RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000449058.6

TOM1-210, Transcript of target of myb1 membrane trafficking protein, human

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene TOM1, Length 2,389 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TOM1-210	ENST00000449058	CHRNA6	Q15825	494 aa		16.61	■□□□□ 0.25
TOM1-210	ENST00000449058	GPR33	Q49SQ1	333 aa		16.61	■□□□□ 0.25
TOM1-210	ENST00000449058	CBARP	Q8N350	705 aa	Predicted RBP	16.61	■□□□□ 0.25
TOM1-210	ENST00000449058	ITFG1	Q8TB96	612 aa		16.61	■□□□□ 0.25
TOM1-210	ENST00000449058	GTF2H4	Q92759	462 aa		16.61	■□□□□ 0.25
TOM1-210	ENST00000449058	ZBTB18	Q99592	522 aa		16.61	■□□□□ 0.25
TOM1-210	ENST00000449058	NPL	Q9BXD5	320 aa	Predicted RBP	16.61	■□□□□ 0.25
TOM1-210	ENST00000449058	TLR9	Q9NR96	1032 aa		16.61	■□□□□ 0.25
TOM1-210	ENST00000449058	FARSB	Q9NSD9	589 aa	Known RBP	16.61	■□□□□ 0.25
TOM1-210	ENST00000449058	ANGPTL3	Q9Y5C1	460 aa		16.61	■□□□□ 0.25
TOM1-210	ENST00000449058	PCDHGA11	Q9Y5H2	935 aa		16.61	■□□□□ 0.25
TOM1-210	ENST00000449058	PLXNB3	Q9ULL4	1909 aa		16.61	■□□□□ 0.25
TOM1-210	ENST00000449058		K7EPI3	171 aa		16.6	■□□□□ 0.25
TOM1-210	ENST00000449058	FFAR3	O14843	346 aa		16.6	■□□□□ 0.25
TOM1-210	ENST00000449058	GPR42	O15529	346 aa		16.6	■□□□□ 0.25
TOM1-210	ENST00000449058	DEAF1	O75398	565 aa	Predicted RBP	16.6	■□□□□ 0.25
TOM1-210	ENST00000449058	GK	P32189	559 aa		16.6	■□□□□ 0.25
TOM1-210	ENST00000449058	MAPK8	P45983	427 aa		16.6	■□□□□ 0.25
TOM1-210	ENST00000449058	PLA2G4E	Q3MJ16	856 aa		16.6	■□□□□ 0.25
TOM1-210	ENST00000449058	ARL14EP	Q8N8R7	260 aa	Predicted RBP	16.6	■□□□□ 0.25
TOM1-210	ENST00000449058	GLB1L3	Q8NCI6	653 aa	Predicted RBP	16.6	■□□□□ 0.25
TOM1-210	ENST00000449058	LIN28A	Q9H9Z2	209 aa	Known RBP	16.6	■□□□□ 0.25
TOM1-210	ENST00000449058	ZNF334	Q9HCZ1	680 aa	Predicted RBP	16.6	■□□□□ 0.25
TOM1-210	ENST00000449058	LATS2	Q9NRM7	1088 aa		16.6	■□□□□ 0.25
TOM1-210	ENST00000449058	CRLS1	Q9UJA2	301 aa		16.6	■□□□□ 0.25
TOM1-210	ENST00000449058	AGAP14	A8MT82	685 aa		16.6	■□□□□ 0.25
TOM1-210	ENST00000449058	EBLN1	P0CF75	366 aa		16.6	■□□□□ 0.25
TOM1-210	ENST00000449058	AKT1	P31749	480 aa		16.6	■□□□□ 0.25
TOM1-210	ENST00000449058	PIK3CG	P48736	1102 aa		16.6	■□□□□ 0.25
TOM1-210	ENST00000449058	NOG	Q13253	232 aa		16.6	■□□□□ 0.25
TOM1-210	ENST00000449058	FAM98B	Q52LJ0	330 aa	Known RBP	16.6	■□□□□ 0.25
TOM1-210	ENST00000449058	LIN28B	Q6ZN17	250 aa	Known RBP eCLIP	16.6	■□□□□ 0.25
TOM1-210	ENST00000449058	NXPE1	Q8N323	547 aa		16.6	■□□□□ 0.25
TOM1-210	ENST00000449058	ZNF548	Q8NEK5	533 aa	Predicted RBP	16.6	■□□□□ 0.25
TOM1-210	ENST00000449058	GAB3	Q8WWW8	586 aa		16.6	■□□□□ 0.25
TOM1-210	ENST00000449058	BHMT	Q93088	406 aa		16.6	■□□□□ 0.25
TOM1-210	ENST00000449058	ACD	Q96AP0	544 aa		16.6	■□□□□ 0.25
TOM1-210	ENST00000449058	SOX17	Q9H6I2	414 aa	Predicted RBP	16.6	■□□□□ 0.25
TOM1-210	ENST00000449058	KL	Q9UEF7	1012 aa		16.6	■□□□□ 0.25
TOM1-210	ENST00000449058	CPQ	Q9Y646	472 aa		16.6	■□□□□ 0.25
TOM1-210	ENST00000449058	MANBA	O00462	879 aa		16.59	■□□□□ 0.25
TOM1-210	ENST00000449058	PRRG1	O14668	218 aa		16.59	■□□□□ 0.25
TOM1-210	ENST00000449058	ULK1	O75385	1050 aa		16.59	■□□□□ 0.25
TOM1-210	ENST00000449058	ZNF821	O75541	412 aa	Predicted RBP	16.59	■□□□□ 0.25
TOM1-210	ENST00000449058	SPAM1	P38567	509 aa		16.59	■□□□□ 0.25
TOM1-210	ENST00000449058	GNPDA1	P46926	289 aa		16.59	■□□□□ 0.25
TOM1-210	ENST00000449058	ARSF	P54793	590 aa		16.59	■□□□□ 0.25
TOM1-210	ENST00000449058	HPCA	P84074	193 aa		16.59	■□□□□ 0.25
TOM1-210	ENST00000449058	CTBS	Q01459	385 aa		16.59	■□□□□ 0.25
TOM1-210	ENST00000449058	RAB33A	Q14088	237 aa		16.59	■□□□□ 0.25
TOM1-210	ENST00000449058	FAM174B	Q3ZCQ3	159 aa		16.59	■□□□□ 0.25
TOM1-210	ENST00000449058	GRAMD4	Q6IC98	578 aa		16.59	■□□□□ 0.25
TOM1-210	ENST00000449058	TMEM214	Q6NUQ4	689 aa	Known RBP	16.59	■□□□□ 0.25
TOM1-210	ENST00000449058	MSRB3	Q8IXL7	192 aa		16.59	■□□□□ 0.25
TOM1-210	ENST00000449058	OR2T12	Q8NG77	320 aa		16.59	■□□□□ 0.25
TOM1-210	ENST00000449058	USP7	Q93009	1102 aa		16.59	■□□□□ 0.25
TOM1-210	ENST00000449058	ISOC1	Q96CN7	298 aa		16.59	■□□□□ 0.25
TOM1-210	ENST00000449058	IL21	Q9HBE4	155 aa		16.59	■□□□□ 0.25
TOM1-210	ENST00000449058	ZNF490	Q9ULM2	529 aa	Predicted RBP	16.59	■□□□□ 0.25
TOM1-210	ENST00000449058	IL6	P05231	212 aa		16.59	■□□□□ 0.25
TOM1-210	ENST00000449058	ALDH3A2	P51648	485 aa		16.59	■□□□□ 0.25
TOM1-210	ENST00000449058	PLIN5	Q00G26	463 aa		16.59	■□□□□ 0.25
TOM1-210	ENST00000449058	HMGCS1	Q01581	520 aa		16.59	■□□□□ 0.25
TOM1-210	ENST00000449058	CHRNB3	Q05901	458 aa		16.59	■□□□□ 0.25
TOM1-210	ENST00000449058	DAG1	Q14118	895 aa		16.59	■□□□□ 0.25
TOM1-210	ENST00000449058	TXNDC8	Q6A555	127 aa		16.59	■□□□□ 0.25
TOM1-210	ENST00000449058	TPGS1	Q6ZTW0	290 aa		16.59	■□□□□ 0.25
TOM1-210	ENST00000449058	ZSWIM9	Q86XI8	627 aa		16.59	■□□□□ 0.25
TOM1-210	ENST00000449058	CLVS1	Q8IUQ0	354 aa	Predicted RBP	16.59	■□□□□ 0.25
TOM1-210	ENST00000449058	LIX1	Q8N485	282 aa		16.59	■□□□□ 0.25
TOM1-210	ENST00000449058	TMBIM1	Q969X1	311 aa		16.59	■□□□□ 0.25
TOM1-210	ENST00000449058	DPY30	Q9C005	99 aa		16.59	■□□□□ 0.25
TOM1-210	ENST00000449058	CLMP	Q9H6B4	373 aa		16.59	■□□□□ 0.25
TOM1-210	ENST00000449058	ATP13A3	Q9H7F0	1226 aa		16.59	■□□□□ 0.25
TOM1-210	ENST00000449058	CARS2	Q9HA77	564 aa	Known RBP	16.59	■□□□□ 0.25
TOM1-210	ENST00000449058	LOC730098	B7Z3J9	87 aa		16.58	■□□□□ 0.25
TOM1-210	ENST00000449058	ALPL	P05186	524 aa		16.58	■□□□□ 0.25
TOM1-210	ENST00000449058	EPB42	P16452	691 aa		16.58	■□□□□ 0.25
TOM1-210	ENST00000449058	NFKBIA	P25963	317 aa		16.58	■□□□□ 0.25
TOM1-210	ENST00000449058	EPHB3	P54753	998 aa		16.58	■□□□□ 0.25
TOM1-210	ENST00000449058	CYP4F3	Q08477	520 aa		16.58	■□□□□ 0.25
TOM1-210	ENST00000449058	MAPKAPK3	Q16644	382 aa		16.58	■□□□□ 0.25
TOM1-210	ENST00000449058	CCNYL2	Q5T2Q4	361 aa		16.58	■□□□□ 0.25
TOM1-210	ENST00000449058	CACHD1	Q5VU97	1274 aa		16.58	■□□□□ 0.25
TOM1-210	ENST00000449058	DHRS4L2	Q6PKH6	230 aa		16.58	■□□□□ 0.25
TOM1-210	ENST00000449058	GPR180	Q86V85	440 aa		16.58	■□□□□ 0.25
TOM1-210	ENST00000449058	TCEAL8	Q8IYN2	117 aa		16.58	■□□□□ 0.25
TOM1-210	ENST00000449058	RGL4	Q8IZJ4	473 aa		16.58	■□□□□ 0.25
TOM1-210	ENST00000449058	VOPP1	Q96AW1	172 aa		16.58	■□□□□ 0.25
TOM1-210	ENST00000449058	LYSMD1	Q96S90	227 aa		16.58	■□□□□ 0.25
TOM1-210	ENST00000449058	SLC29A3	Q9BZD2	475 aa		16.58	■□□□□ 0.25
TOM1-210	ENST00000449058	IKZF5	Q9H5V7	419 aa		16.58	■□□□□ 0.25
TOM1-210	ENST00000449058	LRTM1	Q9HBL6	345 aa		16.58	■□□□□ 0.25
TOM1-210	ENST00000449058	SLC25A37	Q9NYZ2	338 aa		16.58	■□□□□ 0.25
TOM1-210	ENST00000449058	PKD2L2	Q9NZM6	624 aa		16.58	■□□□□ 0.25
TOM1-210	ENST00000449058	EBF1	Q9UH73	591 aa		16.58	■□□□□ 0.25
TOM1-210	ENST00000449058	INSL5	Q9Y5Q6	135 aa		16.58	■□□□□ 0.25
TOM1-210	ENST00000449058	DENND4C	Q5VZ89	1909 aa		16.58	■□□□□ 0.24
TOM1-210	ENST00000449058	GMNN	O75496	209 aa		16.58	■□□□□ 0.24
TOM1-210	ENST00000449058	ALB	P02768	609 aa		16.58	■□□□□ 0.24

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