RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511392.5

CDV3-208, Transcript of CDV3 homolog, human

TSL 5 BASIC

Gene CDV3, Length 554 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CDV3-208	ENST00000511392	SLC31A1	O15431	190 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	KCNN4	O15554	427 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	ZSCAN12	O43309	604 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	MTSS1	O43312	755 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	OPHN1	O60890	802 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	METTL18	O95568	372 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	FGG	P02679	453 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	CFI	P05156	583 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	PTMA	P06454	111 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	C1S	P09871	688 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	ALPI	P09923	528 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	TBC1D3H	P0C7X1	549 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	OSM	P13725	252 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	CTPS1	P17812	591 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	HNRNPA2B1	P22626	353 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	CCND1	P24385	295 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	PSMB4	P28070	264 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	ADRA1A	P35348	466 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	HNF1B	P35680	557 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	ATP5O	P48047	213 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	STC1	P52823	247 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	MANF	P55145	182 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	WNT3A	P56704	352 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	CLDN2	P57739	230 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	PFN3	P60673	137 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	RPL26	P61254	145 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	SRSF2	Q01130	221 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	RAD51	Q06609	339 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	ELP6	Q0PNE2	266 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	FAP	Q12884	760 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	MSLN	Q13421	630 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	OLIG2	Q13516	323 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	GALNT3	Q14435	633 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	UGT8	Q16880	541 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	KCTD19	Q17RG1	926 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	WSCD2	Q2TBF2	565 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	SIRPB2	Q5JXA9	342 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	ZNF569	Q5MCW4	686 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	ARMC12	Q5T9G4	340 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	STPG1	Q5TH74	334 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	LRRC66	Q68CR7	880 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	KCTD11	Q693B1	232 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	TBC1D3G	Q6DHY5	549 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	TBC1D3C	Q6IPX1	549 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	ERAP2	Q6P179	960 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	TTC27	Q6P3X3	843 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	DRICH1	Q6PGQ1	229 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	BORA	Q6PGQ7	559 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	CRTC1	Q6UUV9	634 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	BZW1	Q7L1Q6	419 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	KANSL1	Q7Z3B3	1105 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	RABEPK	Q7Z6M1	372 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	PRUNE1	Q86TP1	453 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	TTC7B	Q86TV6	843 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	ZBTB46	Q86UZ6	589 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	IQCH	Q86VS3	1027 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	ZSCAN30	Q86W11	494 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	TBC1D3	Q8IZP1	549 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	BBS5	Q8N3I7	341 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	RASGEF1C	Q8N431	466 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	MINDY1	Q8N5J2	469 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	ZC3H8	Q8N5P1	291 aa	Known RBP eCLIP	4.64	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	PRELID2	Q8N945	189 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	FAM71D	Q8N9W8	422 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	PLA2G15	Q8NCC3	412 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	DENND6B	Q8NEG7	585 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	LPCAT1	Q8NF37	534 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	CCDC110	Q8TBZ0	833 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	NSMCE1	Q8WV22	266 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	C1orf54	Q8WWF1	131 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	ZCCHC14	Q8WYQ9	949 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	RMDN1	Q96DB5	314 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	DTD2	Q96FN9	168 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	SCRN2	Q96FV2	425 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	MS4A14	Q96JA4	679 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	FEM1C	Q96JP0	617 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	SERAC1	Q96JX3	654 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	BMF	Q96LC9	184 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	SPATA13	Q96N96	652 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	SORCS2	Q96PQ0	1159 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	LENG8	Q96PV6	779 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	FCRL5	Q96RD9	977 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	TMEM121	Q9BTD3	319 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	SLC17A9	Q9BYT1	436 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	PCDH9	Q9HC56	1237 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	MBNL1	Q9NR56	388 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	DNAJC28	Q9NX36	388 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	MKS1	Q9NXB0	559 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	DLL3	Q9NYJ7	618 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	KLHL8	Q9P2G9	620 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	RSPH14	Q9UHP6	348 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	TTC7A	Q9ULT0	858 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	SNX12	Q9UMY4	172 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	RPL26L1	Q9UNX3	145 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	CHKB	Q9Y259	395 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	ANKRD6	Q9Y2G4	727 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	JRKL	Q9Y4A0	524 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	PTPRB	P23467	1997 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392		A0A1B0GTQ1	180 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	LOC105378220	A0A1B0GUY1	285 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67

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