RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516877.1

RNU6-1234P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1234, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1234P, Length 103 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1234P-201ENST00000516877 FAM90A22PA8MWA6 464 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-1234P-201ENST00000516877 FAM90A12PA8MX19 464 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-1234P-201ENST00000516877 FAM90A23PA8MXZ1 464 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-1234P-201ENST00000516877 ZBTB43O43298 467 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-1234P-201ENST00000516877 TACC1O75410 805 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-1234P-201ENST00000516877 DFFBO76075 338 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-1234P-201ENST00000516877 HSD3B1P14060 373 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-1234P-201ENST00000516877 ABCB4P21439 1286 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-1234P-201ENST00000516877 GPX3P22352 226 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-1234P-201ENST00000516877 CHRNA7P36544 502 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-1234P-201ENST00000516877 GABRB2P47870 512 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-1234P-201ENST00000516877 ANAPC15P60006 121 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-1234P-201ENST00000516877 GUCY2DQ02846 1103 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-1234P-201ENST00000516877 LRRC63Q05C16 580 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-1234P-201ENST00000516877 EBI3Q14213 229 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-1234P-201ENST00000516877 PTPROQ16827 1216 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-1234P-201ENST00000516877 PFKFB4Q16877 469 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-1234P-201ENST00000516877 KLHL26Q53HC5 615 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-1234P-201ENST00000516877 RAB6CQ53S08 254 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-1234P-201ENST00000516877 COBLL1Q53SF7 1204 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-1234P-201ENST00000516877 AGAP7PQ5VUJ5 663 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-1234P-201ENST00000516877 TXNDC8Q6A555 127 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-1234P-201ENST00000516877 LCLAT1Q6UWP7 414 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-1234P-201ENST00000516877 ADGRG6Q86SQ4 1221 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-1234P-201ENST00000516877 HSCBQ8IWL3 235 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-1234P-201ENST00000516877 RAVER1Q8IY67 606 aaKnown RBP0.47□□□□□ -2.33
RNU6-1234P-201ENST00000516877 CCDC13Q8IYE1 715 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-1234P-201ENST00000516877 GCSAMQ8N6F7 178 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-1234P-201ENST00000516877 TNIP2Q8NFZ5 429 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-1234P-201ENST00000516877 OR1J2Q8NGS2 313 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-1234P-201ENST00000516877 NSMAFQ92636 917 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-1234P-201ENST00000516877 TMEM41AQ96HV5 264 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-1234P-201ENST00000516877 CCDC138Q96M89 665 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-1234P-201ENST00000516877 MAP3K3Q99759 626 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-1234P-201ENST00000516877 MAPKAP1Q9BPZ7 522 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-1234P-201ENST00000516877 RAB6CQ9H0N0 254 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-1234P-201ENST00000516877 SEMA6AQ9H2E6 1030 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-1234P-201ENST00000516877 SLC28A3Q9HAS3 691 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-1234P-201ENST00000516877 LTB4R2Q9NPC1 389 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-1234P-201ENST00000516877 MAN2C1Q9NTJ4 1040 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-1234P-201ENST00000516877 MIOSQ9NXC5 875 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-1234P-201ENST00000516877 OR6C2Q9NZP2 312 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-1234P-201ENST00000516877 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP0.47□□□□□ -2.33
RNU6-1234P-201ENST00000516877 WIPI2Q9Y4P8 454 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-1234P-201ENST00000516877 SEC23IPQ9Y6Y8 1000 aaKnown RBP0.47□□□□□ -2.33
RNU6-1234P-201ENST00000516877 A0A1W2PRB8 838 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-1234P-201ENST00000516877 GCNT3O95395 438 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-1234P-201ENST00000516877 CD1EP15812 388 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-1234P-201ENST00000516877 CA4P22748 312 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-1234P-201ENST00000516877 GNAQP50148 359 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-1234P-201ENST00000516877 PRKAA2P54646 552 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-1234P-201ENST00000516877 WNT4P56705 351 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-1234P-201ENST00000516877 EFNB1P98172 346 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-1234P-201ENST00000516877 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP0.46□□□□□ -2.34
RNU6-1234P-201ENST00000516877 MTF1Q14872 753 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-1234P-201ENST00000516877 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP0.46□□□□□ -2.34
RNU6-1234P-201ENST00000516877 LONRF1Q17RB8 773 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-1234P-201ENST00000516877 ODR4Q5SWX8 454 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-1234P-201ENST00000516877 LCN10Q6JVE6 187 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-1234P-201ENST00000516877 IRGCQ6NXR0 463 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-1234P-201ENST00000516877 CATSPER3Q86XQ3 398 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-1234P-201ENST00000516877 ATG16L2Q8NAA4 619 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-1234P-201ENST00000516877 ZNF527Q8NB42 609 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-1234P-201ENST00000516877 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-1234P-201ENST00000516877 RUBCNQ92622 972 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-1234P-201ENST00000516877 NKX3-1Q99801 234 aaPredicted RBP0.46□□□□□ -2.34
RNU6-1234P-201ENST00000516877 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP0.46□□□□□ -2.34
RNU6-1234P-201ENST00000516877 HEMGNQ9BXL5 484 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-1234P-201ENST00000516877 BRINP2Q9C0B6 783 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-1234P-201ENST00000516877 CCSER1Q9C0I3 900 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-1234P-201ENST00000516877 C20orf141Q9NUB4 165 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-1234P-201ENST00000516877 PLEKHA6Q9Y2H5 1048 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-1234P-201ENST00000516877 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP0.46□□□□□ -2.34
RNU6-1234P-201ENST00000516877 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-1234P-201ENST00000516877 MED19A0JLT2 244 aaPredicted RBP0.45□□□□□ -2.34
RNU6-1234P-201ENST00000516877 TTC36A6NLP5 189 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-1234P-201ENST00000516877 SERPINE3A8MV23 424 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-1234P-201ENST00000516877 K7ENM7 598 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-1234P-201ENST00000516877 SNAP91O60641 907 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-1234P-201ENST00000516877 AVILO75366 819 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-1234P-201ENST00000516877 KCNK5O95279 499 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-1234P-201ENST00000516877 IGKV1-17P01599 117 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-1234P-201ENST00000516877 IGKV2D-28P01615 120 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-1234P-201ENST00000516877 HOXB5P09067 269 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-1234P-201ENST00000516877 FAM200BP0CF97 657 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-1234P-201ENST00000516877 ODC1P11926 461 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-1234P-201ENST00000516877 NR2C1P13056 603 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-1234P-201ENST00000516877 ATP1A3P13637 1013 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-1234P-201ENST00000516877 RPL34P49207 117 aaKnown RBP0.45□□□□□ -2.34
RNU6-1234P-201ENST00000516877 BTKQ06187 659 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-1234P-201ENST00000516877 PLA2G7Q13093 441 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-1234P-201ENST00000516877 PRKAA1Q13131 559 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-1234P-201ENST00000516877 ZNF658BQ4V348 819 aaPredicted RBP0.45□□□□□ -2.34
RNU6-1234P-201ENST00000516877 C20orf194Q5TEA3 1177 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-1234P-201ENST00000516877 KRT39Q6A163 491 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-1234P-201ENST00000516877 LIN54Q6MZP7 749 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-1234P-201ENST00000516877 PGBD2Q6P3X8 592 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-1234P-201ENST00000516877 TMEM81Q6P7N7 255 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-1234P-201ENST00000516877 SLC25A47Q6Q0C1 308 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-1234P-201ENST00000516877 ZER1Q7Z7L7 766 aa0.45□□□□□ -2.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.2 ms