RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484179.5

USP34-215, Transcript of ubiquitin specific peptidase 34, human

TSL 3

Gene USP34, Length 927 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP34-215	ENST00000484179	TNFRSF4	P43489	277 aa		4.86	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	ZNF131	P52739	623 aa		4.86	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	ZNF132	P52740	706 aa		4.86	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	ATXN3	P54252	364 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	SLC12A3	P55017	1021 aa		4.86	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	KRTAP10-9	P60411	292 aa		4.86	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	SIM1	P81133	766 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	GTF2B	Q00403	316 aa		4.86	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	SRSF5	Q13243	272 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	MTF1	Q14872	753 aa		4.86	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	AP5B1	Q2VPB7	878 aa		4.86	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	AWAT1	Q58HT5	328 aa		4.86	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	SNX30	Q5VWJ9	437 aa		4.86	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	PAPD7	Q5XG87	772 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	FAM205BP	Q63HN1	556 aa		4.86	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	PMS2CL	Q68D20	193 aa		4.86	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	JADE1	Q6IE81	842 aa		4.86	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	NAPEPLD	Q6IQ20	393 aa		4.86	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	INO80C	Q6PI98	192 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	C16orf54	Q6UWD8	224 aa		4.86	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	STXBP4	Q6ZWJ1	553 aa		4.86	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	MDGA2	Q7Z553	956 aa		4.86	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	SPATA2L	Q8IUW3	424 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	HDDC3	Q8N4P3	179 aa		4.86	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	MAB21L3	Q8N8X9	362 aa		4.86	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	ATAD1	Q8NBU5	361 aa		4.86	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	STKLD1	Q8NE28	680 aa		4.86	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	ZMIZ2	Q8NF64	920 aa		4.86	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	RASSF8	Q8NHQ8	419 aa		4.86	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	SPATA17	Q96L03	361 aa		4.86	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	TRIM2	Q9C040	744 aa		4.86	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	EBF3	Q9H4W6	596 aa		4.86	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	FAM124B	Q9H5Z6	455 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	ECT2	Q9H8V3	914 aa		4.86	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	PPP1R14D	Q9NXH3	145 aa		4.86	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	DPP3	Q9NY33	737 aa		4.86	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	TAS2R10	Q9NYW0	307 aa		4.86	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	AGO2	Q9UKV8	859 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	SARDH	Q9UL12	918 aa		4.86	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	MMP17	Q9ULZ9	603 aa		4.86	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	OSGIN2	Q9Y236	505 aa		4.86	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	HEMK1	Q9Y5R4	338 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	STYXL1	Q9Y6J8	313 aa		4.86	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	DNAH14	Q0VDD8	3507 aa		4.86	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	PTPRZ1	P23471	2315 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	LNP1	A1A4G5	178 aa		4.85	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	C4orf47	A7E2U8	309 aa		4.85	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	MCIDAS	D6RGH6	385 aa		4.85	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179		H3BQV1	296 aa		4.85	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179		H7C1Q1	480 aa		4.85	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	TNFSF14	O43557	240 aa		4.85	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	JAK2	O60674	1132 aa		4.85	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	GCAT	O75600	419 aa		4.85	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	VNN2	O95498	520 aa		4.85	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	SCGB1D1	O95968	90 aa		4.85	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	EGF	P01133	1207 aa		4.85	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	IGLV2-14	P01704	120 aa		4.85	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	APOD	P05090	189 aa		4.85	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	CLEC3B	P05452	202 aa		4.85	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	HNRNPC	P07910	306 aa	Known RBP eCLIP	4.85	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	HMGA1	P17096	107 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	GAP43	P17677	238 aa		4.85	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	TGM2	P21980	687 aa		4.85	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	IDUA	P35475	653 aa		4.85	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	TNFSF9	P41273	254 aa		4.85	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	MTNR1A	P48039	350 aa		4.85	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	ADPRH	P54922	357 aa		4.85	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	DRG2	P55039	364 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	NAP1L1	P55209	391 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	GFPT1	Q06210	699 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	IL13RA2	Q14627	380 aa		4.85	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	KPNB1	Q14974	876 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	ZRSR1	Q15695	479 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	MEA1	Q16626	185 aa		4.85	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	DUOXA1	Q1HG43	343 aa		4.85	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	FAM153C	Q494X1	144 aa		4.85	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	ZNF362	Q5T0B9	420 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	STXBP5	Q5T5C0	1151 aa		4.85	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	TSTD2	Q5T7W7	516 aa		4.85	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	GJB7	Q6PEY0	223 aa		4.85	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	CPLX4	Q7Z7G2	160 aa		4.85	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	TMEM200A	Q86VY9	491 aa		4.85	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	RFX6	Q8HWS3	928 aa		4.85	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	CCDC83	Q8IWF9	413 aa		4.85	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	ENGASE	Q8NFI3	743 aa		4.85	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	TNIP2	Q8NFZ5	429 aa		4.85	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	OR10T2	Q8NGX3	314 aa		4.85	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	METTL6	Q8TCB7	284 aa		4.85	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	RAB40A	Q8WXH6	277 aa		4.85	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	POMGNT1	Q8WZA1	660 aa		4.85	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	NCSTN	Q92542	709 aa		4.85	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	REPS1	Q96D71	796 aa		4.85	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	ANKRD36BP1	Q96IX9	119 aa		4.85	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	ZFYVE19	Q96K21	471 aa		4.85	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	LRRC3B	Q96PB8	259 aa		4.85	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	SLITRK1	Q96PX8	696 aa		4.85	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	NR1H4	Q96RI1	486 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	GATA5	Q9BWX5	397 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	NPL	Q9BXD5	320 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
USP34-215	ENST00000484179	DNAI2	Q9GZS0	605 aa		4.85	□□□□□ -1.63

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