RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000435535.1

RPS3AP54-201, Transcript of ribosomal protein S3a pseudogene 54, humanhuman

BASIC

Gene RPS3AP54, Length 734 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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RPS3AP54-201ENST00000435535 PPP1R9BQ96SB3 815 aa4.48□□□□□ -1.69
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RPS3AP54-201ENST00000435535 DCAF4L2Q8NA75 395 aa4.47□□□□□ -1.69
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