RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466141.1

RPUSD3-212, Transcript of RNA pseudouridylate synthase domain containing 3, humanhuman

TSL 2

Gene RPUSD3, Length 996 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD3-212ENST00000466141 OXTRP30559 389 aa7.22□□□□□ -1.25
RPUSD3-212ENST00000466141 CASP14P31944 242 aa7.22□□□□□ -1.25
RPUSD3-212ENST00000466141 CCR1P32246 355 aa7.22□□□□□ -1.25
RPUSD3-212ENST00000466141 TRHRP34981 398 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
RPUSD3-212ENST00000466141 GGCXP38435 758 aa7.22□□□□□ -1.25
RPUSD3-212ENST00000466141 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
RPUSD3-212ENST00000466141 PTPN9P43378 593 aa7.22□□□□□ -1.25
RPUSD3-212ENST00000466141 GRIA4P48058 902 aa7.22□□□□□ -1.25
RPUSD3-212ENST00000466141 IRAK1P51617 712 aa7.22□□□□□ -1.25
RPUSD3-212ENST00000466141 IST1P53990 364 aa7.22□□□□□ -1.25
RPUSD3-212ENST00000466141 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
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RPUSD3-212ENST00000466141 CHRNEQ04844 493 aa7.22□□□□□ -1.25
RPUSD3-212ENST00000466141 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
RPUSD3-212ENST00000466141 NME3Q13232 169 aa7.22□□□□□ -1.25
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RPUSD3-212ENST00000466141 SPARCL1Q14515 664 aa7.22□□□□□ -1.25
RPUSD3-212ENST00000466141 ZNF234Q14588 700 aa7.22□□□□□ -1.25
RPUSD3-212ENST00000466141 CYTH1Q15438 398 aa7.22□□□□□ -1.25
RPUSD3-212ENST00000466141 SHBQ15464 509 aa7.22□□□□□ -1.25
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RPUSD3-212ENST00000466141 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
RPUSD3-212ENST00000466141 RAP1GAP2Q684P5 730 aa7.22□□□□□ -1.25
RPUSD3-212ENST00000466141 TMEM215Q68D42 235 aa7.22□□□□□ -1.25
RPUSD3-212ENST00000466141 KCTD16Q68DU8 428 aa7.22□□□□□ -1.25
RPUSD3-212ENST00000466141 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa7.22□□□□□ -1.25
RPUSD3-212ENST00000466141 DNAJC24Q6P3W2 148 aa7.22□□□□□ -1.25
RPUSD3-212ENST00000466141 WDR59Q6PJI9 974 aa7.22□□□□□ -1.25
RPUSD3-212ENST00000466141 KDM7AQ6ZMT4 941 aa7.22□□□□□ -1.25
RPUSD3-212ENST00000466141 KCTD20Q7Z5Y7 419 aa7.22□□□□□ -1.25
RPUSD3-212ENST00000466141 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa7.22□□□□□ -1.25
RPUSD3-212ENST00000466141 CNGA4Q8IV77 575 aa7.22□□□□□ -1.25
RPUSD3-212ENST00000466141 SLITRK4Q8IW52 837 aa7.22□□□□□ -1.25
RPUSD3-212ENST00000466141 ZNF683Q8IZ20 524 aa7.22□□□□□ -1.25
RPUSD3-212ENST00000466141 MCOLN2Q8IZK6 566 aa7.22□□□□□ -1.25
RPUSD3-212ENST00000466141 SLC38A6Q8IZM9 456 aa7.22□□□□□ -1.25
RPUSD3-212ENST00000466141 EID2Q8N6I1 236 aa7.22□□□□□ -1.25
RPUSD3-212ENST00000466141 ZNF366Q8N895 744 aa7.22□□□□□ -1.25
RPUSD3-212ENST00000466141 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa7.22□□□□□ -1.25
RPUSD3-212ENST00000466141 TC2NQ8N9U0 490 aa7.22□□□□□ -1.25
RPUSD3-212ENST00000466141 MOSPD2Q8NHP6 518 aa7.22□□□□□ -1.25
RPUSD3-212ENST00000466141 TSPEARQ8WU66 669 aa7.22□□□□□ -1.25
RPUSD3-212ENST00000466141 RASSF5Q8WWW0 418 aa7.22□□□□□ -1.25
RPUSD3-212ENST00000466141 RXFP2Q8WXD0 754 aa7.22□□□□□ -1.25
RPUSD3-212ENST00000466141 RFKQ969G6 155 aa7.22□□□□□ -1.25
RPUSD3-212ENST00000466141 SGF29Q96ES7 293 aa7.22□□□□□ -1.25
RPUSD3-212ENST00000466141 VCPIP1Q96JH7 1222 aa7.22□□□□□ -1.25
RPUSD3-212ENST00000466141 CLUHP3Q96NS8 147 aa7.22□□□□□ -1.25
RPUSD3-212ENST00000466141 MCEEQ96PE7 176 aa7.22□□□□□ -1.25
RPUSD3-212ENST00000466141 LGMNQ99538 433 aa7.22□□□□□ -1.25
RPUSD3-212ENST00000466141 SLC29A1Q99808 456 aa7.22□□□□□ -1.25
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RPUSD3-212ENST00000466141 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP7.22□□□□□ -1.25
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RPUSD3-212ENST00000466141 ACAT2Q9BWD1 397 aa7.22□□□□□ -1.25
RPUSD3-212ENST00000466141 SLC2A11Q9BYW1 496 aa7.22□□□□□ -1.25
RPUSD3-212ENST00000466141 RAB6CQ9H0N0 254 aa7.22□□□□□ -1.25
RPUSD3-212ENST00000466141 TMEM245Q9H330 911 aa7.22□□□□□ -1.25
RPUSD3-212ENST00000466141 OR51B5Q9H339 312 aa7.22□□□□□ -1.25
RPUSD3-212ENST00000466141 GHITMQ9H3K2 345 aa7.22□□□□□ -1.25
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RPUSD3-212ENST00000466141 GORASP2Q9H8Y8 452 aa7.22□□□□□ -1.25
RPUSD3-212ENST00000466141 VIPAS39Q9H9C1 493 aa7.22□□□□□ -1.25
RPUSD3-212ENST00000466141 KCNK13Q9HB14 408 aa7.22□□□□□ -1.25
RPUSD3-212ENST00000466141 NOD2Q9HC29 1040 aa7.22□□□□□ -1.25
RPUSD3-212ENST00000466141 DDX28Q9NUL7 540 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
RPUSD3-212ENST00000466141 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa7.22□□□□□ -1.25
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RPUSD3-212ENST00000466141 TRIM33Q9UPN9 1127 aa7.22□□□□□ -1.25
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RPUSD3-212ENST00000466141 B2RBV5 119 aa7.21□□□□□ -1.26
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RPUSD3-212ENST00000466141 SLCO1B7G3V0H7 640 aa7.21□□□□□ -1.26
RPUSD3-212ENST00000466141 H3BQF6 201 aa7.21□□□□□ -1.26
RPUSD3-212ENST00000466141 SHOXO15266 292 aa7.21□□□□□ -1.26
RPUSD3-212ENST00000466141 KRT86O43790 486 aa7.21□□□□□ -1.26
RPUSD3-212ENST00000466141 ATP6V1G2O95670 118 aa7.21□□□□□ -1.26
RPUSD3-212ENST00000466141 SEMA4FO95754 770 aa7.21□□□□□ -1.26
RPUSD3-212ENST00000466141 CHEK2O96017 543 aa7.21□□□□□ -1.26
RPUSD3-212ENST00000466141 F9P00740 461 aa7.21□□□□□ -1.26
RPUSD3-212ENST00000466141 WNT1P04628 370 aa7.21□□□□□ -1.26
RPUSD3-212ENST00000466141 EPHX1P07099 455 aa7.21□□□□□ -1.26
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