RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511807.1

UBE2B-208, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 B, humanhuman

TSL 3

Gene UBE2B, Length 818 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2B-208ENST00000511807 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa11.14□□□□□ -0.63
UBE2B-208ENST00000511807 SLC24A2Q9UI40 661 aa11.14□□□□□ -0.63
UBE2B-208ENST00000511807 ACSL6Q9UKU0 697 aa11.14□□□□□ -0.63
UBE2B-208ENST00000511807 BPTFQ12830 3046 aa11.13□□□□□ -0.63
UBE2B-208ENST00000511807 RHPN2P1A8MT19 583 aa11.13□□□□□ -0.63
UBE2B-208ENST00000511807 FADS2P1A8MWK0 482 aa11.13□□□□□ -0.63
UBE2B-208ENST00000511807 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
UBE2B-208ENST00000511807 SLC28A2O43868 658 aa11.13□□□□□ -0.63
UBE2B-208ENST00000511807 CEACAM5P06731 702 aa11.13□□□□□ -0.63
UBE2B-208ENST00000511807 ACRV1P26436 265 aa11.13□□□□□ -0.63
UBE2B-208ENST00000511807 AK4P27144 223 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
UBE2B-208ENST00000511807 SPRP35270 261 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
UBE2B-208ENST00000511807 GP5P40197 560 aa11.13□□□□□ -0.63
UBE2B-208ENST00000511807 SLC1A2P43004 574 aa11.13□□□□□ -0.63
UBE2B-208ENST00000511807 GNPDA1P46926 289 aa11.13□□□□□ -0.63
UBE2B-208ENST00000511807 LEPRP48357 1165 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
UBE2B-208ENST00000511807 SERPINB9P50453 376 aa11.13□□□□□ -0.63
UBE2B-208ENST00000511807 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
UBE2B-208ENST00000511807 OR1D5P58170 312 aa11.13□□□□□ -0.63
UBE2B-208ENST00000511807 FOXK1P85037 733 aa11.13□□□□□ -0.63
UBE2B-208ENST00000511807 B4GALNT1Q00973 533 aa11.13□□□□□ -0.63
UBE2B-208ENST00000511807 C16orf72Q14CZ0 275 aa11.13□□□□□ -0.63
UBE2B-208ENST00000511807 TYSND1Q2T9J0 566 aa11.13□□□□□ -0.63
UBE2B-208ENST00000511807 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
UBE2B-208ENST00000511807 DOK6Q6PKX4 331 aa11.13□□□□□ -0.63
UBE2B-208ENST00000511807 SLC30A9Q6PML9 568 aa11.13□□□□□ -0.63
UBE2B-208ENST00000511807 TMPRSS9Q7Z410 1059 aa11.13□□□□□ -0.63
UBE2B-208ENST00000511807 STRA8Q7Z7C7 330 aa11.13□□□□□ -0.63
UBE2B-208ENST00000511807 VASH2Q86V25 355 aa11.13□□□□□ -0.63
UBE2B-208ENST00000511807 PIM3Q86V86 326 aa11.13□□□□□ -0.63
UBE2B-208ENST00000511807 PHYKPLQ8IUZ5 450 aa11.13□□□□□ -0.63
UBE2B-208ENST00000511807 SLITRK4Q8IW52 837 aa11.13□□□□□ -0.63
UBE2B-208ENST00000511807 DENND6AQ8IWF6 608 aa11.13□□□□□ -0.63
UBE2B-208ENST00000511807 PIANPQ8IYJ0 282 aa11.13□□□□□ -0.63
UBE2B-208ENST00000511807 GPBAR1Q8TDU6 330 aa11.13□□□□□ -0.63
UBE2B-208ENST00000511807 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa11.13□□□□□ -0.63
UBE2B-208ENST00000511807 SLC44A1Q8WWI5 657 aa11.13□□□□□ -0.63
UBE2B-208ENST00000511807 TMEM159Q96B96 161 aa11.13□□□□□ -0.63
UBE2B-208ENST00000511807 SGF29Q96ES7 293 aa11.13□□□□□ -0.63
UBE2B-208ENST00000511807 ARHGAP9Q9BRR9 750 aa11.13□□□□□ -0.63
UBE2B-208ENST00000511807 TMEM109Q9BVC6 243 aa11.13□□□□□ -0.63
UBE2B-208ENST00000511807 GSDMCQ9BYG8 508 aa11.13□□□□□ -0.63
UBE2B-208ENST00000511807 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
UBE2B-208ENST00000511807 CCDC68Q9H2F9 335 aa11.13□□□□□ -0.63
UBE2B-208ENST00000511807 ACBD3Q9H3P7 528 aa11.13□□□□□ -0.63
UBE2B-208ENST00000511807 VIPAS39Q9H9C1 493 aa11.13□□□□□ -0.63
UBE2B-208ENST00000511807 SMYD2Q9NRG4 433 aa11.13□□□□□ -0.63
UBE2B-208ENST00000511807 FOXJ2Q9P0K8 574 aa11.13□□□□□ -0.63
UBE2B-208ENST00000511807 AKAP7Q9P0M2 348 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
UBE2B-208ENST00000511807 TAAR2Q9P1P5 351 aa11.13□□□□□ -0.63
UBE2B-208ENST00000511807 MARCH4Q9P2E8 410 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
UBE2B-208ENST00000511807 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
UBE2B-208ENST00000511807 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa11.13□□□□□ -0.63
UBE2B-208ENST00000511807 QSOX1O00391 747 aa11.12□□□□□ -0.63
UBE2B-208ENST00000511807 RASGRF2O14827 1237 aa11.12□□□□□ -0.63
UBE2B-208ENST00000511807 INPP4BO15327 924 aa11.12□□□□□ -0.63
UBE2B-208ENST00000511807 B4GAT1O43505 415 aa11.12□□□□□ -0.63
UBE2B-208ENST00000511807 KRT38O76015 456 aa11.12□□□□□ -0.63
UBE2B-208ENST00000511807 CPNE6O95741 557 aa11.12□□□□□ -0.63
UBE2B-208ENST00000511807 S1PR4O95977 384 aa11.12□□□□□ -0.63
UBE2B-208ENST00000511807 SOD1P00441 154 aa11.12□□□□□ -0.63
UBE2B-208ENST00000511807 C1QAP02745 245 aa11.12□□□□□ -0.63
UBE2B-208ENST00000511807 AHSGP02765 367 aa11.12□□□□□ -0.63
UBE2B-208ENST00000511807 FUCA1P04066 466 aa11.12□□□□□ -0.63
UBE2B-208ENST00000511807 SHBGP04278 402 aa11.12□□□□□ -0.63
UBE2B-208ENST00000511807 MSH3P20585 1137 aa11.12□□□□□ -0.63
UBE2B-208ENST00000511807 CNTFP26441 200 aa11.12□□□□□ -0.63
UBE2B-208ENST00000511807 AKT1P31749 480 aa11.12□□□□□ -0.63
UBE2B-208ENST00000511807 NSG1P42857 185 aa11.12□□□□□ -0.63
UBE2B-208ENST00000511807 CD151P48509 253 aa11.12□□□□□ -0.63
UBE2B-208ENST00000511807 POLD2P49005 469 aa11.12□□□□□ -0.63
UBE2B-208ENST00000511807 CDKN1CP49918 316 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
UBE2B-208ENST00000511807 CDK3Q00526 305 aa11.12□□□□□ -0.63
UBE2B-208ENST00000511807 NFATC3Q12968 1075 aa11.12□□□□□ -0.63
UBE2B-208ENST00000511807 DBN1Q16643 649 aa11.12□□□□□ -0.63
UBE2B-208ENST00000511807 MANEAQ5SRI9 462 aa11.12□□□□□ -0.63
UBE2B-208ENST00000511807 GPRC6AQ5T6X5 926 aa11.12□□□□□ -0.63
UBE2B-208ENST00000511807 PACS1Q6VY07 963 aa11.12□□□□□ -0.63
UBE2B-208ENST00000511807 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa11.12□□□□□ -0.63
UBE2B-208ENST00000511807 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
UBE2B-208ENST00000511807 NRROSQ86YC3 692 aa11.12□□□□□ -0.63
UBE2B-208ENST00000511807 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
UBE2B-208ENST00000511807 DDHD1Q8NEL9 900 aa11.12□□□□□ -0.63
UBE2B-208ENST00000511807 PATE1Q8WXA2 126 aa11.12□□□□□ -0.63
UBE2B-208ENST00000511807 EXTL1Q92935 676 aa11.12□□□□□ -0.63
UBE2B-208ENST00000511807 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
UBE2B-208ENST00000511807 PAFAH2Q99487 392 aa11.12□□□□□ -0.63
UBE2B-208ENST00000511807 NUDT22Q9BRQ3 303 aa11.12□□□□□ -0.63
UBE2B-208ENST00000511807 TEX101Q9BY14 249 aa11.12□□□□□ -0.63
UBE2B-208ENST00000511807 TRIM39Q9HCM9 518 aa11.12□□□□□ -0.63
UBE2B-208ENST00000511807 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
UBE2B-208ENST00000511807 TRNAU1APQ9NX07 287 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
UBE2B-208ENST00000511807 ZNF180Q9UJW8 692 aa11.12□□□□□ -0.63
UBE2B-208ENST00000511807 SUFUQ9UMX1 484 aa11.12□□□□□ -0.63
UBE2B-208ENST00000511807 COMMD10Q9Y6G5 202 aa11.12□□□□□ -0.63
UBE2B-208ENST00000511807 ZNF462Q96JM2 2506 aa11.12□□□□□ -0.63
UBE2B-208ENST00000511807 IQANK1A0A1B0GTG1 560 aa11.11□□□□□ -0.63
UBE2B-208ENST00000511807 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP11.11□□□□□ -0.63
UBE2B-208ENST00000511807 TLDC2A0PJX2 215 aa11.11□□□□□ -0.63
UBE2B-208ENST00000511807 GOLGA6L10A6NI86 522 aa11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.2 ms