RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466097.1

SH3BP1-205, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 777 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-205ENST00000466097 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP14.37□□□□□ -0.11
SH3BP1-205ENST00000466097 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa14.37□□□□□ -0.11
SH3BP1-205ENST00000466097 CACHD1Q5VU97 1274 aa14.37□□□□□ -0.11
SH3BP1-205ENST00000466097 IZUMO3Q5VZ72 239 aa14.37□□□□□ -0.11
SH3BP1-205ENST00000466097 CEACAM20Q6UY09 585 aa14.37□□□□□ -0.11
SH3BP1-205ENST00000466097 FAM92BQ6ZTR7 304 aa14.37□□□□□ -0.11
SH3BP1-205ENST00000466097 GSDMBQ8TAX9 411 aa14.37□□□□□ -0.11
SH3BP1-205ENST00000466097 ASZ1Q8WWH4 475 aa14.37□□□□□ -0.11
SH3BP1-205ENST00000466097 LCN9Q8WX39 176 aa14.37□□□□□ -0.11
SH3BP1-205ENST00000466097 UBXN4Q92575 508 aa14.37□□□□□ -0.11
SH3BP1-205ENST00000466097 CD180Q99467 661 aa14.37□□□□□ -0.11
SH3BP1-205ENST00000466097 SRMSQ9H3Y6 488 aa14.37□□□□□ -0.11
SH3BP1-205ENST00000466097 ZNF768Q9H5H4 540 aaKnown RBP14.37□□□□□ -0.11
SH3BP1-205ENST00000466097 WDR70Q9NW82 654 aa14.37□□□□□ -0.11
SH3BP1-205ENST00000466097 HRASLS2Q9NWW9 162 aa14.37□□□□□ -0.11
SH3BP1-205ENST00000466097 LHX6Q9UPM6 363 aa14.37□□□□□ -0.11
SH3BP1-205ENST00000466097 ASF1AQ9Y294 204 aa14.37□□□□□ -0.11
SH3BP1-205ENST00000466097 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa14.37□□□□□ -0.11
SH3BP1-205ENST00000466097 PCM1Q15154 2024 aa14.36□□□□□ -0.11
SH3BP1-205ENST00000466097 OR6C74A6NCV1 312 aa14.36□□□□□ -0.11
SH3BP1-205ENST00000466097 TLCD2A6NGC4 264 aa14.36□□□□□ -0.11
SH3BP1-205ENST00000466097 GOLGA8KD6RF30 607 aa14.36□□□□□ -0.11
SH3BP1-205ENST00000466097 GOLGA8TH3BQL2 631 aa14.36□□□□□ -0.11
SH3BP1-205ENST00000466097 SMAPO00193 183 aa14.36□□□□□ -0.11
SH3BP1-205ENST00000466097 MATN2O00339 956 aa14.36□□□□□ -0.11
SH3BP1-205ENST00000466097 KDM1AO60341 852 aa14.36□□□□□ -0.11
SH3BP1-205ENST00000466097 USP1O94782 785 aa14.36□□□□□ -0.11
SH3BP1-205ENST00000466097 LIPCP11150 499 aa14.36□□□□□ -0.11
SH3BP1-205ENST00000466097 ARCN1P48444 511 aaKnown RBP14.36□□□□□ -0.11
SH3BP1-205ENST00000466097 SEPHS1P49903 392 aa14.36□□□□□ -0.11
SH3BP1-205ENST00000466097 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP14.36□□□□□ -0.11
SH3BP1-205ENST00000466097 HSPA14Q0VDF9 509 aa14.36□□□□□ -0.11
SH3BP1-205ENST00000466097 TYSND1Q2T9J0 566 aa14.36□□□□□ -0.11
SH3BP1-205ENST00000466097 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP14.36□□□□□ -0.11
SH3BP1-205ENST00000466097 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP14.36□□□□□ -0.11
SH3BP1-205ENST00000466097 NEPROQ6NW34 567 aa14.36□□□□□ -0.11
SH3BP1-205ENST00000466097 CYB5D1Q6P9G0 228 aa14.36□□□□□ -0.11
SH3BP1-205ENST00000466097 TMEM135Q86UB9 458 aa14.36□□□□□ -0.11
SH3BP1-205ENST00000466097 TBC1D21Q8IYX1 336 aa14.36□□□□□ -0.11
SH3BP1-205ENST00000466097 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP14.36□□□□□ -0.11
SH3BP1-205ENST00000466097 BMPERQ8N8U9 685 aa14.36□□□□□ -0.11
SH3BP1-205ENST00000466097 OR4E2Q8NGC2 313 aa14.36□□□□□ -0.11
SH3BP1-205ENST00000466097 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa14.36□□□□□ -0.11
SH3BP1-205ENST00000466097 ZPBPQ9BS86 351 aa14.36□□□□□ -0.11
SH3BP1-205ENST00000466097 HGH1Q9BTY7 390 aa14.36□□□□□ -0.11
SH3BP1-205ENST00000466097 P2RY12Q9H244 342 aa14.36□□□□□ -0.11
SH3BP1-205ENST00000466097 TRIT1Q9H3H1 467 aaKnown RBP14.36□□□□□ -0.11
SH3BP1-205ENST00000466097 FBXO8Q9NRD0 319 aa14.36□□□□□ -0.11
SH3BP1-205ENST00000466097 FOXJ2Q9P0K8 574 aa14.36□□□□□ -0.11
SH3BP1-205ENST00000466097 POLG2Q9UHN1 485 aa14.36□□□□□ -0.11
SH3BP1-205ENST00000466097 H3BMM5 538 aa14.35□□□□□ -0.11
SH3BP1-205ENST00000466097 STMND1H3BQB6 276 aa14.35□□□□□ -0.11
SH3BP1-205ENST00000466097 NDC80O14777 642 aa14.35□□□□□ -0.11
SH3BP1-205ENST00000466097 POLR1CO15160 346 aaPredicted RBP14.35□□□□□ -0.11
SH3BP1-205ENST00000466097 FANCGO15287 622 aa14.35□□□□□ -0.11
SH3BP1-205ENST00000466097 RPN2P04844 631 aa14.35□□□□□ -0.11
SH3BP1-205ENST00000466097 ACADLP28330 430 aa14.35□□□□□ -0.11
SH3BP1-205ENST00000466097 CCR7P32248 378 aa14.35□□□□□ -0.11
SH3BP1-205ENST00000466097 ARL4DP49703 201 aa14.35□□□□□ -0.11
SH3BP1-205ENST00000466097 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP14.35□□□□□ -0.11
SH3BP1-205ENST00000466097 TMPRSS3P57727 454 aa14.35□□□□□ -0.11
SH3BP1-205ENST00000466097 CLN3Q13286 438 aa14.35□□□□□ -0.11
SH3BP1-205ENST00000466097 MORF4L2Q15014 288 aa14.35□□□□□ -0.11
SH3BP1-205ENST00000466097 LONRF1Q17RB8 773 aa14.35□□□□□ -0.11
SH3BP1-205ENST00000466097 ANKS6Q68DC2 871 aa14.35□□□□□ -0.11
SH3BP1-205ENST00000466097 NAPRTQ6XQN6 538 aa14.35□□□□□ -0.11
SH3BP1-205ENST00000466097 KMT5CQ86Y97 462 aa14.35□□□□□ -0.11
SH3BP1-205ENST00000466097 CILP2Q8IUL8 1156 aa14.35□□□□□ -0.11
SH3BP1-205ENST00000466097 LMNTD2Q8IXW0 634 aa14.35□□□□□ -0.11
SH3BP1-205ENST00000466097 SLC22A15Q8IZD6 547 aa14.35□□□□□ -0.11
SH3BP1-205ENST00000466097 CARFQ8N187 725 aa14.35□□□□□ -0.11
SH3BP1-205ENST00000466097 KRT222Q8N1A0 295 aa14.35□□□□□ -0.11
SH3BP1-205ENST00000466097 PHC3Q8NDX5 983 aa14.35□□□□□ -0.11
SH3BP1-205ENST00000466097 OR52E1Q8NGJ3 308 aa14.35□□□□□ -0.11
SH3BP1-205ENST00000466097 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP14.35□□□□□ -0.11
SH3BP1-205ENST00000466097 CALML6Q8TD86 181 aa14.35□□□□□ -0.11
SH3BP1-205ENST00000466097 KLHL6Q8WZ60 621 aa14.35□□□□□ -0.11
SH3BP1-205ENST00000466097 SIGLEC10Q96LC7 697 aa14.35□□□□□ -0.11
SH3BP1-205ENST00000466097 NAT9Q9BTE0 207 aa14.35□□□□□ -0.11
SH3BP1-205ENST00000466097 TFB2MQ9H5Q4 396 aaKnown RBP14.35□□□□□ -0.11
SH3BP1-205ENST00000466097 INTS10Q9NVR2 710 aaKnown RBP14.35□□□□□ -0.11
SH3BP1-205ENST00000466097 B3GALT1Q9Y5Z6 326 aa14.35□□□□□ -0.11
SH3BP1-205ENST00000466097 IQCF5A8MTL0 148 aa14.34□□□□□ -0.11
SH3BP1-205ENST00000466097 IQCJ-SCHIP1C9J366 451 aaPredicted RBP14.34□□□□□ -0.11
SH3BP1-205ENST00000466097 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP14.34□□□□□ -0.11
SH3BP1-205ENST00000466097 TTI1O43156 1089 aa14.34□□□□□ -0.11
SH3BP1-205ENST00000466097 KIF1CO43896 1103 aaKnown RBP14.34□□□□□ -0.11
SH3BP1-205ENST00000466097 TTC4O95801 387 aa14.34□□□□□ -0.11
SH3BP1-205ENST00000466097 ESR1P03372 595 aa14.34□□□□□ -0.11
SH3BP1-205ENST00000466097 SPTBP11277 2137 aa14.34□□□□□ -0.11
SH3BP1-205ENST00000466097 NELFEP18615 380 aaKnown RBP14.34□□□□□ -0.11
SH3BP1-205ENST00000466097 PGAM1P18669 254 aa14.34□□□□□ -0.11
SH3BP1-205ENST00000466097 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP14.34□□□□□ -0.11
SH3BP1-205ENST00000466097 IVDP26440 423 aa14.34□□□□□ -0.11
SH3BP1-205ENST00000466097 AOAHP28039 575 aa14.34□□□□□ -0.11
SH3BP1-205ENST00000466097 ATP1A2P50993 1020 aa14.34□□□□□ -0.11
SH3BP1-205ENST00000466097 ADARP55265 1226 aaKnown RBP14.34□□□□□ -0.11
SH3BP1-205ENST00000466097 PPP1CAP62136 330 aa14.34□□□□□ -0.11
SH3BP1-205ENST00000466097 FOXM1Q08050 763 aa14.34□□□□□ -0.11
SH3BP1-205ENST00000466097 PRKG2Q13237 762 aa14.34□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25 ms