RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462272.5

RARB-205, Transcript of retinoic acid receptor beta, humanhuman

TSL 3

Gene RARB, Length 1,258 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARB-205ENST00000462272 UGT1A7Q9HAW7 530 aa5.13□□□□□ -1.59
RARB-205ENST00000462272 UGT1A10Q9HAW8 530 aa5.13□□□□□ -1.59
RARB-205ENST00000462272 UGT1A8Q9HAW9 530 aa5.13□□□□□ -1.59
RARB-205ENST00000462272 IL26Q9NPH9 171 aa5.13□□□□□ -1.59
RARB-205ENST00000462272 POT1Q9NUX5 634 aa5.13□□□□□ -1.59
RARB-205ENST00000462272 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
RARB-205ENST00000462272 OGFRQ9NZT2 677 aa5.13□□□□□ -1.59
RARB-205ENST00000462272 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP5.13□□□□□ -1.59
RARB-205ENST00000462272 NFKBIL1Q9UBC1 381 aaPredicted RBP5.13□□□□□ -1.59
RARB-205ENST00000462272 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa5.13□□□□□ -1.59
RARB-205ENST00000462272 WDR37Q9Y2I8 494 aa5.13□□□□□ -1.59
RARB-205ENST00000462272 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP5.13□□□□□ -1.59
RARB-205ENST00000462272 PKP3Q9Y446 797 aa5.13□□□□□ -1.59
RARB-205ENST00000462272 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa5.13□□□□□ -1.59
RARB-205ENST00000462272 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa5.13□□□□□ -1.59
RARB-205ENST00000462272 ALG6Q9Y672 507 aa5.13□□□□□ -1.59
RARB-205ENST00000462272 ARL5AQ9Y689 179 aa5.13□□□□□ -1.59
RARB-205ENST00000462272 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
RARB-205ENST00000462272 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa5.13□□□□□ -1.59
RARB-205ENST00000462272 MN1Q10571 1320 aaPredicted RBP5.13□□□□□ -1.59
RARB-205ENST00000462272 ASXL3Q9C0F0 2248 aa5.13□□□□□ -1.59
RARB-205ENST00000462272 RP1P56715 2156 aa5.12□□□□□ -1.59
RARB-205ENST00000462272 GLYATL1P3A0A0U1RQE8 302 aa5.12□□□□□ -1.59
RARB-205ENST00000462272 LOC101059948A0A1B0GTJ6 334 aa5.12□□□□□ -1.59
RARB-205ENST00000462272 LOC285095A0A1B0GVY8 99 aa5.12□□□□□ -1.59
RARB-205ENST00000462272 OR5K4A6NMS3 321 aa5.12□□□□□ -1.59
RARB-205ENST00000462272 ZNF891A8MT65 544 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
RARB-205ENST00000462272 HACD1B0YJ81 288 aa5.12□□□□□ -1.59
RARB-205ENST00000462272 GPR89AB7ZAQ6 455 aa5.12□□□□□ -1.59
RARB-205ENST00000462272 GAPDHSO14556 408 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
RARB-205ENST00000462272 POLR1CO15160 346 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
RARB-205ENST00000462272 STX7O15400 261 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
RARB-205ENST00000462272 PJA2O43164 708 aa5.12□□□□□ -1.59
RARB-205ENST00000462272 KIF1CO43896 1103 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
RARB-205ENST00000462272 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP5.12□□□□□ -1.59
RARB-205ENST00000462272 PRAMEF1O95521 474 aa5.12□□□□□ -1.59
RARB-205ENST00000462272 AGTP01019 485 aa5.12□□□□□ -1.59
RARB-205ENST00000462272 PGRP06401 933 aa5.12□□□□□ -1.59
RARB-205ENST00000462272 GPR89BP0CG08 455 aa5.12□□□□□ -1.59
RARB-205ENST00000462272 VCLP18206 1134 aa5.12□□□□□ -1.59
RARB-205ENST00000462272 HLA-DPA1P20036 260 aa5.12□□□□□ -1.59
RARB-205ENST00000462272 MSH3P20585 1137 aa5.12□□□□□ -1.59
RARB-205ENST00000462272 PSMB4P28070 264 aa5.12□□□□□ -1.59
RARB-205ENST00000462272 RBL1P28749 1068 aa5.12□□□□□ -1.59
RARB-205ENST00000462272 CA5AP35218 305 aa5.12□□□□□ -1.59
RARB-205ENST00000462272 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
RARB-205ENST00000462272 HMGCLP35914 325 aa5.12□□□□□ -1.59
RARB-205ENST00000462272 HALP42357 657 aa5.12□□□□□ -1.59
RARB-205ENST00000462272 CAPZBP47756 277 aa5.12□□□□□ -1.59
RARB-205ENST00000462272 CLCNKAP51800 687 aa5.12□□□□□ -1.59
RARB-205ENST00000462272 CTSCP53634 463 aa5.12□□□□□ -1.59
RARB-205ENST00000462272 GEMP55040 296 aa5.12□□□□□ -1.59
RARB-205ENST00000462272 HADHBP55084 474 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
RARB-205ENST00000462272 TMPRSS15P98073 1019 aa5.12□□□□□ -1.59
RARB-205ENST00000462272 MC2RQ01718 297 aa5.12□□□□□ -1.59
RARB-205ENST00000462272 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
RARB-205ENST00000462272 CDC20Q12834 499 aa5.12□□□□□ -1.59
RARB-205ENST00000462272 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
RARB-205ENST00000462272 NFE2L1Q14494 772 aa5.12□□□□□ -1.59
RARB-205ENST00000462272 PLCL1Q15111 1095 aa5.12□□□□□ -1.59
RARB-205ENST00000462272 TCEAL1Q15170 157 aa5.12□□□□□ -1.59
RARB-205ENST00000462272 COLEC12Q5KU26 742 aa5.12□□□□□ -1.59
RARB-205ENST00000462272 FNBP1LQ5T0N5 605 aa5.12□□□□□ -1.59
RARB-205ENST00000462272 GPRC6AQ5T6X5 926 aa5.12□□□□□ -1.59
RARB-205ENST00000462272 ATP1A1-AS1Q5TC04 95 aa5.12□□□□□ -1.59
RARB-205ENST00000462272 AADACL2Q6P093 401 aa5.12□□□□□ -1.59
RARB-205ENST00000462272 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
RARB-205ENST00000462272 SARM1Q6SZW1 724 aa5.12□□□□□ -1.59
RARB-205ENST00000462272 CEACAM20Q6UY09 585 aa5.12□□□□□ -1.59
RARB-205ENST00000462272 FAM83HQ6ZRV2 1179 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
RARB-205ENST00000462272 MICALCLQ6ZW33 695 aa5.12□□□□□ -1.59
RARB-205ENST00000462272 TIPARPQ7Z3E1 657 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
RARB-205ENST00000462272 ARHGAP22Q7Z5H3 698 aa5.12□□□□□ -1.59
RARB-205ENST00000462272 C11orf96Q7Z7L8 435 aa5.12□□□□□ -1.59
RARB-205ENST00000462272 RASGRP3Q8IV61 690 aa5.12□□□□□ -1.59
RARB-205ENST00000462272 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
RARB-205ENST00000462272 RCOR2Q8IZ40 523 aa5.12□□□□□ -1.59
RARB-205ENST00000462272 NLGN4XQ8N0W4 816 aa5.12□□□□□ -1.59
RARB-205ENST00000462272 ACRBPQ8NEB7 543 aa5.12□□□□□ -1.59
RARB-205ENST00000462272 NLGN4YQ8NFZ3 816 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
RARB-205ENST00000462272 ACTL9Q8TC94 416 aa5.12□□□□□ -1.59
RARB-205ENST00000462272 STARD8Q92502 1023 aa5.12□□□□□ -1.59
RARB-205ENST00000462272 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa5.12□□□□□ -1.59
RARB-205ENST00000462272 TEFMQ96QE5 360 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
RARB-205ENST00000462272 VPS35Q96QK1 796 aa5.12□□□□□ -1.59
RARB-205ENST00000462272 OR6C1Q96RD1 312 aa5.12□□□□□ -1.59
RARB-205ENST00000462272 FCRL5Q96RD9 977 aa5.12□□□□□ -1.59
RARB-205ENST00000462272 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
RARB-205ENST00000462272 GORASP1Q9BQQ3 440 aa5.12□□□□□ -1.59
RARB-205ENST00000462272 SLC12A9Q9BXP2 914 aa5.12□□□□□ -1.59
RARB-205ENST00000462272 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa5.12□□□□□ -1.59
RARB-205ENST00000462272 B3GNT4Q9C0J1 378 aa5.12□□□□□ -1.59
RARB-205ENST00000462272 EPB41L1Q9H4G0 881 aa5.12□□□□□ -1.59
RARB-205ENST00000462272 TRABDQ9H4I3 376 aa5.12□□□□□ -1.59
RARB-205ENST00000462272 ZNF768Q9H5H4 540 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
RARB-205ENST00000462272 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
RARB-205ENST00000462272 IMP3Q9NV31 184 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
RARB-205ENST00000462272 SIDT1Q9NXL6 827 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
RARB-205ENST00000462272 IL17CQ9P0M4 197 aa5.12□□□□□ -1.59
RARB-205ENST00000462272 PDP2Q9P2J9 529 aa5.12□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.4 ms