RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516524.1

RNU6-964P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 964, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-964P, Length 69 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-964P-201ENST00000516524 PKIBQ9C010 78 aa6.43□□□□□ -1.38
RNU6-964P-201ENST00000516524 TMEM117Q9H0C3 514 aa6.43□□□□□ -1.38
RNU6-964P-201ENST00000516524 ZCCHC3Q9NUD5 404 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
RNU6-964P-201ENST00000516524 RAB20Q9NX57 234 aa6.43□□□□□ -1.38
RNU6-964P-201ENST00000516524 ANKRD10Q9NXR5 420 aa6.43□□□□□ -1.38
RNU6-964P-201ENST00000516524 FLRT1Q9NZU1 646 aa6.43□□□□□ -1.38
RNU6-964P-201ENST00000516524 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
RNU6-964P-201ENST00000516524 STK39Q9UEW8 545 aa6.43□□□□□ -1.38
RNU6-964P-201ENST00000516524 FBXO4Q9UKT5 387 aa6.43□□□□□ -1.38
RNU6-964P-201ENST00000516524 PSME2Q9UL46 239 aa6.43□□□□□ -1.38
RNU6-964P-201ENST00000516524 GRID1Q9ULK0 1009 aa6.43□□□□□ -1.38
RNU6-964P-201ENST00000516524 MGAT4BQ9UQ53 548 aa6.43□□□□□ -1.38
RNU6-964P-201ENST00000516524 DLGAP4Q9Y2H0 992 aa6.43□□□□□ -1.38
RNU6-964P-201ENST00000516524 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
RNU6-964P-201ENST00000516524 KIF16BQ96L93 1317 aa6.43□□□□□ -1.38
RNU6-964P-201ENST00000516524 MAGEA13PA6NCF6 341 aa6.42□□□□□ -1.38
RNU6-964P-201ENST00000516524 ANKUB1A6NFN9 424 aa6.42□□□□□ -1.38
RNU6-964P-201ENST00000516524 FOXO6A8MYZ6 492 aa6.42□□□□□ -1.38
RNU6-964P-201ENST00000516524 HS3ST1O14792 307 aa6.42□□□□□ -1.38
RNU6-964P-201ENST00000516524 CASC3O15234 703 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
RNU6-964P-201ENST00000516524 FLRT2O43155 660 aa6.42□□□□□ -1.38
RNU6-964P-201ENST00000516524 AP5Z1O43299 807 aa6.42□□□□□ -1.38
RNU6-964P-201ENST00000516524 ATP6V1G1O75348 118 aa6.42□□□□□ -1.38
RNU6-964P-201ENST00000516524 NFATC1O95644 943 aa6.42□□□□□ -1.38
RNU6-964P-201ENST00000516524 CXCL14O95715 111 aa6.42□□□□□ -1.38
RNU6-964P-201ENST00000516524 MT-CO3P00414 261 aa6.42□□□□□ -1.38
RNU6-964P-201ENST00000516524 MMP3P08254 477 aa6.42□□□□□ -1.38
RNU6-964P-201ENST00000516524 TFPIP10646 304 aa6.42□□□□□ -1.38
RNU6-964P-201ENST00000516524 KRT3P12035 628 aa6.42□□□□□ -1.38
RNU6-964P-201ENST00000516524 CSF2RAP15509 400 aa6.42□□□□□ -1.38
RNU6-964P-201ENST00000516524 PTPN4P29074 926 aa6.42□□□□□ -1.38
RNU6-964P-201ENST00000516524 CLCN5P51795 746 aa6.42□□□□□ -1.38
RNU6-964P-201ENST00000516524 SMSP52788 366 aa6.42□□□□□ -1.38
RNU6-964P-201ENST00000516524 HAND2P61296 217 aa6.42□□□□□ -1.38
RNU6-964P-201ENST00000516524 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
RNU6-964P-201ENST00000516524 PPP2R2BQ00005 443 aa6.42□□□□□ -1.38
RNU6-964P-201ENST00000516524 LCP2Q13094 533 aa6.42□□□□□ -1.38
RNU6-964P-201ENST00000516524 SNTB2Q13425 540 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
RNU6-964P-201ENST00000516524 MELKQ14680 651 aa6.42□□□□□ -1.38
RNU6-964P-201ENST00000516524 PTPRRQ15256 657 aa6.42□□□□□ -1.38
RNU6-964P-201ENST00000516524 MEP1AQ16819 746 aa6.42□□□□□ -1.38
RNU6-964P-201ENST00000516524 C6orf10Q5SRN2 563 aa6.42□□□□□ -1.38
RNU6-964P-201ENST00000516524 FBXO42Q6P3S6 717 aa6.42□□□□□ -1.38
RNU6-964P-201ENST00000516524 ANKRD46Q86W74 232 aa6.42□□□□□ -1.38
RNU6-964P-201ENST00000516524 DNAJC10Q8IXB1 793 aa6.42□□□□□ -1.38
RNU6-964P-201ENST00000516524 ABI1Q8IZP0 508 aa6.42□□□□□ -1.38
RNU6-964P-201ENST00000516524 CARFQ8N187 725 aa6.42□□□□□ -1.38
RNU6-964P-201ENST00000516524 LCORLQ8N3X6 602 aa6.42□□□□□ -1.38
RNU6-964P-201ENST00000516524 ARL14Q8N4G2 192 aa6.42□□□□□ -1.38
RNU6-964P-201ENST00000516524 RASGEF1AQ8N9B8 481 aa6.42□□□□□ -1.38
RNU6-964P-201ENST00000516524 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa6.42□□□□□ -1.38
RNU6-964P-201ENST00000516524 HM13Q8TCT9 377 aa6.42□□□□□ -1.38
RNU6-964P-201ENST00000516524 AGR3Q8TD06 166 aa6.42□□□□□ -1.38
RNU6-964P-201ENST00000516524 MIPOL1Q8TD10 442 aa6.42□□□□□ -1.38
RNU6-964P-201ENST00000516524 OIT3Q8WWZ8 545 aa6.42□□□□□ -1.38
RNU6-964P-201ENST00000516524 SLC25A28Q96A46 364 aa6.42□□□□□ -1.38
RNU6-964P-201ENST00000516524 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
RNU6-964P-201ENST00000516524 NECTIN4Q96NY8 510 aa6.42□□□□□ -1.38
RNU6-964P-201ENST00000516524 PCYT2Q99447 389 aa6.42□□□□□ -1.38
RNU6-964P-201ENST00000516524 NMNAT2Q9BZQ4 307 aa6.42□□□□□ -1.38
RNU6-964P-201ENST00000516524 YY1AP1Q9H869 796 aa6.42□□□□□ -1.38
RNU6-964P-201ENST00000516524 VAT1LQ9HCJ6 419 aa6.42□□□□□ -1.38
RNU6-964P-201ENST00000516524 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
RNU6-964P-201ENST00000516524 GPR108Q9NPR9 543 aa6.42□□□□□ -1.38
RNU6-964P-201ENST00000516524 DUSP22Q9NRW4 184 aa6.42□□□□□ -1.38
RNU6-964P-201ENST00000516524 CHMP2BQ9UQN3 213 aa6.42□□□□□ -1.38
RNU6-964P-201ENST00000516524 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa6.42□□□□□ -1.38
RNU6-964P-201ENST00000516524 IRAK3Q9Y616 596 aa6.42□□□□□ -1.38
RNU6-964P-201ENST00000516524 ADGRA2Q96PE1 1338 aa6.42□□□□□ -1.38
RNU6-964P-201ENST00000516524 MACROD2A1Z1Q3 448 aa6.41□□□□□ -1.38
RNU6-964P-201ENST00000516524 EIF4E1BA6NMX2 242 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
RNU6-964P-201ENST00000516524 H0YGN5 161 aa6.41□□□□□ -1.38
RNU6-964P-201ENST00000516524 VCYO14598 125 aa6.41□□□□□ -1.38
RNU6-964P-201ENST00000516524 TLX2O43763 284 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
RNU6-964P-201ENST00000516524 KLK8O60259 260 aa6.41□□□□□ -1.38
RNU6-964P-201ENST00000516524 GPRIN2O60269 458 aa6.41□□□□□ -1.38
RNU6-964P-201ENST00000516524 NDUFB4O95168 129 aa6.41□□□□□ -1.38
RNU6-964P-201ENST00000516524 SKILP12757 684 aa6.41□□□□□ -1.38
RNU6-964P-201ENST00000516524 CPA3P15088 417 aa6.41□□□□□ -1.38
RNU6-964P-201ENST00000516524 NDUFB7P17568 137 aa6.41□□□□□ -1.38
RNU6-964P-201ENST00000516524 FBLP22087 321 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
RNU6-964P-201ENST00000516524 NMBRP28336 390 aa6.41□□□□□ -1.38
RNU6-964P-201ENST00000516524 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
RNU6-964P-201ENST00000516524 PTGER3P43115 390 aa6.41□□□□□ -1.38
RNU6-964P-201ENST00000516524 CD151P48509 253 aa6.41□□□□□ -1.38
RNU6-964P-201ENST00000516524 LHX1P48742 406 aa6.41□□□□□ -1.38
RNU6-964P-201ENST00000516524 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
RNU6-964P-201ENST00000516524 ETV1P50549 477 aa6.41□□□□□ -1.38
RNU6-964P-201ENST00000516524 RABGGTBP53611 331 aa6.41□□□□□ -1.38
RNU6-964P-201ENST00000516524 EGR4Q05215 589 aa6.41□□□□□ -1.38
RNU6-964P-201ENST00000516524 SPOCK1Q08629 439 aa6.41□□□□□ -1.38
RNU6-964P-201ENST00000516524 GAGE2BQ13066 116 aa6.41□□□□□ -1.38
RNU6-964P-201ENST00000516524 MVPQ14764 893 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
RNU6-964P-201ENST00000516524 RCN1Q15293 331 aa6.41□□□□□ -1.38
RNU6-964P-201ENST00000516524 GAGE2EQ4V326 116 aa6.41□□□□□ -1.38
RNU6-964P-201ENST00000516524 ESCO2Q56NI9 601 aa6.41□□□□□ -1.38
RNU6-964P-201ENST00000516524 TCTE1Q5JU00 501 aa6.41□□□□□ -1.38
RNU6-964P-201ENST00000516524 GCNT6Q5T4J0 391 aa6.41□□□□□ -1.38
RNU6-964P-201ENST00000516524 GAGE2AQ6NT46 116 aa6.41□□□□□ -1.38
RNU6-964P-201ENST00000516524 VWA1Q6PCB0 445 aa6.41□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.3 ms