RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480301.1

ACTB-211, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ACTB, Length 657 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-211ENST00000480301 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
ACTB-211ENST00000480301 FOXJ2Q9P0K8 574 aa20.4■□□□□ 0.86
ACTB-211ENST00000480301 ACSL6Q9UKU0 697 aa20.4■□□□□ 0.86
ACTB-211ENST00000480301 FAM169AQ9Y6X4 670 aa20.4■□□□□ 0.86
ACTB-211ENST00000480301 SMAPO00193 183 aa20.39■□□□□ 0.85
ACTB-211ENST00000480301 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
ACTB-211ENST00000480301 S1PR4O95977 384 aa20.39■□□□□ 0.85
ACTB-211ENST00000480301 PGAM1P18669 254 aa20.39■□□□□ 0.85
ACTB-211ENST00000480301 FMO4P31512 558 aa20.39■□□□□ 0.85
ACTB-211ENST00000480301 ITGA8P53708 1063 aa20.39■□□□□ 0.85
ACTB-211ENST00000480301 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
ACTB-211ENST00000480301 ADARP55265 1226 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
ACTB-211ENST00000480301 HSPA14Q0VDF9 509 aa20.39■□□□□ 0.85
ACTB-211ENST00000480301 LONRF1Q17RB8 773 aa20.39■□□□□ 0.85
ACTB-211ENST00000480301 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
ACTB-211ENST00000480301 ZNF789Q5FWF6 425 aa20.39■□□□□ 0.85
ACTB-211ENST00000480301 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.85
ACTB-211ENST00000480301 FAM92BQ6ZTR7 304 aa20.39■□□□□ 0.85
ACTB-211ENST00000480301 PRSS42Q7Z5A4 293 aa20.39■□□□□ 0.85
ACTB-211ENST00000480301 VRK3Q8IV63 474 aa20.39■□□□□ 0.85
ACTB-211ENST00000480301 IGDCC3Q8IVU1 814 aa20.39■□□□□ 0.85
ACTB-211ENST00000480301 SLC22A15Q8IZD6 547 aa20.39■□□□□ 0.85
ACTB-211ENST00000480301 OR4E2Q8NGC2 313 aa20.39■□□□□ 0.85
ACTB-211ENST00000480301 OR52E1Q8NGJ3 308 aa20.39■□□□□ 0.85
ACTB-211ENST00000480301 ASZ1Q8WWH4 475 aa20.39■□□□□ 0.85
ACTB-211ENST00000480301 ART4Q93070 314 aa20.39■□□□□ 0.85
ACTB-211ENST00000480301 PANX3Q96QZ0 392 aa20.39■□□□□ 0.85
ACTB-211ENST00000480301 TAAR9Q96RI9 348 aa20.39■□□□□ 0.85
ACTB-211ENST00000480301 NRTNQ99748 197 aa20.39■□□□□ 0.85
ACTB-211ENST00000480301 TFB2MQ9H5Q4 396 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
ACTB-211ENST00000480301 HRASLS2Q9NWW9 162 aa20.39■□□□□ 0.85
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ACTB-211ENST00000480301 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa20.39■□□□□ 0.85
ACTB-211ENST00000480301 LAMA5O15230 3695 aa20.39■□□□□ 0.85
ACTB-211ENST00000480301 AHCTF1Q8WYP5 2266 aa20.38■□□□□ 0.85
ACTB-211ENST00000480301 OR6C74A6NCV1 312 aa20.38■□□□□ 0.85
ACTB-211ENST00000480301 EFCAB8A8MWE9 144 aa20.38■□□□□ 0.85
ACTB-211ENST00000480301 PFDN6O15212 129 aa20.38■□□□□ 0.85
ACTB-211ENST00000480301 F7P08709 466 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
ACTB-211ENST00000480301 MC2RQ01718 297 aa20.38■□□□□ 0.85
ACTB-211ENST00000480301 C2orf54Q08AI8 447 aa20.38■□□□□ 0.85
ACTB-211ENST00000480301 PRKG2Q13237 762 aa20.38■□□□□ 0.85
ACTB-211ENST00000480301 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
ACTB-211ENST00000480301 BBS9Q3SYG4 887 aa20.38■□□□□ 0.85
ACTB-211ENST00000480301 CACHD1Q5VU97 1274 aa20.38■□□□□ 0.85
ACTB-211ENST00000480301 C19orf48Q6RUI8 117 aa20.38■□□□□ 0.85
ACTB-211ENST00000480301 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa20.38■□□□□ 0.85
ACTB-211ENST00000480301 FAM129CQ86XR2 697 aa20.38■□□□□ 0.85
ACTB-211ENST00000480301 DENND6AQ8IWF6 608 aa20.38■□□□□ 0.85
ACTB-211ENST00000480301 SPACA3Q8IXA5 215 aa20.38■□□□□ 0.85
ACTB-211ENST00000480301 UNC5BQ8IZJ1 945 aa20.38■□□□□ 0.85
ACTB-211ENST00000480301 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP20.38■□□□□ 0.856e-10■■■□□ 16.5
ACTB-211ENST00000480301 OR5AR1Q8NGP9 310 aa20.38■□□□□ 0.85
ACTB-211ENST00000480301 KCNE4Q8WWG9 221 aa20.38■□□□□ 0.85
ACTB-211ENST00000480301 LCN9Q8WX39 176 aa20.38■□□□□ 0.85
ACTB-211ENST00000480301 SNF8Q96H20 258 aa20.38■□□□□ 0.85
ACTB-211ENST00000480301 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
ACTB-211ENST00000480301 ZNF768Q9H5H4 540 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
ACTB-211ENST00000480301 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
ACTB-211ENST00000480301 SLC39A1Q9NY26 324 aa20.38■□□□□ 0.85
ACTB-211ENST00000480301 ASF1AQ9Y294 204 aa20.38■□□□□ 0.85
ACTB-211ENST00000480301 CRYL1Q9Y2S2 319 aa20.38■□□□□ 0.85
ACTB-211ENST00000480301 SNX24Q9Y343 169 aa20.38■□□□□ 0.85
ACTB-211ENST00000480301 SLCO2B1O94956 709 aa20.37■□□□□ 0.85
ACTB-211ENST00000480301 APOA4P06727 396 aa20.37■□□□□ 0.85
ACTB-211ENST00000480301 RPL21P46778 160 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
ACTB-211ENST00000480301 SEPHS1P49903 392 aa20.37■□□□□ 0.85
ACTB-211ENST00000480301 CTBP1Q13363 440 aa20.37■□□□□ 0.85
ACTB-211ENST00000480301 CRYMQ14894 314 aa20.37■□□□□ 0.85
ACTB-211ENST00000480301 TMEM164Q5U3C3 297 aa20.37■□□□□ 0.85
ACTB-211ENST00000480301 ZNF470Q6ECI4 717 aa20.37■□□□□ 0.85
ACTB-211ENST00000480301 OOSP2Q86WS3 158 aa20.37■□□□□ 0.85
ACTB-211ENST00000480301 PDIK1LQ8N165 341 aa20.37■□□□□ 0.85
ACTB-211ENST00000480301 KLHL6Q8WZ60 621 aa20.37■□□□□ 0.85
ACTB-211ENST00000480301 HGH1Q9BTY7 390 aa20.37■□□□□ 0.85
ACTB-211ENST00000480301 PLAC1Q9HBJ0 212 aa20.37■□□□□ 0.85
ACTB-211ENST00000480301 INTS10Q9NVR2 710 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
ACTB-211ENST00000480301 SIDT1Q9NXL6 827 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
ACTB-211ENST00000480301 B3GALT1Q9Y5Z6 326 aa20.37■□□□□ 0.85
ACTB-211ENST00000480301 FAM187AA6NFU0 413 aa20.36■□□□□ 0.85
ACTB-211ENST00000480301 RAD51CO43502 376 aa20.36■□□□□ 0.85
ACTB-211ENST00000480301 NIPSNAP2O75323 286 aa20.36■□□□□ 0.85
ACTB-211ENST00000480301 RASSF9O75901 435 aa20.36■□□□□ 0.85
ACTB-211ENST00000480301 ESR1P03372 595 aa20.36■□□□□ 0.85
ACTB-211ENST00000480301 TPBGLP0DKB5 382 aa20.36■□□□□ 0.85
ACTB-211ENST00000480301 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
ACTB-211ENST00000480301 TLE3Q04726 772 aa20.36■□□□□ 0.85
ACTB-211ENST00000480301 COL28A1Q2UY09 1125 aa20.36■□□□□ 0.85
ACTB-211ENST00000480301 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa20.36■□□□□ 0.85
ACTB-211ENST00000480301 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
ACTB-211ENST00000480301 ZFAND4Q86XD8 727 aa20.36■□□□□ 0.85
ACTB-211ENST00000480301 LMNTD2Q8IXW0 634 aa20.36■□□□□ 0.85
ACTB-211ENST00000480301 TBC1D21Q8IYX1 336 aa20.36■□□□□ 0.85
ACTB-211ENST00000480301 OR5K2Q8NHB8 316 aa20.36■□□□□ 0.85
ACTB-211ENST00000480301 MAP3K3Q99759 626 aa20.36■□□□□ 0.85
ACTB-211ENST00000480301 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
ACTB-211ENST00000480301 ERP44Q9BS26 406 aa20.36■□□□□ 0.85
ACTB-211ENST00000480301 NAT9Q9BTE0 207 aa20.36■□□□□ 0.85
ACTB-211ENST00000480301 DDA1Q9BW61 102 aa20.36■□□□□ 0.85
ACTB-211ENST00000480301 DPH1Q9BZG8 443 aa20.36■□□□□ 0.85
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