RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420234.5

PUM2-205, Transcript of pumilio RNA binding family member 2, human

TSL 5

Gene PUM2, Length 562 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PUM2-205	ENST00000420234	CCDC91	Q7Z6B0	441 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	CROCCP2	Q86T23	111 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	THNSL2	Q86YJ6	484 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	GALNT13	Q8IUC8	556 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	SFTPA1	Q8IWL2	248 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	KLHDC8B	Q8IXV7	354 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	MAML2	Q8IZL2	1156 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	ZCCHC9	Q8N567	271 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	TEX19	Q8NA77	164 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	MYRIP	Q8NFW9	859 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	OR56A4	Q8NGH8	313 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	SPATA22	Q8NHS9	363 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	WDR48	Q8TAF3	677 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	MAGEC3	Q8TD91	643 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	PYROXD1	Q8WU10	500 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	SH3KBP1	Q96B97	665 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	STAMBPL1	Q96FJ0	436 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	C1orf159	Q96HA4	380 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	FOPNL	Q96NB1	174 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	FMO2	Q99518	471 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	COPS8	Q99627	209 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	FAM118B	Q9BPY3	351 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	CCM2	Q9BSQ5	444 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	GSDMC	Q9BYG8	508 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	LDHAL6B	Q9BYZ2	381 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	MTG2	Q9H4K7	406 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	C6orf106	Q9H6K1	298 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	ASB8	Q9H765	288 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	PPCS	Q9HAB8	311 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	TRIM39	Q9HCM9	518 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	CD248	Q9HCU0	757 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	PPAN	Q9NQ55	473 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	INTS10	Q9NVR2	710 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	NLE1	Q9NVX2	485 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	ARGLU1	Q9NWB6	273 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	SMOX	Q9NWM0	555 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	UTP6	Q9NYH9	597 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	ZIM2	Q9NZV7	527 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	KL	Q9UEF7	1012 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	MOSPD1	Q9UJG1	213 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	GNPTG	Q9UJJ9	305 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	CORO1C	Q9ULV4	474 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	GPR34	Q9UPC5	381 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	ANKRD6	Q9Y2G4	727 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	R3HDM2	Q9Y2K5	976 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	NEU2	Q9Y3R4	380 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	PCDHB1	Q9Y5F3	818 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	HEBP2	Q9Y5Z4	205 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	MAD1L1	Q9Y6D9	718 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	CSNK1G3	Q9Y6M4	447 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	TECTA	O75443	2155 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	UNC80	Q8N2C7	3258 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	FANCM	Q8IYD8	2048 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	MYO18A	Q92614	2054 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	SPTY2D1-AS1	A0A0U1RR47	76 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	TCRBV7S2A1N4T	A0A589	114 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	ZNF839	A8K0R7	811 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234		E5RI56	91 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	TMX2-CTNND1	H3BSU7	103 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	TPP1	O14773	563 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	MUSK	O15146	869 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	TTI1	O43156	1089 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	NUAK1	O60285	661 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	DLX3	O60479	287 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	NPHS1	O60500	1241 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	NDUFS3	O75489	264 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	CLDN7	O95471	211 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	IGHV4-34	P06331	123 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	IVL	P07476	585 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	ANXA6	P08133	673 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	MMP2	P08253	660 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	PDHA1	P08559	390 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	FAM153B	P0C7A2	387 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	BMP7	P18075	431 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	OGN	P20774	298 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	NDUFS1	P28331	727 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	ATP5D	P30049	168 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	GK	P32189	559 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	MC4R	P32245	332 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	ADRA1A	P35348	466 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	TRIM23	P36406	574 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	PTGER3	P43115	390 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	GRK6	P43250	576 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	RXRG	P48443	463 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	NEK2	P51955	445 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	LIMK1	P53667	647 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	ITGA8	P53708	1063 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	SLC12A2	P55011	1212 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	CORO7	P57737	925 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	SESN2	P58004	480 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	LINC00310	P59036	64 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	CDK3	Q00526	305 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	NHLH1	Q02575	133 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	GUCY2D	Q02846	1103 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	C2orf54	Q08AI8	447 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	TCF15	Q12870	199 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	NFATC2	Q13469	925 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	PDE1C	Q14123	709 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	KRT33B	Q14525	404 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PUM2-205	ENST00000420234	KCNJ11	Q14654	390 aa		4.63	□□□□□ -1.67

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.2 ms