RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480420.5

CTPS1-209, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 3

Gene CTPS1, Length 750 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-209ENST00000480420 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP7.86□□□□□ -1.15
CTPS1-209ENST00000480420 BCL7AQ4VC05 210 aa7.86□□□□□ -1.15
CTPS1-209ENST00000480420 DENND5AQ6IQ26 1287 aa7.86□□□□□ -1.15
CTPS1-209ENST00000480420 GSTA5Q7RTV2 222 aa7.86□□□□□ -1.15
CTPS1-209ENST00000480420 LINC00523Q86TU6 105 aa7.86□□□□□ -1.15
CTPS1-209ENST00000480420 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP7.86□□□□□ -1.15
CTPS1-209ENST00000480420 KLHL6Q8WZ60 621 aa7.86□□□□□ -1.15
CTPS1-209ENST00000480420 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP7.86□□□□□ -1.15
CTPS1-209ENST00000480420 CDKN2AIPNLQ96HQ2 116 aa7.86□□□□□ -1.15
CTPS1-209ENST00000480420 RUFY1Q96T51 708 aa7.86□□□□□ -1.15
CTPS1-209ENST00000480420 ADNPQ9H2P0 1102 aa7.86□□□□□ -1.15
CTPS1-209ENST00000480420 ACTL8Q9H568 366 aa7.86□□□□□ -1.15
CTPS1-209ENST00000480420 KIR3DX1Q9H7L2 352 aa7.86□□□□□ -1.15
CTPS1-209ENST00000480420 COG4Q9H9E3 785 aa7.86□□□□□ -1.15
CTPS1-209ENST00000480420 AKIRIN1Q9H9L7 192 aaPredicted RBP7.86□□□□□ -1.15
CTPS1-209ENST00000480420 LZTFL1Q9NQ48 299 aa7.86□□□□□ -1.15
CTPS1-209ENST00000480420 LHX9Q9NQ69 397 aa7.86□□□□□ -1.15
CTPS1-209ENST00000480420 KCND1Q9NSA2 647 aa7.86□□□□□ -1.15
CTPS1-209ENST00000480420 NLE1Q9NVX2 485 aaPredicted RBP7.86□□□□□ -1.15
CTPS1-209ENST00000480420 MAP10Q9P2G4 905 aa7.86□□□□□ -1.15
CTPS1-209ENST00000480420 EPHA6Q9UF33 1036 aa7.86□□□□□ -1.15
CTPS1-209ENST00000480420 CIDEBQ9UHD4 219 aa7.86□□□□□ -1.15
CTPS1-209ENST00000480420 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP7.86□□□□□ -1.15
CTPS1-209ENST00000480420 PLAGL1Q9UM63 463 aa7.86□□□□□ -1.15
CTPS1-209ENST00000480420 ASF1AQ9Y294 204 aa7.86□□□□□ -1.15
CTPS1-209ENST00000480420 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa7.86□□□□□ -1.15
CTPS1-209ENST00000480420 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa7.86□□□□□ -1.15
CTPS1-209ENST00000480420 UNC79Q9P2D8 2635 aa7.86□□□□□ -1.15
CTPS1-209ENST00000480420 COL12A1Q99715 3063 aa7.85□□□□□ -1.15
CTPS1-209ENST00000480420 CCDC162PA2VCL2 907 aa7.85□□□□□ -1.15
CTPS1-209ENST00000480420 PRR19A6NJB7 356 aa7.85□□□□□ -1.15
CTPS1-209ENST00000480420 ARGFXA6NJG6 315 aa7.85□□□□□ -1.15
CTPS1-209ENST00000480420 ISM1B1AKI9 464 aa7.85□□□□□ -1.15
CTPS1-209ENST00000480420 MKRN2OSH3BPM6 223 aa7.85□□□□□ -1.15
CTPS1-209ENST00000480420 SUV39H1O43463 412 aa7.85□□□□□ -1.15
CTPS1-209ENST00000480420 KRT86O43790 486 aa7.85□□□□□ -1.15
CTPS1-209ENST00000480420 CPNE3O75131 537 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
CTPS1-209ENST00000480420 CREG1O75629 220 aa7.85□□□□□ -1.15
CTPS1-209ENST00000480420 DNAJB5O75953 348 aa7.85□□□□□ -1.15
CTPS1-209ENST00000480420 APRTP07741 180 aa7.85□□□□□ -1.15
CTPS1-209ENST00000480420 FURINP09958 794 aa7.85□□□□□ -1.15
CTPS1-209ENST00000480420 PRLHRP49683 370 aa7.85□□□□□ -1.15
CTPS1-209ENST00000480420 CCL11P51671 97 aa7.85□□□□□ -1.15
CTPS1-209ENST00000480420 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP7.85□□□□□ -1.15
CTPS1-209ENST00000480420 PRAMEP78395 509 aa7.85□□□□□ -1.15
CTPS1-209ENST00000480420 RPS6KA1Q15418 735 aa7.85□□□□□ -1.15
CTPS1-209ENST00000480420 IGFBP7Q16270 282 aa7.85□□□□□ -1.15
CTPS1-209ENST00000480420 DBN1Q16643 649 aa7.85□□□□□ -1.15
CTPS1-209ENST00000480420 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP7.85□□□□□ -1.15
CTPS1-209ENST00000480420 LACTB2Q53H82 288 aaPredicted RBP7.85□□□□□ -1.15
CTPS1-209ENST00000480420 FAM69BQ5VUD6 431 aa7.85□□□□□ -1.15
CTPS1-209ENST00000480420 TRIM73Q86UV7 250 aa7.85□□□□□ -1.15
CTPS1-209ENST00000480420 TAX1BP1Q86VP1 789 aa7.85□□□□□ -1.15
CTPS1-209ENST00000480420 AMIGO1Q86WK6 493 aa7.85□□□□□ -1.15
CTPS1-209ENST00000480420 C2orf73Q8N5S3 287 aaPredicted RBP7.85□□□□□ -1.15
CTPS1-209ENST00000480420 TEX19Q8NA77 164 aa7.85□□□□□ -1.15
CTPS1-209ENST00000480420 ACVR1CQ8NER5 493 aa7.85□□□□□ -1.15
CTPS1-209ENST00000480420 OR52E1Q8NGJ3 308 aa7.85□□□□□ -1.15
CTPS1-209ENST00000480420 DTX3LQ8TDB6 740 aa7.85□□□□□ -1.15
CTPS1-209ENST00000480420 STYXQ8WUJ0 223 aa7.85□□□□□ -1.15
CTPS1-209ENST00000480420 TFGQ92734 400 aaPredicted RBP7.85□□□□□ -1.15
CTPS1-209ENST00000480420 HDAC10Q969S8 669 aa7.85□□□□□ -1.15
CTPS1-209ENST00000480420 CD180Q99467 661 aa7.85□□□□□ -1.15
CTPS1-209ENST00000480420 TTC1Q99614 292 aa7.85□□□□□ -1.15
CTPS1-209ENST00000480420 SPRY4Q9C004 299 aa7.85□□□□□ -1.15
CTPS1-209ENST00000480420 ETNK1Q9HBU6 452 aa7.85□□□□□ -1.15
CTPS1-209ENST00000480420 RAB6BQ9NRW1 208 aa7.85□□□□□ -1.15
CTPS1-209ENST00000480420 SLC2A6Q9UGQ3 507 aa7.85□□□□□ -1.15
CTPS1-209ENST00000480420 METRNQ9UJH8 293 aa7.85□□□□□ -1.15
CTPS1-209ENST00000480420 ANAPC5Q9UJX4 755 aa7.85□□□□□ -1.15
CTPS1-209ENST00000480420 POLHQ9Y253 713 aa7.85□□□□□ -1.15
CTPS1-209ENST00000480420 TP53TG5Q9Y2B4 290 aa7.85□□□□□ -1.15
CTPS1-209ENST00000480420 PRSS21Q9Y6M0 314 aa7.85□□□□□ -1.15
CTPS1-209ENST00000480420 SNRNP200O75643 2136 aaKnown RBP7.84□□□□□ -1.15
CTPS1-209ENST00000480420 KLHL33A6NCF5 533 aa7.84□□□□□ -1.15
CTPS1-209ENST00000480420 A6NL46 340 aa7.84□□□□□ -1.15
CTPS1-209ENST00000480420 C2orf74A8MZ97 194 aa7.84□□□□□ -1.15
CTPS1-209ENST00000480420 BTN3A3O00478 584 aa7.84□□□□□ -1.15
CTPS1-209ENST00000480420 BTN3A1O00481 513 aa7.84□□□□□ -1.15
CTPS1-209ENST00000480420 SGTAO43765 313 aa7.84□□□□□ -1.15
CTPS1-209ENST00000480420 OR1I1O60431 355 aa7.84□□□□□ -1.15
CTPS1-209ENST00000480420 RFPL1O75677 317 aa7.84□□□□□ -1.15
CTPS1-209ENST00000480420 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP7.84□□□□□ -1.15
CTPS1-209ENST00000480420 AP2A1O95782 977 aa7.84□□□□□ -1.15
CTPS1-209ENST00000480420 FTH1P02794 183 aa7.84□□□□□ -1.15
CTPS1-209ENST00000480420 OR56A5P0C7T3 313 aa7.84□□□□□ -1.15
CTPS1-209ENST00000480420 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa7.84□□□□□ -1.15
CTPS1-209ENST00000480420 ST6GAL1P15907 406 aa7.84□□□□□ -1.15
CTPS1-209ENST00000480420 PRDX3P30048 256 aaKnown RBP7.84□□□□□ -1.15
CTPS1-209ENST00000480420 GRIA1P42261 906 aa7.84□□□□□ -1.15
CTPS1-209ENST00000480420 CSRP3P50461 194 aa7.84□□□□□ -1.15
CTPS1-209ENST00000480420 TUBB4BP68371 445 aa7.84□□□□□ -1.15
CTPS1-209ENST00000480420 BASP1P80723 227 aaKnown RBP7.84□□□□□ -1.15
CTPS1-209ENST00000480420 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP7.84□□□□□ -1.15
CTPS1-209ENST00000480420 HSPA14Q0VDF9 509 aa7.84□□□□□ -1.15
CTPS1-209ENST00000480420 CDH17Q12864 832 aa7.84□□□□□ -1.15
CTPS1-209ENST00000480420 ABRQ12979 859 aa7.84□□□□□ -1.15
CTPS1-209ENST00000480420 TUBB2AQ13885 445 aa7.84□□□□□ -1.15
CTPS1-209ENST00000480420 MAP7Q14244 749 aa7.84□□□□□ -1.15
CTPS1-209ENST00000480420 DEFB110Q30KQ9 67 aa7.84□□□□□ -1.15
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