RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489741.1

PRPF40A-210, Transcript of pre-mRNA processing factor 40 homolog A, humanhuman

TSL 3

Gene PRPF40A, Length 776 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40A-210ENST00000489741 KCMF1Q9P0J7 381 aa6.34□□□□□ -1.39
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PRPF40A-210ENST00000489741 IL1R2P27930 398 aa6.32□□□□□ -1.4
PRPF40A-210ENST00000489741 PCK1P35558 622 aa6.32□□□□□ -1.4
PRPF40A-210ENST00000489741 PRKCIP41743 596 aa6.32□□□□□ -1.4
PRPF40A-210ENST00000489741 CSRP3P50461 194 aa6.32□□□□□ -1.4
PRPF40A-210ENST00000489741 LIMK2P53671 638 aa6.32□□□□□ -1.4
PRPF40A-210ENST00000489741 MAZP56270 477 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
PRPF40A-210ENST00000489741 OR1D5P58170 312 aa6.32□□□□□ -1.4
PRPF40A-210ENST00000489741 CDK3Q00526 305 aa6.32□□□□□ -1.4
PRPF40A-210ENST00000489741 DPTQ07507 201 aa6.32□□□□□ -1.4
PRPF40A-210ENST00000489741 DUSP8Q13202 625 aa6.32□□□□□ -1.4
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