RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461017.1

RABGEF1-206, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 3

Gene RABGEF1, Length 711 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-206ENST00000461017 RALBP11234 206 aa6.82□□□□□ -1.32
RABGEF1-206ENST00000461017 FOLR1P15328 257 aa6.82□□□□□ -1.32
RABGEF1-206ENST00000461017 VCLP18206 1134 aa6.82□□□□□ -1.32
RABGEF1-206ENST00000461017 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP6.82□□□□□ -1.32
RABGEF1-206ENST00000461017 AOAHP28039 575 aa6.82□□□□□ -1.32
RABGEF1-206ENST00000461017 PEBP1P30086 187 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
RABGEF1-206ENST00000461017 HALP42357 657 aa6.82□□□□□ -1.32
RABGEF1-206ENST00000461017 NSG1P42857 185 aa6.82□□□□□ -1.32
RABGEF1-206ENST00000461017 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP6.82□□□□□ -1.32
RABGEF1-206ENST00000461017 KPNA2P52292 529 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
RABGEF1-206ENST00000461017 PCBP4P57723 403 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
RABGEF1-206ENST00000461017 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP6.82□□□□□ -1.32
RABGEF1-206ENST00000461017 MC2RQ01718 297 aa6.82□□□□□ -1.32
RABGEF1-206ENST00000461017 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
RABGEF1-206ENST00000461017 EIF3IQ13347 325 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
RABGEF1-206ENST00000461017 PTK6Q13882 451 aa6.82□□□□□ -1.32
RABGEF1-206ENST00000461017 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
RABGEF1-206ENST00000461017 GRB7Q14451 532 aa6.82□□□□□ -1.32
RABGEF1-206ENST00000461017 KCNAB1Q14722 419 aa6.82□□□□□ -1.32
RABGEF1-206ENST00000461017 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP6.82□□□□□ -1.32
RABGEF1-206ENST00000461017 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
RABGEF1-206ENST00000461017 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP6.82□□□□□ -1.32
RABGEF1-206ENST00000461017 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
RABGEF1-206ENST00000461017 ANKS6Q68DC2 871 aa6.82□□□□□ -1.32
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF549Q6P9A3 640 aa6.82□□□□□ -1.32
RABGEF1-206ENST00000461017 PCSK4Q6UW60 755 aa6.82□□□□□ -1.32
RABGEF1-206ENST00000461017 TMEM135Q86UB9 458 aa6.82□□□□□ -1.32
RABGEF1-206ENST00000461017 VASH2Q86V25 355 aa6.82□□□□□ -1.32
RABGEF1-206ENST00000461017 DTX1Q86Y01 620 aa6.82□□□□□ -1.32
RABGEF1-206ENST00000461017 DENND6AQ8IWF6 608 aa6.82□□□□□ -1.32
RABGEF1-206ENST00000461017 FAM20CQ8IXL6 584 aa6.82□□□□□ -1.32
RABGEF1-206ENST00000461017 ADGRF3Q8IZF5 1079 aa6.82□□□□□ -1.32
RABGEF1-206ENST00000461017 LSMEM2Q8N112 164 aa6.82□□□□□ -1.32
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF248Q8NDW4 579 aa6.82□□□□□ -1.32
RABGEF1-206ENST00000461017 OR52E1Q8NGJ3 308 aa6.82□□□□□ -1.32
RABGEF1-206ENST00000461017 OR5AR1Q8NGP9 310 aa6.82□□□□□ -1.32
RABGEF1-206ENST00000461017 FLVCR1-AS1Q8TAF5 88 aa6.82□□□□□ -1.32
RABGEF1-206ENST00000461017 HEXDCQ8WVB3 486 aa6.82□□□□□ -1.32
RABGEF1-206ENST00000461017 KLHL6Q8WZ60 621 aa6.82□□□□□ -1.32
RABGEF1-206ENST00000461017 ELMO1Q92556 727 aa6.82□□□□□ -1.32
RABGEF1-206ENST00000461017 TFGQ92734 400 aaPredicted RBP6.82□□□□□ -1.32
RABGEF1-206ENST00000461017 SLCO2A1Q92959 643 aa6.82□□□□□ -1.32
RABGEF1-206ENST00000461017 PEX13Q92968 403 aa6.82□□□□□ -1.32
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP6.82□□□□□ -1.32
RABGEF1-206ENST00000461017 FAM136AQ96C01 138 aa6.82□□□□□ -1.32
RABGEF1-206ENST00000461017 TAAR9Q96RI9 348 aa6.82□□□□□ -1.32
RABGEF1-206ENST00000461017 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP6.82□□□□□ -1.32
RABGEF1-206ENST00000461017 MENTQ9BUN1 341 aa6.82□□□□□ -1.32
RABGEF1-206ENST00000461017 CARD6Q9BX69 1037 aa6.82□□□□□ -1.32
RABGEF1-206ENST00000461017 TWSG1Q9GZX9 223 aa6.82□□□□□ -1.32
RABGEF1-206ENST00000461017 STN1Q9H668 368 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
RABGEF1-206ENST00000461017 KIR3DX1Q9H7L2 352 aa6.82□□□□□ -1.32
RABGEF1-206ENST00000461017 AKIRIN1Q9H9L7 192 aaPredicted RBP6.82□□□□□ -1.32
RABGEF1-206ENST00000461017 THSD1Q9NS62 852 aa6.82□□□□□ -1.32
RABGEF1-206ENST00000461017 SLC39A1Q9NY26 324 aa6.82□□□□□ -1.32
RABGEF1-206ENST00000461017 EPHA6Q9UF33 1036 aa6.82□□□□□ -1.32
RABGEF1-206ENST00000461017 CIDEBQ9UHD4 219 aa6.82□□□□□ -1.32
RABGEF1-206ENST00000461017 SLC24A2Q9UI40 661 aa6.82□□□□□ -1.32
RABGEF1-206ENST00000461017 ACSL6Q9UKU0 697 aa6.82□□□□□ -1.32
RABGEF1-206ENST00000461017 PLAGL1Q9UM63 463 aa6.82□□□□□ -1.32
RABGEF1-206ENST00000461017 ICKQ9UPZ9 632 aa6.82□□□□□ -1.32
RABGEF1-206ENST00000461017 MED16Q9Y2X0 877 aa6.82□□□□□ -1.32
RABGEF1-206ENST00000461017 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa6.82□□□□□ -1.32
RABGEF1-206ENST00000461017 NFS1Q9Y697 457 aa6.82□□□□□ -1.32
RABGEF1-206ENST00000461017 SCN3AQ9NY46 2000 aa6.82□□□□□ -1.32
RABGEF1-206ENST00000461017 TNRC6AQ8NDV7 1962 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
RABGEF1-206ENST00000461017 CHD6Q8TD26 2715 aa6.82□□□□□ -1.32
RABGEF1-206ENST00000461017 CTAGE9A4FU28 777 aa6.81□□□□□ -1.32
RABGEF1-206ENST00000461017 OR5K3A6NET4 321 aa6.81□□□□□ -1.32
RABGEF1-206ENST00000461017 SDR42E2A6NKP2 422 aa6.81□□□□□ -1.32
RABGEF1-206ENST00000461017 BTN3A1O00481 513 aa6.81□□□□□ -1.32
RABGEF1-206ENST00000461017 PRMT5O14744 637 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
RABGEF1-206ENST00000461017 HCRTR1O43613 425 aa6.81□□□□□ -1.32
RABGEF1-206ENST00000461017 NIPSNAP2O75323 286 aa6.81□□□□□ -1.32
RABGEF1-206ENST00000461017 S1PR4O95977 384 aa6.81□□□□□ -1.32
RABGEF1-206ENST00000461017 GAS8O95995 478 aa6.81□□□□□ -1.32
RABGEF1-206ENST00000461017 CTSBP07858 339 aa6.81□□□□□ -1.32
RABGEF1-206ENST00000461017 SLC35G4P0C7Q5 338 aa6.81□□□□□ -1.32
RABGEF1-206ENST00000461017 OR56A5P0C7T3 313 aa6.81□□□□□ -1.32
RABGEF1-206ENST00000461017 MLNP12872 115 aa6.81□□□□□ -1.32
RABGEF1-206ENST00000461017 PVRP15151 417 aa6.81□□□□□ -1.32
RABGEF1-206ENST00000461017 F8A1P23610 371 aa6.81□□□□□ -1.32
RABGEF1-206ENST00000461017 GABRB3P28472 473 aa6.81□□□□□ -1.32
RABGEF1-206ENST00000461017 FMO4P31512 558 aa6.81□□□□□ -1.32
RABGEF1-206ENST00000461017 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP6.81□□□□□ -1.32
RABGEF1-206ENST00000461017 ABCG1P45844 678 aa6.81□□□□□ -1.32
RABGEF1-206ENST00000461017 CAPZBP47756 277 aa6.81□□□□□ -1.32
RABGEF1-206ENST00000461017 PGGT1BP53609 377 aa6.81□□□□□ -1.32
RABGEF1-206ENST00000461017 MPP1Q00013 466 aa6.81□□□□□ -1.32
RABGEF1-206ENST00000461017 ABRQ12979 859 aa6.81□□□□□ -1.32
RABGEF1-206ENST00000461017 CTBP1Q13363 440 aa6.81□□□□□ -1.32
RABGEF1-206ENST00000461017 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
RABGEF1-206ENST00000461017 GBX1Q14549 363 aa6.81□□□□□ -1.32
RABGEF1-206ENST00000461017 TRADDQ15628 312 aa6.81□□□□□ -1.32
RABGEF1-206ENST00000461017 TYSND1Q2T9J0 566 aa6.81□□□□□ -1.32
RABGEF1-206ENST00000461017 CCSMST1Q4G0I0 132 aa6.81□□□□□ -1.32
RABGEF1-206ENST00000461017 PRAMEF17Q5VTA0 474 aa6.81□□□□□ -1.32
RABGEF1-206ENST00000461017 CACHD1Q5VU97 1274 aa6.81□□□□□ -1.32
RABGEF1-206ENST00000461017 LYPLAL1Q5VWZ2 237 aa6.81□□□□□ -1.32
RABGEF1-206ENST00000461017 IZUMO3Q5VZ72 239 aa6.81□□□□□ -1.32
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