RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492996.6

HERC4-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC4, Length 3,385 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC4-211ENST00000492996 KLHL4Q9C0H6 718 aa6.91□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 ABCG8Q9H221 673 aa6.91□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 TNKS2Q9H2K2 1166 aa6.91□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 SYTL2Q9HCH5 934 aa6.91□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 TRMT6Q9UJA5 497 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 CLEC4EQ9ULY5 219 aa6.91□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa6.91□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 NUP210LQ5VU65 1888 aa6.9□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 VPS26AO75436 327 aa6.9□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 LYNP07948 512 aa6.9□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 RHOP08100 348 aa6.9□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 GABRR2P28476 465 aa6.9□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 CLCQ05315 142 aa6.9□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 STX5Q13190 355 aa6.9□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 SQLEQ14534 574 aa6.9□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 TYSND1Q2T9J0 566 aa6.9□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 TMEM259Q4ZIN3 620 aa6.9□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 ALG1LQ6GMV1 187 aa6.9□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 GALNT7Q86SF2 657 aa6.9□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 PQLC1Q8N2U9 271 aa6.9□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 GALNT4Q8N4A0 578 aa6.9□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 FGF13Q92913 245 aa6.9□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 L3HYPDHQ96EM0 354 aa6.9□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 LINGO1Q96FE5 620 aa6.9□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 BIRC8Q96P09 236 aa6.9□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 CDK15Q96Q40 435 aa6.9□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 CD274Q9NZQ7 290 aa6.9□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 TBC1D14Q9P2M4 693 aa6.9□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 ASB1Q9Y576 335 aa6.9□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 C8AP07357 584 aa6.9□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 HGFP14210 728 aa6.9□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 IDO1P14902 403 aa6.9□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 SLC26A3P40879 764 aa6.9□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 EPHB3P54753 998 aa6.9□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 RBBP7Q16576 425 aa6.9□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 C18orf21Q32NC0 220 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 UGT3A2Q3SY77 523 aa6.9□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 VPS26BQ4G0F5 336 aa6.9□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 FAM78AQ5JUQ0 283 aa6.9□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 ANKS6Q68DC2 871 aa6.9□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 CHSY3Q70JA7 882 aa6.9□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP6.9□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 ASCL5Q7RTU5 278 aa6.9□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa6.9□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 KIAA1191Q96A73 305 aa6.9□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 EID2BQ96D98 161 aa6.9□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 LRGUKQ96M69 825 aa6.9□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 KLHL32Q96NJ5 620 aa6.9□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 TRMOQ9BU70 441 aa6.9□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 TUBB1Q9H4B7 451 aa6.9□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 HPS4Q9NQG7 708 aa6.9□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 INTS10Q9NVR2 710 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 LHX3Q9UBR4 397 aa6.9□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 SIT1Q9Y3P8 196 aa6.9□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 PKP3Q9Y446 797 aa6.9□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa6.9□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa6.9□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 TYW5A2RUC4 315 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 PRORSD1PA6NEY8 169 aa6.89□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 KDM1AO60341 852 aa6.89□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 NRP2O60462 931 aa6.89□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 RNASEH1O60930 286 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 PORP16435 677 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 UGT1A6P19224 532 aa6.89□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 UGT1A1P22309 533 aa6.89□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 UGT1A4P22310 534 aa6.89□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 S100A1P23297 94 aa6.89□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 ADSLP30566 484 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 CA5AP35218 305 aa6.89□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 UGT1A3P35503 534 aa6.89□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 UGT1A5P35504 534 aa6.89□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 CASP2P42575 452 aa6.89□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 SLC7A2P52569 658 aa6.89□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 DIO3P55073 304 aa6.89□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 HERC3Q15034 1050 aa6.89□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa6.89□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 CTSL3PQ5NE16 218 aa6.89□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 ZNF783Q6ZMS7 281 aa6.89□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 FUNDC1Q8IVP5 155 aa6.89□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 HS6ST3Q8IZP7 471 aa6.89□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 PEX13Q92968 403 aa6.89□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 ATP6V1E2Q96A05 226 aa6.89□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa6.89□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 C1orf50Q9BV19 199 aa6.89□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 BOCQ9BWV1 1114 aa6.89□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 SEMA6AQ9H2E6 1030 aa6.89□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 TFB2MQ9H5Q4 396 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 PSMD13Q9UNM6 376 aa6.89□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 DTNAQ9Y4J8 743 aa6.89□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 A0A0J9YYE9 177 aa6.89□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 SNX2O60749 519 aa6.89□□□□□ -1.31
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