	Q9BWD1	397 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLVS1-205	ENST00000519846	ERVMER34-1	Q9H9K5	563 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLVS1-205	ENST00000519846	XAB2	Q9HCS7	855 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CLVS1-205	ENST00000519846	TRNAU1AP	Q9NX07	287 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CLVS1-205	ENST00000519846	MARCH4	Q9P2E8	410 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CLVS1-205	ENST00000519846	ZC3H7B	Q9UGR2	993 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CLVS1-205	ENST00000519846	PCYT1B	Q9Y5K3	369 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CLVS1-205	ENST00000519846	DMXL1	Q9Y485	3027 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLVS1-205	ENST00000519846	MYO15A	Q9UKN7	3530 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLVS1-205	ENST00000519846	KIF26B	Q2KJY2	2108 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLVS1-205	ENST00000519846	CXorf51A	A0A1B0GTR3	108 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLVS1-205	ENST00000519846	ISM1	B1AKI9	464 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLVS1-205	ENST00000519846	TNFRSF10C	O14798	259 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLVS1-205	ENST00000519846	ZW10	O43264	779 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLVS1-205	ENST00000519846	NUAK1	O60285	661 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLVS1-205	ENST00000519846	SEC31A	O94979	1220 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CLVS1-205	ENST00000519846	EML2	O95834	649 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLVS1-205	ENST00000519846	CA5A	P35218	305 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLVS1-205	ENST00000519846	TRIM23	P36406	574 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLVS1-205	ENST00000519846	NPY2R	P49146	381 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLVS1-205	ENST00000519846	FNTA	P49354	379 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLVS1-205	ENST00000519846	CBX1	P83916	185 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLVS1-205	ENST00000519846	PRKAA1	Q13131	559 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLVS1-205	ENST00000519846	SEMA5A	Q13591	1074 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLVS1-205	ENST00000519846	CUL1	Q13616	776 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLVS1-205	ENST00000519846	LAMB3	Q13751	1172 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLVS1-205	ENST00000519846	DNAJC21	Q5F1R6	531 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CLVS1-205	ENST00000519846	DENND5A	Q6IQ26	1287 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLVS1-205	ENST00000519846	C19orf48	Q6RUI8	117 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLVS1-205	ENST00000519846	NOA1	Q8NC60	698 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CLVS1-205	ENST00000519846	PYROXD1	Q8WU10	500 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLVS1-205	ENST00000519846	LCN9	Q8WX39	176 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLVS1-205	ENST00000519846	PLEKHG4B	Q96PX9	1271 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLVS1-205	ENST00000519846	NDN	Q99608	321 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLVS1-205	ENST00000519846	NUDT22	Q9BRQ3	303 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLVS1-205	ENST00000519846	TEX101	Q9BY14	249 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLVS1-205	ENST00000519846	FRMD8	Q9BZ67	464 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CLVS1-205	ENST00000519846	STRADB	Q9C0K7	418 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLVS1-205	ENST00000519846	IL22	Q9GZX6	179 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLVS1-205	ENST00000519846	CAMSAP3	Q9P1Y5	1249 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CLVS1-205	ENST00000519846	ANKRD36	A6QL64	1941 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLVS1-205	ENST00000519846	SMIM23	A6NLE4	172 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLVS1-205	ENST00000519846	C1QTNF9B	B2RNN3	333 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLVS1-205	ENST00000519846		F8W8V4	182 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLVS1-205	ENST00000519846	CCDC188	H7C350	402 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLVS1-205	ENST00000519846	LDB2	O43679	373 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLVS1-205	ENST00000519846	PPFIA2	O75334	1257 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLVS1-205	ENST00000519846	TCEA3	O75764	348 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLVS1-205	ENST00000519846	TUBB4A	P04350	444 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLVS1-205	ENST00000519846	APOA4	P06727	396 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLVS1-205	ENST00000519846	C1QTNF9	P0C862	333 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLVS1-205	ENST00000519846	ATP1B2	P14415	290 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CLVS1-205	ENST00000519846	POLR2C	P19387	275 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CLVS1-205	ENST00000519846	CDH3	P22223	829 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLVS1-205	ENST00000519846	GPC1	P35052	558 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLVS1-205	ENST00000519846	CCNF	P41002	786 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLVS1-205	ENST00000519846	ELK3	P41970	407 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLVS1-205	ENST00000519846	LIMK1	P53667	647 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLVS1-205	ENST00000519846	GABRE	P78334	506 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLVS1-205	ENST00000519846	E2F1	Q01094	437 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLVS1-205	ENST00000519846	PEX6	Q13608	980 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLVS1-205	ENST00000519846	AARS2	Q5JTZ9	985 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CLVS1-205	ENST00000519846	ZDHHC20	Q5W0Z9	365 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLVS1-205	ENST00000519846	ADGRD1	Q6QNK2	874 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLVS1-205	ENST00000519846	RBM44	Q6ZP01	1051 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CLVS1-205	ENST00000519846	ZNF765	Q7L2R6	523 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLVS1-205	ENST00000519846	B3GNT8	Q7Z7M8	397 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLVS1-205	ENST00000519846	SLC9B2	Q86UD5	537 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLVS1-205	ENST00000519846	CREG2	Q8IUH2	290 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLVS1-205	ENST00000519846	DENND6A	Q8IWF6	608 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLVS1-205	ENST00000519846	GSPT2	Q8IYD1	628 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CLVS1-205	ENST00000519846	FBXO39	Q8N4B4	442 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLVS1-205	ENST00000519846	ZCCHC14	Q8WYQ9	949 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CLVS1-205	ENST00000519846	ART4	Q93070	314 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLVS1-205	ENST00000519846	FATE1	Q969F0	183 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLVS1-205	ENST00000519846	ITFG2	Q969R8	447 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLVS1-205	ENST00000519846	ULK4	Q96C45	1275 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLVS1-205	ENST00000519846	SNF8	Q96H20	258 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLVS1-205	ENST00000519846	SERPINB12	Q96P63	405 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLVS1-205	ENST00000519846	CTRC	Q99895	268 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLVS1-205	ENST00000519846	SLC6A16	Q9GZN6	736 aa		4.86	□□□□□ -1.63

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