RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428075.5

TRIOBP-209, Transcript of TRIO and F-actin binding protein, humanhuman

TSL 2

Gene TRIOBP, Length 931 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIOBP-209ENST00000428075 CREG1O75629 220 aa27.12■■□□□ 1.93
TRIOBP-209ENST00000428075 SUN1O94901 812 aa27.12■■□□□ 1.93
TRIOBP-209ENST00000428075 MSNP26038 577 aaKnown RBP27.12■■□□□ 1.93
TRIOBP-209ENST00000428075 STIP1P31948 543 aaKnown RBP27.12■■□□□ 1.93
TRIOBP-209ENST00000428075 ARL4DP49703 201 aa27.12■■□□□ 1.93
TRIOBP-209ENST00000428075 RPA4Q13156 261 aa27.12■■□□□ 1.93
TRIOBP-209ENST00000428075 LAMB3Q13751 1172 aa27.12■■□□□ 1.93
TRIOBP-209ENST00000428075 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP27.12■■□□□ 1.93
TRIOBP-209ENST00000428075 PRAMEF17Q5VTA0 474 aa27.12■■□□□ 1.93
TRIOBP-209ENST00000428075 LINC00523Q86TU6 105 aa27.12■■□□□ 1.93
TRIOBP-209ENST00000428075 OR52E1Q8NGJ3 308 aa27.12■■□□□ 1.93
TRIOBP-209ENST00000428075 C1orf54Q8WWF1 131 aa27.12■■□□□ 1.93
TRIOBP-209ENST00000428075 ABHD17AQ96GS6 310 aa27.12■■□□□ 1.93
TRIOBP-209ENST00000428075 SRMSQ9H3Y6 488 aa27.12■■□□□ 1.93
TRIOBP-209ENST00000428075 TFB2MQ9H5Q4 396 aaKnown RBP27.12■■□□□ 1.93
TRIOBP-209ENST00000428075 ZNF71Q9NQZ8 489 aaPredicted RBP27.12■■□□□ 1.93
TRIOBP-209ENST00000428075 KCND3Q9UK17 655 aa27.12■■□□□ 1.93
TRIOBP-209ENST00000428075 GUCA1BQ9UMX6 200 aa27.12■■□□□ 1.93
TRIOBP-209ENST00000428075 AP2A2O94973 939 aa27.11■■□□□ 1.93
TRIOBP-209ENST00000428075 KCNC4Q03721 635 aa27.11■■□□□ 1.93
TRIOBP-209ENST00000428075 C9orf43Q8TAL5 461 aaPredicted RBP27.11■■□□□ 1.93
TRIOBP-209ENST00000428075 ZNF778Q96MU6 729 aa27.11■■□□□ 1.93
TRIOBP-209ENST00000428075 TLR10Q9BXR5 811 aa27.11■■□□□ 1.93
TRIOBP-209ENST00000428075 CLMPQ9H6B4 373 aa27.11■■□□□ 1.93
TRIOBP-209ENST00000428075 XKR8Q9H6D3 395 aa27.11■■□□□ 1.93
TRIOBP-209ENST00000428075 MVB12BQ9H7P6 319 aa27.11■■□□□ 1.93
TRIOBP-209ENST00000428075 C1GALT1Q9NS00 363 aa27.11■■□□□ 1.93
TRIOBP-209ENST00000428075 KCND1Q9NSA2 647 aa27.11■■□□□ 1.93
TRIOBP-209ENST00000428075 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa27.11■■□□□ 1.93
TRIOBP-209ENST00000428075 ERI2A8K979 691 aaKnown RBP27.1■■□□□ 1.93
TRIOBP-209ENST00000428075 PRDX3P30048 256 aaKnown RBP27.1■■□□□ 1.93
TRIOBP-209ENST00000428075 CDH17Q12864 832 aa27.1■■□□□ 1.93
TRIOBP-209ENST00000428075 GPS2Q13227 327 aa27.1■■□□□ 1.93
TRIOBP-209ENST00000428075 PRKG2Q13237 762 aa27.1■■□□□ 1.93
TRIOBP-209ENST00000428075 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP27.1■■□□□ 1.93
TRIOBP-209ENST00000428075 SKIDA1Q1XH10 827 aa27.1■■□□□ 1.93
TRIOBP-209ENST00000428075 PACS1Q6VY07 963 aa27.1■■□□□ 1.93
TRIOBP-209ENST00000428075 NAPRTQ6XQN6 538 aa27.1■■□□□ 1.93
TRIOBP-209ENST00000428075 ZNF517Q6ZMY9 492 aaPredicted RBP27.1■■□□□ 1.93
TRIOBP-209ENST00000428075 ADGRF3Q8IZF5 1079 aa27.1■■□□□ 1.93
TRIOBP-209ENST00000428075 TFGQ92734 400 aaPredicted RBP27.1■■□□□ 1.93
TRIOBP-209ENST00000428075 HGH1Q9BTY7 390 aa27.1■■□□□ 1.93
TRIOBP-209ENST00000428075 PITPNM3Q9BZ71 974 aa27.1■■□□□ 1.93
TRIOBP-209ENST00000428075 ACTL8Q9H568 366 aa27.1■■□□□ 1.93
TRIOBP-209ENST00000428075 VPS37BQ9H9H4 285 aa27.1■■□□□ 1.93
TRIOBP-209ENST00000428075 C21orf140B9A014 251 aa27.09■■□□□ 1.93
TRIOBP-209ENST00000428075 K7EM74 188 aa27.09■■□□□ 1.93
TRIOBP-209ENST00000428075 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP27.09■■□□□ 1.93
TRIOBP-209ENST00000428075 SCRG1O75711 98 aa27.09■■□□□ 1.93
TRIOBP-209ENST00000428075 RECKO95980 971 aa27.09■■□□□ 1.93
TRIOBP-209ENST00000428075 IFNB1P01574 187 aa27.09■■□□□ 1.93
TRIOBP-209ENST00000428075 TPBGLP0DKB5 382 aa27.09■■□□□ 1.93
TRIOBP-209ENST00000428075 ST6GAL1P15907 406 aa27.09■■□□□ 1.93
TRIOBP-209ENST00000428075 CDH3P22223 829 aa27.09■■□□□ 1.93
TRIOBP-209ENST00000428075 ACADLP28330 430 aa27.09■■□□□ 1.93
TRIOBP-209ENST00000428075 NSG1P42857 185 aa27.09■■□□□ 1.93
TRIOBP-209ENST00000428075 CSRP3P50461 194 aa27.09■■□□□ 1.93
TRIOBP-209ENST00000428075 RPS18P62269 152 aaKnown RBP27.09■■□□□ 1.93
TRIOBP-209ENST00000428075 ABRQ12979 859 aa27.09■■□□□ 1.93
TRIOBP-209ENST00000428075 PRKAA1Q13131 559 aa27.09■■□□□ 1.93
TRIOBP-209ENST00000428075 SNX1Q13596 522 aa27.09■■□□□ 1.93
TRIOBP-209ENST00000428075 ITIH4Q14624 930 aa27.09■■□□□ 1.93
TRIOBP-209ENST00000428075 ZNF789Q5FWF6 425 aa27.09■■□□□ 1.93
TRIOBP-209ENST00000428075 SEL1L2Q5TEA6 688 aa27.09■■□□□ 1.93
TRIOBP-209ENST00000428075 LCN10Q6JVE6 187 aa27.09■■□□□ 1.93
TRIOBP-209ENST00000428075 HDAC10Q969S8 669 aa27.09■■□□□ 1.93
TRIOBP-209ENST00000428075 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP27.09■■□□□ 1.93
TRIOBP-209ENST00000428075 CASS4Q9NQ75 786 aa27.09■■□□□ 1.93
TRIOBP-209ENST00000428075 LATS2Q9NRM7 1088 aa27.09■■□□□ 1.93
TRIOBP-209ENST00000428075 SOHLH2Q9NX45 425 aa27.09■■□□□ 1.93
TRIOBP-209ENST00000428075 PIPSLA2A3N6 862 aa27.08■■□□□ 1.93
TRIOBP-209ENST00000428075 GSAPA4D1B5 854 aa27.08■■□□□ 1.93
TRIOBP-209ENST00000428075 CDC14CA4D256 554 aa27.08■■□□□ 1.93
TRIOBP-209ENST00000428075 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP27.08■■□□□ 1.93
TRIOBP-209ENST00000428075 OR1I1O60431 355 aa27.08■■□□□ 1.93
TRIOBP-209ENST00000428075 GSTM1P09488 218 aa27.08■■□□□ 1.93
TRIOBP-209ENST00000428075 FDFT1P37268 417 aa27.08■■□□□ 1.93
TRIOBP-209ENST00000428075 GSTM4Q03013 218 aa27.08■■□□□ 1.93
TRIOBP-209ENST00000428075 ACVR1Q04771 509 aa27.08■■□□□ 1.93
TRIOBP-209ENST00000428075 SEMA5AQ13591 1074 aa27.08■■□□□ 1.93
TRIOBP-209ENST00000428075 TSTD2Q5T7W7 516 aa27.08■■□□□ 1.93
TRIOBP-209ENST00000428075 MEI1Q5TIA1 1274 aa27.08■■□□□ 1.93
TRIOBP-209ENST00000428075 ZNF534Q76KX8 674 aa27.08■■□□□ 1.93
TRIOBP-209ENST00000428075 TMEM126BQ8IUX1 230 aa27.08■■□□□ 1.93
TRIOBP-209ENST00000428075 DNAAF3Q8N9W5 541 aa27.08■■□□□ 1.93
TRIOBP-209ENST00000428075 OR5AR1Q8NGP9 310 aa27.08■■□□□ 1.93
TRIOBP-209ENST00000428075 OR8K5Q8NH50 307 aa27.08■■□□□ 1.93
TRIOBP-209ENST00000428075 RANBP9Q96S59 729 aa27.08■■□□□ 1.93
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TRIOBP-209ENST00000428075 TWSG1Q9GZX9 223 aa27.08■■□□□ 1.93
TRIOBP-209ENST00000428075 ICKQ9UPZ9 632 aa27.08■■□□□ 1.93
TRIOBP-209ENST00000428075 ZNF148Q9UQR1 794 aa27.08■■□□□ 1.93
TRIOBP-209ENST00000428075 POLHQ9Y253 713 aa27.08■■□□□ 1.93
TRIOBP-209ENST00000428075 SLC5A10A0PJK1 596 aa27.07■■□□□ 1.92
TRIOBP-209ENST00000428075 MATN2O00339 956 aa27.07■■□□□ 1.92
TRIOBP-209ENST00000428075 CPNE3O75131 537 aaKnown RBP27.07■■□□□ 1.92
TRIOBP-209ENST00000428075 GOT2P00505 430 aaKnown RBP27.07■■□□□ 1.92
TRIOBP-209ENST00000428075 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa27.07■■□□□ 1.92
TRIOBP-209ENST00000428075 PVRP15151 417 aa27.07■■□□□ 1.92
TRIOBP-209ENST00000428075 TLE1Q04724 770 aa27.07■■□□□ 1.92
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