RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000508338.1

SH3BP2-212, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP2, Length 491 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-212ENST00000508338 INPP5DQ92835 1189 aa26.17■■□□□ 1.78
SH3BP2-212ENST00000508338 FERD3LQ96RJ6 166 aa26.17■■□□□ 1.78
SH3BP2-212ENST00000508338 TRIT1Q9H3H1 467 aaKnown RBP26.17■■□□□ 1.78
SH3BP2-212ENST00000508338 CDYLQ9Y232 598 aa26.17■■□□□ 1.78
SH3BP2-212ENST00000508338 ASF1AQ9Y294 204 aa26.17■■□□□ 1.78
SH3BP2-212ENST00000508338 FAM159BA6NKW6 160 aa26.16■■□□□ 1.78
SH3BP2-212ENST00000508338 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP26.16■■□□□ 1.78
SH3BP2-212ENST00000508338 UBXN7O94888 489 aa26.16■■□□□ 1.78
SH3BP2-212ENST00000508338 CBSLP0DN79 551 aa26.16■■□□□ 1.78
SH3BP2-212ENST00000508338 ENO3P13929 434 aaPredicted RBP26.16■■□□□ 1.78
SH3BP2-212ENST00000508338 CD1CP29017 333 aa26.16■■□□□ 1.78
SH3BP2-212ENST00000508338 CBSP35520 551 aa26.16■■□□□ 1.78
SH3BP2-212ENST00000508338 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP26.16■■□□□ 1.78
SH3BP2-212ENST00000508338 CLCN7P51798 805 aa26.16■■□□□ 1.78
SH3BP2-212ENST00000508338 GPX6P59796 221 aa26.16■■□□□ 1.78
SH3BP2-212ENST00000508338 PLCL1Q15111 1095 aa26.16■■□□□ 1.78
SH3BP2-212ENST00000508338 AMZ1Q400G9 498 aa26.16■■□□□ 1.78
SH3BP2-212ENST00000508338 FAM45BPQ6NSW5 357 aa26.16■■□□□ 1.78
SH3BP2-212ENST00000508338 ZNF549Q6P9A3 640 aa26.16■■□□□ 1.78
SH3BP2-212ENST00000508338 NEK10Q6ZWH5 1172 aa26.16■■□□□ 1.78
SH3BP2-212ENST00000508338 STRA8Q7Z7C7 330 aa26.16■■□□□ 1.78
SH3BP2-212ENST00000508338 FAM45AQ8TCE6 357 aa26.16■■□□□ 1.78
SH3BP2-212ENST00000508338 CPNE1Q99829 537 aa26.16■■□□□ 1.78
SH3BP2-212ENST00000508338 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa26.16■■□□□ 1.78
SH3BP2-212ENST00000508338 NFU1Q9UMS0 254 aa26.16■■□□□ 1.78
SH3BP2-212ENST00000508338 WASF3Q9UPY6 502 aa26.16■■□□□ 1.78
SH3BP2-212ENST00000508338 DHRS7Q9Y394 339 aa26.16■■□□□ 1.78
SH3BP2-212ENST00000508338 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP26.16■■□□□ 1.78
SH3BP2-212ENST00000508338 AMD1P17707 334 aa26.15■■□□□ 1.78
SH3BP2-212ENST00000508338 GABRB3P28472 473 aa26.15■■□□□ 1.78
SH3BP2-212ENST00000508338 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP26.15■■□□□ 1.78
SH3BP2-212ENST00000508338 GBX1Q14549 363 aa26.15■■□□□ 1.78
SH3BP2-212ENST00000508338 TTC23LQ6PF05 361 aa26.15■■□□□ 1.78
SH3BP2-212ENST00000508338 PLXDC1Q8IUK5 500 aa26.15■■□□□ 1.78
SH3BP2-212ENST00000508338 OR4D9Q8NGE8 314 aa26.15■■□□□ 1.78
SH3BP2-212ENST00000508338 OR5K2Q8NHB8 316 aa26.15■■□□□ 1.78
SH3BP2-212ENST00000508338 MAGEC3Q8TD91 643 aa26.15■■□□□ 1.78
SH3BP2-212ENST00000508338 STRADBQ9C0K7 418 aa26.15■■□□□ 1.78
SH3BP2-212ENST00000508338 ZMYND15Q9H091 742 aa26.15■■□□□ 1.78
SH3BP2-212ENST00000508338 SLC24A2Q9UI40 661 aa26.15■■□□□ 1.78
SH3BP2-212ENST00000508338 TRMT6Q9UJA5 497 aaKnown RBP26.15■■□□□ 1.78
SH3BP2-212ENST00000508338 PROS1P07225 676 aa26.14■■□□□ 1.78
SH3BP2-212ENST00000508338 TNFRSF8P28908 595 aa26.14■■□□□ 1.78
SH3BP2-212ENST00000508338 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP26.14■■□□□ 1.78
SH3BP2-212ENST00000508338 ISXQ2M1V0 245 aa26.14■■□□□ 1.78
SH3BP2-212ENST00000508338 TMEM71Q6P5X7 295 aa26.14■■□□□ 1.78
SH3BP2-212ENST00000508338 NAPRTQ6XQN6 538 aa26.14■■□□□ 1.78
SH3BP2-212ENST00000508338 LRRN4CLQ8ND94 238 aa26.14■■□□□ 1.78
SH3BP2-212ENST00000508338 SCNM1Q9BWG6 230 aa26.14■■□□□ 1.78
SH3BP2-212ENST00000508338 RAB33BQ9H082 229 aa26.14■■□□□ 1.78
SH3BP2-212ENST00000508338 RHOJQ9H4E5 214 aa26.14■■□□□ 1.78
SH3BP2-212ENST00000508338 TFB2MQ9H5Q4 396 aaKnown RBP26.14■■□□□ 1.78
SH3BP2-212ENST00000508338 MSRB2Q9Y3D2 182 aa26.14■■□□□ 1.78
SH3BP2-212ENST00000508338 CSO75390 466 aaKnown RBP26.13■■□□□ 1.77
SH3BP2-212ENST00000508338 CCKBRP32239 447 aa26.13■■□□□ 1.77
SH3BP2-212ENST00000508338 GP5P40197 560 aa26.13■■□□□ 1.77
SH3BP2-212ENST00000508338 CCNFP41002 786 aa26.13■■□□□ 1.77
SH3BP2-212ENST00000508338 RGS4P49798 205 aa26.13■■□□□ 1.77
SH3BP2-212ENST00000508338 INHBCP55103 352 aa26.13■■□□□ 1.77
SH3BP2-212ENST00000508338 KYNUQ16719 465 aa26.13■■□□□ 1.77
SH3BP2-212ENST00000508338 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP26.13■■□□□ 1.77
SH3BP2-212ENST00000508338 ZC3HC1Q86WB0 502 aaKnown RBP26.13■■□□□ 1.77
SH3BP2-212ENST00000508338 ZNF761Q86XN6 746 aaPredicted RBP26.13■■□□□ 1.77
SH3BP2-212ENST00000508338 GPATCH11Q8N954 259 aa26.13■■□□□ 1.77
SH3BP2-212ENST00000508338 FBF1Q8TES7 1133 aa26.13■■□□□ 1.77
SH3BP2-212ENST00000508338 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP26.13■■□□□ 1.77
SH3BP2-212ENST00000508338 CYTH2Q99418 400 aa26.13■■□□□ 1.77
SH3BP2-212ENST00000508338 GPR21Q99679 349 aa26.13■■□□□ 1.77
SH3BP2-212ENST00000508338 TBC1D10AQ9BXI6 508 aa26.13■■□□□ 1.77
SH3BP2-212ENST00000508338 VWA7Q9Y334 891 aa26.13■■□□□ 1.77
SH3BP2-212ENST00000508338 MATN2O00339 956 aa26.12■■□□□ 1.77
SH3BP2-212ENST00000508338 CAPZBP47756 277 aa26.12■■□□□ 1.77
SH3BP2-212ENST00000508338 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP26.12■■□□□ 1.77
SH3BP2-212ENST00000508338 EIF3IQ13347 325 aaKnown RBP26.12■■□□□ 1.77
SH3BP2-212ENST00000508338 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP26.12■■□□□ 1.77
SH3BP2-212ENST00000508338 VRK3Q8IV63 474 aa26.12■■□□□ 1.77
SH3BP2-212ENST00000508338 DCUN1D3Q8IWE4 304 aa26.12■■□□□ 1.77
SH3BP2-212ENST00000508338 CTAGE3PQ8IX95 158 aa26.12■■□□□ 1.77
SH3BP2-212ENST00000508338 VPS39Q96JC1 886 aa26.12■■□□□ 1.77
SH3BP2-212ENST00000508338 FUT8Q9BYC5 575 aa26.12■■□□□ 1.77
SH3BP2-212ENST00000508338 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP26.12■■□□□ 1.77
SH3BP2-212ENST00000508338 NINJ2Q9NZG7 142 aa26.12■■□□□ 1.77
SH3BP2-212ENST00000508338 AKAP7Q9P0M2 348 aaPredicted RBP26.12■■□□□ 1.77
SH3BP2-212ENST00000508338 EPHA6Q9UF33 1036 aa26.12■■□□□ 1.77
SH3BP2-212ENST00000508338 MED16Q9Y2X0 877 aa26.12■■□□□ 1.77
SH3BP2-212ENST00000508338 MED19A0JLT2 244 aaPredicted RBP26.11■■□□□ 1.77
SH3BP2-212ENST00000508338 MPC1LP0DKB6 136 aa26.11■■□□□ 1.77
SH3BP2-212ENST00000508338 LIMK2P53671 638 aa26.11■■□□□ 1.77
SH3BP2-212ENST00000508338 ZFP36L1Q07352 338 aaKnown RBP26.11■■□□□ 1.77
SH3BP2-212ENST00000508338 KBTBD12Q3ZCT8 623 aa26.11■■□□□ 1.77
SH3BP2-212ENST00000508338 GRTP1Q5TC63 336 aa26.11■■□□□ 1.77
SH3BP2-212ENST00000508338 HECTD2Q5U5R9 776 aa26.11■■□□□ 1.77
SH3BP2-212ENST00000508338 USP53Q70EK8 1073 aa26.11■■□□□ 1.77
SH3BP2-212ENST00000508338 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP26.11■■□□□ 1.77
SH3BP2-212ENST00000508338 OOSP2Q86WS3 158 aa26.11■■□□□ 1.77
SH3BP2-212ENST00000508338 RAB42Q8N4Z0 105 aa26.11■■□□□ 1.77
SH3BP2-212ENST00000508338 SIDT2Q8NBJ9 832 aaKnown RBP26.11■■□□□ 1.77
SH3BP2-212ENST00000508338 CD200R1Q8TD46 325 aa26.11■■□□□ 1.77
SH3BP2-212ENST00000508338 LCN9Q8WX39 176 aa26.11■■□□□ 1.77
SH3BP2-212ENST00000508338 NCSTNQ92542 709 aa26.11■■□□□ 1.77
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