RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486388.5

UBP1-210, Transcript of upstream binding protein 1, human

TSL 3

Gene UBP1, Length 928 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
UBP1-210	ENST00000486388	KISS1R	Q969F8	398 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	MOCOS	Q96EN8	888 aa		4.65	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	TCTN2	Q96GX1	697 aa		4.65	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	TGM7	Q96PF1	710 aa		4.65	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	OR6C1	Q96RD1	312 aa		4.65	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	SLC25A23	Q9BV35	468 aa		4.65	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	NAA15	Q9BXJ9	866 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	GPR87	Q9BY21	358 aa		4.65	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	MAGEB5	Q9BZ81	275 aa		4.65	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	RAB6C	Q9H0N0	254 aa		4.65	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	NOD2	Q9HC29	1040 aa		4.65	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	MRPL47	Q9HD33	250 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	CASS4	Q9NQ75	786 aa		4.65	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	ACSS2	Q9NR19	701 aa		4.65	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	PKD2L2	Q9NZM6	624 aa		4.65	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	TMEM9	Q9P0T7	183 aa		4.65	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	CPNE7	Q9UBL6	633 aa		4.65	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	PCSK1N	Q9UHG2	260 aa		4.65	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	NOCT	Q9UK39	431 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	CROT	Q9UKG9	612 aa		4.65	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	TLK1	Q9UKI8	766 aa		4.65	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	PCDHB10	Q9UN67	800 aa		4.65	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	TMEM98	Q9Y2Y6	226 aa		4.65	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	ZNF451	Q9Y4E5	1061 aa		4.65	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	SCIN	Q9Y6U3	715 aa		4.65	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	C1orf232	A0A0U1RR37	186 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	TMEM82	A0PJX8	343 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	NPIPB15	A6NHN6	443 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	PDZK1P1	A8MUH7	402 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	GPR89A	B7ZAQ6	455 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	GRID2	O43424	1007 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	KLHL41	O60662	606 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	DPM1	O60762	260 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	KIAA0754	O94854	1291 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	SLC25A14	O95258	325 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	PGLS	O95336	258 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	FUCA1	P04066	466 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	KLK3	P07288	261 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	GPR89B	P0CG08	455 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	ACP5	P13686	325 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	FER	P16591	822 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	TYRP1	P17643	537 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	CHRNB2	P17787	502 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	CTPS1	P17812	591 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	NAT1	P18440	290 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	NR1D1	P20393	614 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	GNLY	P22749	145 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	LHCGR	P22888	699 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	HAL	P42357	657 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	SEPHS1	P49903	392 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	SLURP1	P55000	103 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	RRAD	P55042	308 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	RPL7A	P62424	266 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	ACY1	Q03154	408 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	SLC10A7	Q0GE19	358 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	SEMA5A	Q13591	1074 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	DNASE1L3	Q13609	305 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	CHRNA6	Q15825	494 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	INSC	Q1MX18	579 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	BOLA3	Q53S33	107 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	TDRD12	Q587J7	1177 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	ANKRD20A8P	Q5CZ79	823 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	CHCHD2P9	Q5T1J5	151 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	ZFYVE27	Q5T4F4	411 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	ATP1A1-AS1	Q5TC04	95 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	CACHD1	Q5VU97	1274 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	LRRC66	Q68CR7	880 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	CAPRIN2	Q6IMN6	1127 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	ACAD10	Q6JQN1	1059 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	TIGD7	Q6NT04	549 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	ARMC6	Q6NXE6	501 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	MON1B	Q7L1V2	547 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	MAMDC2	Q7Z304	686 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	TIPARP	Q7Z3E1	657 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	SYVN1	Q86TM6	617 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	TRIM74	Q86UV6	250 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	SIDT2	Q8NBJ9	832 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	SCAMP4	Q969E2	229 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	PPP1R14A	Q96A00	147 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	VOPP1	Q96AW1	172 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	CXorf40B	Q96DE9	158 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	RCC1L	Q96I51	464 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	ELMO2	Q96JJ3	720 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	C9orf72	Q96LT7	481 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	TTC25	Q96NG3	672 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	FCRL4	Q96PJ5	515 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	MCCC1	Q96RQ3	725 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	MGME1	Q9BQP7	344 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	SNRNP25	Q9BV90	132 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	RIOK2	Q9BVS4	552 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	TBC1D10A	Q9BXI6	508 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	ADGRE3	Q9BY15	652 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	SPRY4	Q9C004	299 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	SLC7A5P2	Q9GIP4	190 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	POLR1E	Q9GZS1	481 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	ABCG8	Q9H221	673 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	CARD9	Q9H257	536 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	FAM83D	Q9H4H8	585 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	ZNF768	Q9H5H4	540 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	UCK1	Q9HA47	277 aa		4.64	□□□□□ -1.67

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.2 ms