RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000444916.5

SH3BP4-205, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 4

Gene SH3BP4, Length 570 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-205ENST00000444916 CPT1BQ92523 772 aa13.78□□□□□ -0.2
SH3BP4-205ENST00000444916 ELMO1Q92556 727 aa13.78□□□□□ -0.2
SH3BP4-205ENST00000444916 MED8Q96G25 268 aa13.78□□□□□ -0.2
SH3BP4-205ENST00000444916 CCNL2Q96S94 520 aaPredicted RBP13.78□□□□□ -0.2
SH3BP4-205ENST00000444916 CD180Q99467 661 aa13.78□□□□□ -0.2
SH3BP4-205ENST00000444916 ZPBPQ9BS86 351 aa13.78□□□□□ -0.2
SH3BP4-205ENST00000444916 WDR70Q9NW82 654 aa13.78□□□□□ -0.2
SH3BP4-205ENST00000444916 SEMA5BQ9P283 1151 aa13.78□□□□□ -0.2
SH3BP4-205ENST00000444916 MARCH4Q9P2E8 410 aaPredicted RBP13.78□□□□□ -0.2
SH3BP4-205ENST00000444916 ANAPC5Q9UJX4 755 aa13.78□□□□□ -0.2
SH3BP4-205ENST00000444916 PYCARDQ9ULZ3 195 aa13.78□□□□□ -0.2
SH3BP4-205ENST00000444916 SOX13Q9UN79 622 aa13.78□□□□□ -0.2
SH3BP4-205ENST00000444916 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP13.78□□□□□ -0.2
SH3BP4-205ENST00000444916 CD3EAPO15446 510 aaKnown RBP13.77□□□□□ -0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 AVILO75366 819 aa13.77□□□□□ -0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 MLNP12872 115 aa13.77□□□□□ -0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 SEPHS1P49903 392 aa13.77□□□□□ -0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 GNG11P61952 73 aa13.77□□□□□ -0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 PLOD1Q02809 727 aaPredicted RBP13.77□□□□□ -0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP13.77□□□□□ -0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 SYTL3Q4VX76 610 aa13.77□□□□□ -0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP13.77□□□□□ -0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 CCDC81Q6ZN84 652 aa13.77□□□□□ -0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP13.77□□□□□ -0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 CAND1Q86VP6 1230 aaKnown RBP13.77□□□□□ -0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 MCUQ8NE86 351 aa13.77□□□□□ -0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 UBXN4Q92575 508 aa13.77□□□□□ -0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 MFSD3Q96ES6 412 aa13.77□□□□□ -0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 FERD3LQ96RJ6 166 aa13.77□□□□□ -0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 CTRCQ99895 268 aa13.77□□□□□ -0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 TSSK1BQ9BXA7 367 aa13.77□□□□□ -0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 TRIM4Q9C037 500 aa13.77□□□□□ -0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 MVB12BQ9H7P6 319 aa13.77□□□□□ -0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP13.77□□□□□ -0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 APMAPQ9HDC9 416 aa13.77□□□□□ -0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 HRASLS2Q9NWW9 162 aa13.77□□□□□ -0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 SLC5A10A0PJK1 596 aa13.76□□□□□ -0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 OR6C74A6NCV1 312 aa13.76□□□□□ -0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 TLCD2A6NGC4 264 aa13.76□□□□□ -0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 K7ENP7 123 aa13.76□□□□□ -0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 PRMT5O14744 637 aaPredicted RBP13.76□□□□□ -0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 POLR1CO15160 346 aaPredicted RBP13.76□□□□□ -0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 NELFEP18615 380 aaKnown RBP13.76□□□□□ -0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 ARNTP27540 789 aa13.76□□□□□ -0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 MANEAQ5SRI9 462 aa13.76□□□□□ -0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP13.76□□□□□ -0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP13.76□□□□□ -0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 ARMC6Q6NXE6 501 aa13.76□□□□□ -0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 CASC4Q6P4E1 433 aa13.76□□□□□ -0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 INO80CQ6PI98 192 aaPredicted RBP13.76□□□□□ -0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 CES3Q6UWW8 571 aa13.76□□□□□ -0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa13.76□□□□□ -0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 PHC3Q8NDX5 983 aa13.76□□□□□ -0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 LCN9Q8WX39 176 aa13.76□□□□□ -0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 TFGQ92734 400 aaPredicted RBP13.76□□□□□ -0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 SLC41A2Q96JW4 573 aa13.76□□□□□ -0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 SERPINB12Q96P63 405 aa13.76□□□□□ -0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP13.76□□□□□ -0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 SAMD15Q9P1V8 674 aa13.76□□□□□ -0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 IGHV5-51A0A0C4DH38 117 aa13.75□□□□□ -0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 MATN2O00339 956 aa13.75□□□□□ -0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 VAPBO95292 243 aa13.75□□□□□ -0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 ACADLP28330 430 aa13.75□□□□□ -0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 ATP1A2P50993 1020 aa13.75□□□□□ -0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 SH3BP2P78314 561 aa13.75□□□□□ -0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 FOXM1Q08050 763 aa13.75□□□□□ -0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 PRKAA1Q13131 559 aa13.75□□□□□ -0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 SRSF6Q13247 344 aaKnown RBP13.75□□□□□ -0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 IL11RAQ14626 422 aa13.75□□□□□ -0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 BRD3Q15059 726 aa13.75□□□□□ -0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 PPP1R7Q15435 360 aa13.75□□□□□ -0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 MRNIPQ6NTE8 343 aa13.75□□□□□ -0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 CYB5D1Q6P9G0 228 aa13.75□□□□□ -0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 NAPRTQ6XQN6 538 aa13.75□□□□□ -0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 VASH2Q86V25 355 aa13.75□□□□□ -0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 LRRC6Q86X45 466 aa13.75□□□□□ -0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 KMT5CQ86Y97 462 aa13.75□□□□□ -0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 CARFQ8N187 725 aa13.75□□□□□ -0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 OTUD6BQ8N6M0 293 aa13.75□□□□□ -0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 NAT8LQ8N9F0 302 aa13.75□□□□□ -0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 OR4E2Q8NGC2 313 aa13.75□□□□□ -0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 LKAAEAR1Q8TD35 194 aa13.75□□□□□ -0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 SLCO2A1Q92959 643 aa13.75□□□□□ -0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 NKD1Q969G9 470 aa13.75□□□□□ -0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP13.75□□□□□ -0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 MAP3K3Q99759 626 aa13.75□□□□□ -0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 HGH1Q9BTY7 390 aa13.75□□□□□ -0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 CARD6Q9BX69 1037 aa13.75□□□□□ -0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 SPRY4Q9C004 299 aa13.75□□□□□ -0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 SRMSQ9H3Y6 488 aa13.75□□□□□ -0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 TFB2MQ9H5Q4 396 aaKnown RBP13.75□□□□□ -0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 GNPTGQ9UJJ9 305 aa13.75□□□□□ -0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 PILRAQ9UKJ1 303 aa13.75□□□□□ -0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 TMEM184BQ9Y519 407 aaPredicted RBP13.75□□□□□ -0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 FLNCQ14315 2725 aa13.75□□□□□ -0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa13.74□□□□□ -0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP13.74□□□□□ -0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 MAGEB16A2A368 324 aa13.74□□□□□ -0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 SDR42E2A6NKP2 422 aa13.74□□□□□ -0.21
SH3BP4-205ENST00000444916 IQCF5A8MTL0 148 aa13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.7 ms